Gene Information

Name : Halha_1214 (Halha_1214)
Accession : YP_007315254.1
Strain : Halobacteroides halobius DSM 5150
Genome accession: NC_019978
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : putative permease
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1224182 - 1225483 bp
Length : 1302 bp
Strand : +
Note : PFAM: Na+/H+ antiporter family

DNA sequence :
ATGAATCCAGTATTAATATCAGTATTAACAATGATTATATTAAGTTTAGCTAATTTGAATGTTATTTTAGCTTTATTGGT
TGCAGCAATTGTAGGAGGAGTAACGGGTGGATTAACTATAACTAAAACAATGAATACTTTAATTGAAGGAATGGGGGCCA
ATACAGACATAGCTTTGAGTTATATTCTATTAGGAGCACTAGCAGTTGCAGTCCAACAGACTGGAGTTGTATCTTTATTG
AGTAATAAATTAAATAAAGTTGTGGGAAAAAGAAGGAAGTTTTTTATATTATCTATTGCAGCTTTTGCTTGTTTATCGCA
AAATTTAATTCCAGTTCATATTGCTTTTATTCCTATTTTGATTCCACCATTATTGAAACTATTTAATAAGTTAAAGATTG
ATAGAAGAGCAGTAGCTTCCGCATTAACTTTTGGTCTCCAGGCACCTTATATGGCAATTCCAGCCGGATTTGGGCTTATT
TTTCATAAGATTATTAGAGATCAAATGGCTGCTAATGGAATGAAGGTTAATTTAAACCAAATTGCTAGTGTAATTTGGAT
ACCTGTATTAGGAATGGCAATTGGCTTATTAGTAGCAATCTTTGTAACTTATAATAATAAACGAGAATATAACTTTAATT
TAGCTCAACAGCAAGTAGCAGCTACTAGTGAAGAGGTAACTAGTTGGAGCTTAAAACATACTCTTGCTTTAGTAGCATTA
GCTACGGCGTTAATTATCCAGCTAACTATTAATTCTTTACCACTAGGAGCATTAGTTGGATTAGTTATTATGGTTAGCTC
AGGTAGTATCAAGTGGGAAGAATTAGATGATGTAGTTAAAGCAGGAGTCAATATGATGGGAGTTATTGCTTTTGTAATGT
TAGTTGCAGCTGGATATGGCGATGTAATTAGGGCTACTGGAGGAGTAGAGACTATTGTTCAGTCAGTAACTACTTTAATT
GGTGGTAGTCAAGTATTAGGAGCATTACTTATGTTAGCAGTTGGCTTGGTAGTAACAATGGGAATTGGAACATCATTTGG
AACAATCCCTATTATTGCAGTTATTTATGTTCCTTTAGCTCAATCACTAGGTTTTAGTCCTTTAGCTACAATTATCTTAG
TTGGTACTGCTGGAGCATTAGGAGATGCTGGTTCCCCTGCTTCGGATAGTACTTTAGGGCCCACTTCTGGATTAAATGCT
GATGGACAACATGATCATATTTGGGATACTTGTGTGCCAACTTTCTTACACTATAATATTCCCTTGATTTTATTTGCTTG
GTTAGGAGCTTTAGTTCTATAA

Protein sequence :
MNPVLISVLTMIILSLANLNVILALLVAAIVGGVTGGLTITKTMNTLIEGMGANTDIALSYILLGALAVAVQQTGVVSLL
SNKLNKVVGKRRKFFILSIAAFACLSQNLIPVHIAFIPILIPPLLKLFNKLKIDRRAVASALTFGLQAPYMAIPAGFGLI
FHKIIRDQMAANGMKVNLNQIASVIWIPVLGMAIGLLVAIFVTYNNKREYNFNLAQQQVAATSEEVTSWSLKHTLALVAL
ATALIIQLTINSLPLGALVGLVIMVSSGSIKWEELDDVVKAGVNMMGVIAFVMLVAAGYGDVIRATGGVETIVQSVTTLI
GGSQVLGALLMLAVGLVVTMGIGTSFGTIPIIAVIYVPLAQSLGFSPLATIILVGTAGALGDAGSPASDSTLGPTSGLNA
DGQHDHIWDTCVPTFLHYNIPLILFAWLGALVL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
CpI19_1481 YP_005685924.1 Na+/H+ antiporter NhaC Not tested PiCp 5 Protein 5e-59 46
Cp1002_1472 YP_005681739.1 Na+/H+ antiporter NhaC Not tested PiCp 5 Protein 5e-59 46
cpfrc_01481 YP_003783881.1 hypothetical protein Not tested PiCp 5 Protein 5e-59 46
CpC231_1474 YP_005683838.1 Na+/H+ antiporter NhaC Not tested PiCp 5 Protein 5e-59 46
BJAB07104_00352 YP_008207817.1 putative permease Not tested AbaR25 Protein 5e-61 44
BJAB0868_00356 YP_008211682.1 putative permease Not tested AbaR26 Protein 5e-61 44