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Name : Halha_0113 (Halha_0113) Accession : YP_007314226.1 Strain : Halobacteroides halobius DSM 5150 Genome accession: NC_019978 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycosidase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 119081 - 120760 bp Length : 1680 bp Strand : + Note : PFAM: Alpha amylase, catalytic domain DNA sequence : ATGAATAAAAAATGGTGGAAGGAAGCAGTAGTCTATCAAATTTATCCAAGAAGTTTTAATGATTCAAATGGAGATGGGAT TGGTGATTTAAGAGGAGTTATTGAGAAAGTAGATTATTTAGATAAGTTAGGCATAGATGTAGTCTGGTTAAATCCAGTCT ATGAATCACCTAATGATGATAATGGTTATGATATTAGTGATTATCAAGCAATTATGGATGAGTTTGGTACAATGATGGAC TGGGAAGAGCTATTAGAAGCACTTCATGATAGAGGAATTAAATTAATTATGGATTTAGTAGTTAATCATACTTCTGATGA ACATAAATGGTTTGTTGAGTCTCGCAAATCAAAAGACAATCTTTACCGAGATTATTATATTTGGCGTCCTGGAGAAGATG GTGCCCCGCCTAATAATTGGCGTTCACATTTTAGTGGCTCAGCTTGGGACTATGATGAACAGACAGATGAATATTATTTA CATCTATTTAGTAGCAAACAGCCTGATCTAAACTGGAAAAATCCTAATTTAAGACAAGAAATATACAAGATGATGACTTG GTGGTTAGAAAAAGGAATTGATGGTTTTCGAATGGATGTTATTAATATGATTTCTAAAGTAGAAGGTTTACCAGATGGAG AGGAAGTAGGAGAAGATGGTTATGCTTCTGGCGGAGAATATTTCTTAAATGGGCCAAAAGTTCATGATTATTTACAGGAG ATGAACCAAGAGGTTTTATCTAAATATGACATTATGACAGTAGGAGAGACTCCAGGTGTAACGCCTAAACAAGGGATTAA ATATGTAGCAAAAGAGCGCAAGGAGCTTGATATGGTCTTTCAGTTTGAACTAATGGATATTGATTCTGGTGAAGGTGGCA AATGGGATCTAGCAGATTGGAAGTTAACTGAACTTAAGAATATTATAAGTAAATGGCAGATTGGATTAGAAAATCAAGGT TGGAATAGTTTGTATTTAAATAATCATGATCAACCACGACCAGTCTCTCGTTTTGGAGATGATGATAAGTATCGAGTTGA ATCTGCTAAAATGTTGGCTACTATGAATCATACTTTACAAGGAACTCCTTATATTTATCAAGGGGAAGAGATTGGAATGA CTAATGTAGAGTTTGATTCTATTACTGATTATGAAGATATAGAAACTTTAAATATGTACCAAGAGAGAGTAGTTGAAGGT AATAAAGACCGAGAAGAAGTAATGGAAGCAATCTATGCTAAAGGTAGAGATAATGCTAGAACGCCAATGCACTGGGATAA TAGTGAAAACGCTGGATTTACTGATGGTAAGCCCTGGATTAAACTTAATCCTAATTATAAAGAGATAAATGTAGAGAATG CTTTGGATAATCCAGATTCTATCTTTTATTATTATCAAAAGTTAATTAAACTTAGAAAAGAGAACCCGGTATTTGTTTAT GGTAATTATCAATTATTATTAGAAGATGATGAGAATATTTATGCTTATTTAAGAAATTATAATGGTCAACGATTGTTAGT AATCCTTAATTTCTTTGCAAAAGAAGTAAAATTTGAGTTATCAGATAATATTAATTTTGCTAGTAAGGAATTATTAATTA GTAATTATGAAGTTAATGAAGAACAAATTTCAGAAATAGACCTCAGACCTTATGAAGCTAGAGTTTATAAATTAAGTTAA Protein sequence : MNKKWWKEAVVYQIYPRSFNDSNGDGIGDLRGVIEKVDYLDKLGIDVVWLNPVYESPNDDNGYDISDYQAIMDEFGTMMD WEELLEALHDRGIKLIMDLVVNHTSDEHKWFVESRKSKDNLYRDYYIWRPGEDGAPPNNWRSHFSGSAWDYDEQTDEYYL HLFSSKQPDLNWKNPNLRQEIYKMMTWWLEKGIDGFRMDVINMISKVEGLPDGEEVGEDGYASGGEYFLNGPKVHDYLQE MNQEVLSKYDIMTVGETPGVTPKQGIKYVAKERKELDMVFQFELMDIDSGEGGKWDLADWKLTELKNIISKWQIGLENQG WNSLYLNNHDQPRPVSRFGDDDKYRVESAKMLATMNHTLQGTPYIYQGEEIGMTNVEFDSITDYEDIETLNMYQERVVEG NKDREEVMEAIYAKGRDNARTPMHWDNSENAGFTDGKPWIKLNPNYKEINVENALDNPDSIFYYYQKLIKLRKENPVFVY GNYQLLLEDDENIYAYLRNYNGQRLLVILNFFAKEVKFELSDNINFASKELLISNYEVNEEQISEIDLRPYEARVYKLS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 4e-154 | 58 |
