|
Name : Halha_1546 (Halha_1546) Accession : YP_007315578.1 Strain : Halobacteroides halobius DSM 5150 Genome accession: NC_019978 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycosidase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1547514 - 1549202 bp Length : 1689 bp Strand : - Note : PFAM: Alpha amylase, catalytic domain DNA sequence : ATGGATAAAAAGTGGTGGAAAGAGGGAGTAGTTTATCAAATTTATCCCAGGAGTTTTAATGATTCAAATGGAGATGGAAT TGGTGATTTACAAGGAATTATAGAAAAGGTTGATTATTTAGACAAATTAGGGATTGATGTGGTTTGGTTAAGTCCAGTTT ATGATTCTCCTAATGATGATAATGGATATGATATTAGCCATTATCAAAAAATCATGGATGAATTTGGTACAATGGAAGAT TGGGAAGAACTCTTAGAAGCACTTCATACTAAAGGGATTAAGTTAATCATGGATTTAGTAGTCAATCATACTTCTGATGA ACATAATTGGTTTGTTAAATCAAGAAAATCTAAAGATAACCCTTATCGAGACTATTATATTTGGAGAAAAGGAAGAACAG ATACTCCACCTAATAATTGGAGGTCTAATTTTGGTGGTTCTGCTTGGCAGTATGATAAAGTAACTGGTGAATATTATTTA CATTTATTTTCTAAAAAACAGCCTGATTTAAATTGGGAAAACCGAAATTTAAGAGAAGATATTTATAAGATGATGACTTG GTGGTTAGATAAAGGGATTGATGGTTTTAGAATGGATGTAATTAACTTTATTTCTAAAGCACCTGGTTTACCTGATGGAG ATTCTGAGGTTGGCCCAGGAGCTATGGGAAGTGAACATTATGTTGACGGGCCAAAAGTCCATCAATACTTAAAAGAAATG AATAAAGAGGTTCTTAGTAAGTATGATATTATGACAGTTGGAGAAATGCCTTTTGTAACAGCTGATGAAGGAGCAAAATA TGTAGCACCAGATAGAAACGAGTTAAATATGGTCTTTCAATTTGAACATGTACTCTTTGATGAAGGTTCTAAAGGTAGAT TAGGTAAACCTCGAGATTGGAAATTAACTGATCTAAAGAAAATTTTGCATAAGTGGCAAGTTAAATTACAAGAAGAGAAT GGCTGGAATAGCCTTTATTTAAACAATCATGATCAACCTAGAATGGTCTCTCGCTTTGGAGATGATAAAGAATATCGGGT TGAATCGGCTAAAATGTTAGCTACATTGCTACATACTTTACAAGGAACTCCTTATATTTATCAAGGAGAGGAAATTGGAA TGACTAATTTTCCTTTTGAGAGTATAGATGATATTCGTGATATTGATACTCTAAATAAGTTACAAGAAGAGCAAAAGAAA GGGAATATTGATGATCTCAATGAGATGATGGATGTTGTAAGGTATTGGAGTAGAGATAATGCTCGCACACCAATTCAGTG GGATAATAGTCAACATGCTGGGTTTACTACTGGTACCCCTTGGATTAAAGTTAATCCTAATTTTAAAGAGGTTAATGTAA AAAAGGCACTAAATAATTCAGAGTCTATCTTTTATTATTATCAAGATCTAATTAGCTTAAGAAAAGAGGAACCAATAATT GTGTATGGTGATTATCAACTTCTTTTAGAAGATGATGAAAATATTTATGCTTATCTAAGAGAGTTAGAGGGAGAGAAATT ATTAGTTATACTTAATTTCTTTGCTGAAAAACCAGAATTTAAATTACCAGATGATATATCTTTTCAAGAACAAGAATTAC TAATTAGTAATTATGATGTAAGTAAAGAGGAAGGAATTGATAAAATTAACCTACAACCTTATGAAGCGAGGGTTTATAAG TTAAAATAA Protein sequence : MDKKWWKEGVVYQIYPRSFNDSNGDGIGDLQGIIEKVDYLDKLGIDVVWLSPVYDSPNDDNGYDISHYQKIMDEFGTMED WEELLEALHTKGIKLIMDLVVNHTSDEHNWFVKSRKSKDNPYRDYYIWRKGRTDTPPNNWRSNFGGSAWQYDKVTGEYYL HLFSKKQPDLNWENRNLREDIYKMMTWWLDKGIDGFRMDVINFISKAPGLPDGDSEVGPGAMGSEHYVDGPKVHQYLKEM NKEVLSKYDIMTVGEMPFVTADEGAKYVAPDRNELNMVFQFEHVLFDEGSKGRLGKPRDWKLTDLKKILHKWQVKLQEEN GWNSLYLNNHDQPRMVSRFGDDKEYRVESAKMLATLLHTLQGTPYIYQGEEIGMTNFPFESIDDIRDIDTLNKLQEEQKK GNIDDLNEMMDVVRYWSRDNARTPIQWDNSQHAGFTTGTPWIKVNPNFKEVNVKKALNNSESIFYYYQDLISLRKEEPII VYGDYQLLLEDDENIYAYLRELEGEKLLVILNFFAEKPEFKLPDDISFQEQELLISNYDVSKEEGIDKINLQPYEARVYK LK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 4e-153 | 58 |
