Gene Information

Name : MCYN0851 (MCYN_0851)
Accession : YP_007258685.1
Strain : Mycoplasma cynos C142
Genome accession: NC_019949
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : Lysyl-tRNA synthetase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 6.1.1.6
Position : 955315 - 956781 bp
Length : 1467 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGAAAAATATACAGAACAAGAAATAATTAGACGAAATAAACTTACTACATATAGTGAATTAGGTATCGAACCTTTTGC
CAAGGCTTATGGGCTTAAAGAATTGAAATATTCTGATGAAATAGAAAATGAATATCAAGCTTTTTCTAAAGAAGAATTAC
ATAAAAAAAACTTTGAAGTTGCATTAACAGGAAGAATTATAACAATTCGTGGACCATTTATTTTAATTCAGGATTATCAT
TCTAAGATTCAACTTTATTTCAATAAAAAAGAACACGAAGAATTAATAAAATTAATAAACACTCTTGATTTAGGTGATAT
TGTTTATGCTGAGGGTACTGTAATGAAAACTAATACAGGTGCAATTAGTGTAAAAATTACTCAGCTAAAACTTTTAACTA
AGTCGCTAAAGCCACTTCCAGATAAATTTCATGGATTAGCCGATATTGAAGAAATTTATAGACATAGATATATAGATTTA
ATAACTAACGAAGAGTCTCGTAATGTTTTTTGAACTCGTTCAAAAATCATAACAGAGATAAGAAGATACTTTGATGATCT
TGAATATATGGAAGTTGAAACACCATTTTTACATGATTATATTTCAGGAGCTGCAGCTAAACCGTTTAAAACTCATCACA
ATGCACTTAATCAAGATTTTGTTTTAAGAATTGCAACTGAGATTCCACTTAAAAAACTTTTAGTAGGTGGAATAGACAGA
GTTTATGAGATCGGAAGAATCTTTAGAAATGAAGGGATTGATACAACACATAATCCAGAGTTTACTTCAATTGAATTTTA
TGAAGCTTATTCTAATATTGAAGGAATGATGAACCGTACTGAAGGTTTATTTAAACAATTAGCTAAAAAATTAAATAAAT
CTACTGTAATGAATAAAGGTGTTTTAATTGATTTAGAAAAACCATTTGCTAGAATTGATATGGTTGATGCAGTTTCAAAA
GCGACAGGATATGATTTTAGAACCATAAGTTTTGAAAAAGCAAAAGAAATCGCATTAGCAAATGGGGCTAAAATCCAAAA
ATTCTTTAAATTAGGTCATATAATTAATGAATTATTTGAATTATTAATTGAAAAAACTTTAATTCAACCCACATTTGTTT
ATGGTCATCCGATTGAAATTTCTCCATTAACTGCTAAAACTACTGATCCAAGATTTACAGAAAGAGCTGAATTATTTATT
AATACTAAAGAATATGCAAATATGTATACAGAACTTTCAGATCCAATTGATCAATTAGAAAGATTTAAAAGTCAGCTTGA
TGAAAAAGAAAATGGAAATGATGAAGCTAGTGATATAGATTGAGATTTTGTTGATGCCCTTGAATACGGGATGCCGCCGG
CTGGTGGTTGTGGAATCGGAATTGACCGTCTTACAATGTTGTTAACAGAAAAAGAATCAATTCGTGATGTATTACTATTC
CCAACAATGAAGAGAAAAAAGATTTAG

Protein sequence :
MEKYTEQEIIRRNKLTTYSELGIEPFAKAYGLKELKYSDEIENEYQAFSKEELHKKNFEVALTGRIITIRGPFILIQDYH
SKIQLYFNKKEHEELIKLINTLDLGDIVYAEGTVMKTNTGAISVKITQLKLLTKSLKPLPDKFHGLADIEEIYRHRYIDL
ITNEESRNVFWTRSKIITEIRRYFDDLEYMEVETPFLHDYISGAAAKPFKTHHNALNQDFVLRIATEIPLKKLLVGGIDR
VYEIGRIFRNEGIDTTHNPEFTSIEFYEAYSNIEGMMNRTEGLFKQLAKKLNKSTVMNKGVLIDLEKPFARIDMVDAVSK
ATGYDFRTISFEKAKEIALANGAKIQKFFKLGHIINELFELLIEKTLIQPTFVYGHPIEISPLTAKTTDPRFTERAELFI
NTKEYANMYTELSDPIDQLERFKSQLDEKENGNDEASDIDWDFVDALEYGMPPAGGCGIGIDRLTMLLTEKESIRDVLLF
PTMKRKKI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed CAD66193.1 putative lysil-tRNA synthetase LysU Not tested PAI III 536 Protein 2e-80 44

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
MCYN0851 YP_007258685.1 Lysyl-tRNA synthetase VFG1668 Protein 1e-80 44