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Name : BPP43_09615 (BPP43_09615) Accession : YP_007235360.1 Strain : Brachyspira pilosicoli P43/6/78 Genome accession: NC_019908 Putative virulence/resistance : Virulence Product : PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2023765 - 2025036 bp Length : 1272 bp Strand : + Note : COG3037 Uncharacterized protein conserved in bacteria DNA sequence : ATGATTACAGGAATATTAAATTTTATAGTTTATGATTTATTAGGTACTAGTTCTATATTAGTTGGTTTTATAGCTATGTT TGGTCTTATCTTACAAAAGAAGAAATGGGATAAGGTTGTAATCGGTACTATAAAAACAATAGTTGGATTTATAATTTTTA GTGCTGGTTCTTCTTTGGCAACTAGTTCATTAAATTCTTTCCAAACTTTATTTACAAAAGCATTTAATTTGGAAGGAGTA TTACCTTTAGCTGAAGCTGTTACAGCATTGGCTCAAAATAAATTTGGACCTATAGTTGCTTTAATAATGGTTACCGGTTT TATAGCTAATTTAATAATAGCTAGATTAACTCCATTTAAATACATATTTTTAACAGGTCAGCACAATTTATATTTAGCAG CACTTTTAACTGTAATATTTAAAGCAAACGGTGTATCTGATGGTCTTACTATAGGATTGGGAGCTATTATATTAGGAGCT TCTGCAGCATTATTCCCTGCTATAGCACAAAGAGGTATGAAGAAAATTACTGGTGAAAATGAGATAGCTATGGGACACTA TGTTACATTAGCTTATGCTTTATCATCTTTCATAGGTTCTAAAGTTGGTAAACCAGAAGACAGTACTGAAAAATTAAAAT TACCTTCTTGGCTTATGATATTTAAAGATTATGTTGTTTCAGTAGCTTTATCTGTTGCAGTGTTCTATTATATATCAGCA TTTATGGCTGGTAAAGCAGAAGTTGAGGCTTTATCTGGAAATGTTAGCTGGATATTATTCCCATTTTTACAATCATTATC ATTTGCAGCTTCATTATTTATAATCATCACTGGTGTAAGAATGGTATTAGGTGAAATAGTTTCTGCATTTGTTGGTATTT CTGAAAAACTTATTCCTAATGCAAAACCTGCTTTAGACTGTCCTGTAGTATTCCAGTATGCTCCTACTGCTACTGTTATA GGATTCTTATCTGCTTATATAGGCGGTTTATTATGTATACCTGTATTTATAGCTTTAAAAACACCTGTAATTATACCTGT TGCTGTTCCTTATTTCTTCATAGGTGCTACTGCTGGTGTATTTGGTAATGCTACAGGCGGTTGGAAAGGTGCTATTGCTG GAGGATTTATCACTGGTATACTTATAGCTGTTGGACCTGCTTTAATATACCCTATAATGAGTTCTATAGGTTTAACAGGT ACTTCTTTCCCAGAAACAGACTTTGTTAGTGTTGGTTTAATATTAAATGCTATATTAAGCATATTCAATTAA Protein sequence : MITGILNFIVYDLLGTSSILVGFIAMFGLILQKKKWDKVVIGTIKTIVGFIIFSAGSSLATSSLNSFQTLFTKAFNLEGV LPLAEAVTALAQNKFGPIVALIMVTGFIANLIIARLTPFKYIFLTGQHNLYLAALLTVIFKANGVSDGLTIGLGAIILGA SAALFPAIAQRGMKKITGENEIAMGHYVTLAYALSSFIGSKVGKPEDSTEKLKLPSWLMIFKDYVVSVALSVAVFYYISA FMAGKAEVEALSGNVSWILFPFLQSLSFAASLFIIITGVRMVLGEIVSAFVGISEKLIPNAKPALDCPVVFQYAPTATVI GFLSAYIGGLLCIPVFIALKTPVIIPVAVPYFFIGATAGVFGNATGGWKGAIAGGFITGILIAVGPALIYPIMSSIGLTG TSFPETDFVSVGLILNAILSIFN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ORF8 | AAK27335.1 | unknown | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 9e-91 | 46 |
| unnamed | CAC39291.1 | hypothetical protein | Not tested | LPA | Protein | 6e-91 | 46 |
| vpeC | ADD91725.1 | putative PTS system-specific IIC component VpeC | Virulence | PAI-I AL862 | Protein | 6e-91 | 46 |
