Gene Information

Name : Thethe_02527 (Thethe_02527)
Accession : YP_007299790.1
Strain : Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum M0795
Genome accession: NC_019970
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2495017 - 2496363 bp
Length : 1347 bp
Strand : -
Note : PFAM: PTS system sugar-specific permease component

DNA sequence :
ATGCAATTTATAGTTAGCTTATTTAATCAACCTTCAATAATGGCAGGCTTAATGGCGTTAATAGGATTAATTGCATTAAA
AAAGCCTATACAGCAAATAATCAGTGGTACATTAAAAACAATTATAGGATTTATCGTCTTGCAAGTTGGTGCAGGCGCAA
TTTCAAGCACATTGGGTGTTTTAGGGCCCATATTTCAGGATGCTTTTCATATGCAAGGCGTAATACCAACAAATGAAGCA
GTAATTGGTTTAGCACAAAAAATGTTTGGTTCAGAAATGGCGTTAATGATGCTATTTGGTTTTCTAGTAAATCTTATTAT
AGCAAGATTCACACCTCTTAAATATGTATTTTTAACAGGTCATCATATATTATTTATGTCAGGACTTTTAGCAGCAGTAT
TAAGTACAGCTGGATTTAAAGGTTCAGAATTAGTTATAGTTGGTTCTCTTATATTAGGGTCAACAATGGTATTGACTCCG
GCATTGGTGCAACCTTATTATAGAAAAGTTACAGGTAATGATAGCGTTGCAATGGGTCATTATAATGCATTAACTTATGT
AATTTCTGCATATATAGGCAAGATAACGGGTAATAAGGAGCATTCCACTGAAGACATAAAAGTACCGCAGGGATTAAGCT
TTTTTAGAGATAATACTTTATCAACGGCTATTGTAATGTCAATTATTTTTCTTATAACAATGTATTCAGCCAATAGAAGT
GTTGTATTAAAGGCATCAGGTGGTAGCGATGTTTTTATATTTGCAATAACTCAGGCATTGACATTTACAGCAGGTTTTGT
AGTGGTTCTACAAGGTGTTAGAATGATGCTTGCTGAAATTGTTCCTGCATTCAAAGGTATTGCTGAAAAGATAGTTCCTG
ATGCTATACCTGCACTTGATTGTCCTGTAATTTTCCCATTTGCTCCGAATGCAGTAATTATTGGGTTTTTATCATCACTA
GTTGGTGGCATAATAATGTTCCTCATATTGCCCCATACTGGCTTGGCAGTTATTATACCTGGCTTGATTCCTTTGTTCTT
TGTCGGTGCAGCAGCAGGAGTATTAACTAATGCAACAGGTGGCCTAAGAGGAACAATTATAGGCGGTATTATAAATGGTG
CAATTTTAACATTATTGCCGGCATTGTTATTGCCTGTAATGGGCCAGCTTGGCTTTGCAAATTCTACTTTTGGTGATGCG
GACTTTGTATTTACGGGAATCGTTGTAGGATATCTGGCCAAGTTATTTACAAAAACAGGAATATATGCACTCGTTGCTAT
ACTAATTCTAATTTTTATTATAGTTTCAATAGTTATGAAGCCTAAAAAACTAGAAGTTAATAAATAA

Protein sequence :
MQFIVSLFNQPSIMAGLMALIGLIALKKPIQQIISGTLKTIIGFIVLQVGAGAISSTLGVLGPIFQDAFHMQGVIPTNEA
VIGLAQKMFGSEMALMMLFGFLVNLIIARFTPLKYVFLTGHHILFMSGLLAAVLSTAGFKGSELVIVGSLILGSTMVLTP
ALVQPYYRKVTGNDSVAMGHYNALTYVISAYIGKITGNKEHSTEDIKVPQGLSFFRDNTLSTAIVMSIIFLITMYSANRS
VVLKASGGSDVFIFAITQALTFTAGFVVVLQGVRMMLAEIVPAFKGIAEKIVPDAIPALDCPVIFPFAPNAVIIGFLSSL
VGGIIMFLILPHTGLAVIIPGLIPLFFVGAAAGVLTNATGGLRGTIIGGIINGAILTLLPALLLPVMGQLGFANSTFGDA
DFVFTGIVVGYLAKLFTKTGIYALVAILILIFIIVSIVMKPKKLEVNK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
ORF8 AAK27335.1 unknown Not tested PAI-I AL862 Protein 2e-90 55
unnamed CAC39291.1 hypothetical protein Not tested LPA Protein 2e-90 55
vpeC ADD91725.1 putative PTS system-specific IIC component VpeC Virulence PAI-I AL862 Protein 2e-90 55