|
Name : MCYN0873 (MCYN_0873) Accession : YP_007258707.1 Strain : Mycoplasma cynos C142 Genome accession: NC_019949 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 6.1.1.11 Position : 979702 - 980970 bp Length : 1269 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTAGATTTAAAATTCGTTTTAATGAATCAGGAATATGTTAGAAAATCACTCTCTAATCGAGGTTTTGATATAGACAT AGTTAATGAGTTGTTTGAAAAAGCTCAAAACCGTGGTCGGTTAATGTTTGATGCTCAATCTAAAAAAAGTGAACTAACAA GACTTTCTAAATTATTTGCTCATTACAAAAATGAACCAAGAGCCTTAATTAATCTTAAAAATGAAATCGATCAAGTAAAA GCAGCTGAAACAAAATTAGCAGCTGATGTAGAAACATTAAATAAAAAAATTAATGATCTTTTGGTTATAATACCTAATTT ACCACTAGATAATGTACCAATCGGTGAAAATGAAGACCAAAATGTTGTTTTAGAAATGAATGATAGCATTGGAAGAGGGT TAGTTAAAAATGTACTTCCACATTATGAAATAGCTAAAAGACTTGATATGATCGATATTGATAGGGCGGTTAAACTATCA GGTTCACGTTATGTGATATATAAAAACACAGGTGCTAAATTAGTAAGAGCATTAATTAATTTTATGTTGGACTTACATCA TGAAAAAGGATATCAAGAATTTTGTACACCAGTTATTGTAAATGAAAATATTTTGTTTGGTACTGGACAATTACCTAAAT TTAAAGATGATTTGTATAAATTAGAAAATTCAAATCAATATTTAATTCCTACCGCCGAAGTTACTTTAACAAATATTCAT AACAATGAAATTATTGACTTATCAAAACCTTTTAAAGCGACTGCATATACAGAATGTTTCAGATCAGAAGCTGGTAGTTC TGGTAAAGATACAAGGGGTTTGATTCGTCAACATCAATTCAAGAAAATAGAATTAGTAAAAATAACAAATGAAGAAACAG CAATGTCAGAATTTCGTTTAATGCTAAATGATGCTAAGGAAGTTTTAGAAAAACTTCAAATACCTTATCGTTCAGTGCAA TTATGTACTGGTGATTTAGGTTTTTCAGCAAGAACCACAATTGATTTAGAGCTTTGATTACCGTCTGAACAACGTTTTAG AGAAACTTCAAGTGTTAGTTATATGGGTGATTTTCAATCAAGAAGAGCAATGATAAGATATAAAGATTCAAATGGCGAAA CCAAATATGCACACACTATGAATGGATCAGGTCTAGCGGTTGATAGGGTAATTGCTGCATTATTGGAAATATATCAAAAC GAAGATGGAACAATAACTATTCCAGAAGTGTTAATTCCTTATATGGGCGGAATGAAGGTTATTAAATAA Protein sequence : MLDLKFVLMNQEYVRKSLSNRGFDIDIVNELFEKAQNRGRLMFDAQSKKSELTRLSKLFAHYKNEPRALINLKNEIDQVK AAETKLAADVETLNKKINDLLVIIPNLPLDNVPIGENEDQNVVLEMNDSIGRGLVKNVLPHYEIAKRLDMIDIDRAVKLS GSRYVIYKNTGAKLVRALINFMLDLHHEKGYQEFCTPVIVNENILFGTGQLPKFKDDLYKLENSNQYLIPTAEVTLTNIH NNEIIDLSKPFKATAYTECFRSEAGSSGKDTRGLIRQHQFKKIELVKITNEETAMSEFRLMLNDAKEVLEKLQIPYRSVQ LCTGDLGFSARTTIDLELWLPSEQRFRETSSVSYMGDFQSRRAMIRYKDSNGETKYAHTMNGSGLAVDRVIAALLEIYQN EDGTITIPEVLIPYMGGMKVIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 1e-77 | 45 |
