Name : Halha_0123 (Halha_0123) Accession : YP_007314236.1 Strain : Halobacteroides halobius DSM 5150 Genome accession: NC_019978 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transcriptional accessory protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 128719 - 130872 bp Length : 2154 bp Strand : + Note : PFAM: Tex-like protein N-terminal domain; S1 RNA binding domain DNA sequence : ATGAATTTTAATATAGTAAAGCAACTAGCTACTGATCTTAATTTAGCAATTGGACAAGTTAAGAAAACAATTAAGTTACT AGATGAAGGGAATACTATACCATTTATAGCTCGTTATCGTAAAGAAGCAACGGGCCGATTGACTGAGGATAAGTTACGTG AATTAGAGGAAAGGCTAGATTACTTAAGAAGGTTACAAGCTAAAAAGAAGAAGGTAATTACAGCAATCACAGAACAAGGG AAGTTAACGGTTCAGCTAAAAGAAGAGATCAATGCTGCGACTAGTCTACAAGATGTAAAAGACTTGTATCGTCCTTATAA ACAAAGGCAAAAGACTAGAGCTGCCAAAGCTAAAGAGAAGGGATTAGAGCCTTTAGCTGATTTGTTTTTAGCTCAAGATA TAACCACAGGTTCCGTTGTAGAAAGGTGTCAAGAGTTTATAGATCCTAAACAGGAGTTAGAGGATATAGCTAGTATATTA CAAGGGGTTAAAGATATTATTGCTCAGCATGTAGCTGATCAACCTAAAAGTAGAAAATTGGCCCGAGAGATTACTTTTGA TAAGGGGAAATTAGTTGTTAAGGGTAAAGTTGATGAAATAACAGAGTATCAAACTTATTATGAGTTTGAAGAAGAAATAG GGAAGTTAGCGCCTTATCAAATCTTAGCAATTAATCGTGGGGAGCATGAAGATATTCTTAAGGTTAAGGTAGTTACTTTA AAAGAGCAGATTATAAATAACTTAAAAGCTGAATTTATTACTGATAAATCTATTTTTAAGGAAGTATTAGAAGAAGCAAT AGATGATGCTTATCATCGCTTATTAGCTCCGGCTATTGCTAGAGAGGTAAGAAGTTATTTAAAAGAGGAAGCAGAAGAAC ATGCAATTGATGTATTTGCTAAAAATTTAAGAAATTTATTAATGCAGCCTCCATTAATTGATAAAAAGGTTTTAGCAATT GACCCCGCCTTTAGAACCGGGTGTAAGATAGCAGTTTTAGATAAAGCAGGACAATTGTTAAAGACTACTAATATTTATCC TCATGAGCCACAAAATAAATGGCAAGTTGCTAAAGAAAAGTTAATTGATTTAATAACTGCTTATAATCTGGATGTAGTAG CTATTGGGAATGGGACTGCTTGTCGAGAAACAGAAACTTTAGTTTCAGAAGTGATTGCAGAGTCACTTCCGAAATTAAGA TATGTGATAGTTAATGAAGATGGGGCTTCTGTTTATTCAGCATCCCCTTTAGCCAGGGAGGAATTTCCTAAGTTAGATGT ATCACTAAGGGGAGCCATTTCCATTGGCAGAAGATTACAGGATCCTTTAGCTGAATTAGTCAAGATTAATCCTAAGCACT TAGGAGTAGGCTTATACCAGCATGATTTGAATCAGAGTAATTTAGAAGAGGCCTTAGAGAAGGTAGTAGAATCAGTTGTA AATTATGTAGGTGTTGATTTAAATACAGCTTCTAGTGCTTTACTAGAGCATATAGCGGGCATTACTTCTGCAGTAGCAGA TAAAATTGTTTCATACAGGCATGATAAAGGGGAGTTTACTACACGTCAAGAATTAAAGAATGTTTATGGAATTGGCCCTA ATAGATTTACTCAAGCTGCTGGTTTCTTGAGAATTAAAGCTGGAGATAATCCGTTAGATCAAACTGCAATTCATCCAGAG TCTTATCAAGTAGCACAAAAGTTATTAGCTAAAATAGGCTTTAATGCTAGCGATTTGTTTAATCAGGAGCAAAGATTAGA ATTGCGGGAAAAGATAAAGCAGGTTGATTTAAATGATTTTGTTTCACAATTAGAGGTTGGTTTAGCAACTTTACAGGATA TTAAAGAAGCTTTATTAAAACCTGGTCGTGACCCTAGAGAAGAAGTTTCACAGTCTATTTTTAAACGAAGTATTTTAAAG TTAGAAGATTTGGAAATAGGAATGATTTTAACAGGTAAGGTTAGTAATGTAGTCGATTTTGGAGCATTTGTTGATATTGG TGTTAAGGAAGATGGTTTAGTACATATTTCAGAGCTAAGCTCTGATTTTGTAAAAGACCCGTTAGAAGTAGTAGCAGTTG GTCAGACTGTTAAAGTTAAGGTATTGGAGATAAACCAGGTTAAAGGACAAATATCTTTAACAATGGTTCTGTAA Protein sequence : MNFNIVKQLATDLNLAIGQVKKTIKLLDEGNTIPFIARYRKEATGRLTEDKLRELEERLDYLRRLQAKKKKVITAITEQG KLTVQLKEEINAATSLQDVKDLYRPYKQRQKTRAAKAKEKGLEPLADLFLAQDITTGSVVERCQEFIDPKQELEDIASIL QGVKDIIAQHVADQPKSRKLAREITFDKGKLVVKGKVDEITEYQTYYEFEEEIGKLAPYQILAINRGEHEDILKVKVVTL KEQIINNLKAEFITDKSIFKEVLEEAIDDAYHRLLAPAIAREVRSYLKEEAEEHAIDVFAKNLRNLLMQPPLIDKKVLAI DPAFRTGCKIAVLDKAGQLLKTTNIYPHEPQNKWQVAKEKLIDLITAYNLDVVAIGNGTACRETETLVSEVIAESLPKLR YVIVNEDGASVYSASPLAREEFPKLDVSLRGAISIGRRLQDPLAELVKINPKHLGVGLYQHDLNQSNLEEALEKVVESVV NYVGVDLNTASSALLEHIAGITSAVADKIVSYRHDKGEFTTRQELKNVYGIGPNRFTQAAGFLRIKAGDNPLDQTAIHPE SYQVAQKLLAKIGFNASDLFNQEQRLELREKIKQVDLNDFVSQLEVGLATLQDIKEALLKPGRDPREEVSQSIFKRSILK LEDLEIGMILTGKVSNVVDFGAFVDIGVKEDGLVHISELSSDFVKDPLEVVAVGQTVKVKVLEINQVKGQISLTMVL |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 7e-111 | 43 |