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Name : B488_02820 (B488_02820) Accession : YP_007232530.1 Strain : Liberibacter crescens BT-1 Genome accession: NC_019907 Putative virulence/resistance : Virulence Product : ClpB protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 321168 - 323786 bp Length : 2619 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGATATAGCTAAATATTCAGAGCTTGTACGTAGTTATTTACAGACTTCTCAGACTTATGCTTTAGAACAAGGACATCA ACAACTTATTCCAGAACATATTTTGTATGTTATGCTTGAAGATTCTCAAGGAATGGCATCATTACTAATAGAACGTGCTG GTGGTGATATAAAAAAATTAAGCACTTGTAATAAGGCCATACTTTCTAAATTACCTAAAATTACAGGAAGTGACGTTCAG GTTTATATTTCTCAAAATTTAGTAACTCTTTTTTCCAAAGCGGAAGAAATTTCTAAAAAAGCTGGAGATAGTTTTGTAAC TGTTGAGAGGCTCTTGCTGGCGATGGCATCTCCAAAGAGTTCTTTAGCTCAATTGCTTAAAGATTCTGGAATAACCTTTG ATAATCTTAATAAAGTGATTAATGAGATAAGAAAAGGGCGTGTTGCGGATTCAGCTAATGCAGAAGAACGTTTTGATTCT TTAAAAAAATATGCAAGGGATCTCACAGTAGAAGCCAGGGAAGGAAAGCTTGATCCTGTAATAGGTCGTGATGATGAAAT ACGTCGTACGATTCAAGTTTTATCTAGAAGAACAAAGAATAATCCTGTCCTTATAGGAGAGCCTGGTGTTGGAAAAACTG CTATCGTTGAAGGTTTGGCGTTGCGTATTATTAATGGTGATGTCCCTGAAACTTTGAAAGATAAAAAATTGATGGCGCTA GATATGGGCGCTTTAATTGCAGGCACAAAAATGAGAGGAGAATTTGAGGAAAGATTAAAGGCTCTTCTTAATGAAATTCA GTCCGAGAATGGCGGTGTTATACTTTTTATTGACGAGATGCATACATTAGTTGGTGCTGGTAAGGCAGATGGTGCTATGG ATGCTTCTAATTTGCTTAAGCCTGCTTTAGCGCGTGGTGAGCTTCATTGTATCGGTGCTACAACATTAGATGAATATCGT AAGCATGTAGAAAAGGATCCGGCTCTTGCTCGGAGATTCCAATCTGTAATAGTTGATGAGCCTACTGTTGAAGATACGAT ATCTATTTTGCGAGGCCTTAAAGAGAGGTATGAGCAACATCATAAGGTTCGGATTTCAGATTCTTCTTTAGTTGCAGCAG CAACTTTGTCTAACCGTTATATTACCGATCGCTTTTTACCAGATAAAGCTATTGATTTGATGGATGAAGCTGCTTCTCGT GTTCGTATCCAGGTTGATTCTAAGCCTGAAAAACTCGATGAATTGGATCGTCGAATTATACAGCTTAAAATTGAAAAAGA GGCTTTAAAGAAGGAAAGGGATTCTTCTTCTGCAGATAGGCTTAACATTTTAGAAAAAGAGCTTGTTACTTTAGAAGAGC AAGCTCATATTTTAACGGTGCGTTGGCAAGCCGATAAGAGAAAGCTTGTTTATGCCGCTGATCTTAAAAAGCGTTTGGAA GCTATGCGTAATGAGCTAGCTATAGCTCAACGTAATGGGGAATTTCAGCGTGCTGGAGAGCTTTCTTATGGTTTGATACC AGAGTTGGAAAAAGAGTTAAAAGCAGCTGAATCAAAAGATAATGAGACGTCAGCTATGATTCAGGAGGTTGTAACAGCGG ATAATATTGCTAGCGTTGTTTCACGGTGGACAGGTATCCCTGTAGATAAGATGTTGGAAAGTGATCGTGCTAAATTTCTT AGTATGGAAGATGAACTTGCCAAGTCAGTAATTGGTCAAGATATCGCTGTTAAGGCCGTTTCAAATGCGGTACGTCGTTC TCGAGCTGGTTTGCAAGATCCTAATCGCCCTTTAGGGTCATTTATTTTTCTTGGTCCGACAGGTGTTGGTAAAACTGAAC TTACGAAGACTTTAGCAAAATTCATGTTTGATTCTGATTTGGCTATGGTTAGGATTGATATGTCTGAATATATGGAGAAG CATTCAGTAGCGCGTCTTATTGGTGCTCCTCCTGGTTATGTTGGGTATGAAGAAGGGGGATCATTAACTGAAGCTGTTCG TAGGCGTCCTTATCAAGTTATATTGTTTGATGAAATTGAAAAAGCCCATTCCGATGTATTTAATATTTTGCTTCAGGTGT TAGATGAAGGAAGGCTCACAGATGGCCAGGGTCGTACTGTGGATTTTCGTAATACAATGATTATTATGACCTCTAATTTG GGTGCAGAGTACTTAGTAGAGGCTAATGATGATGATATTGATCAAAAATTGCAAGATCAGGTAATGGAAGTGGTGCGATC TTCTTTTAGGCCTGAGTTTTTAAATCGTATTGATGAAATTATCTTGTTTCAGCGTTTGCGTAAGTCAGAAATAGGAAAAA TTGTAAACATTCAACTTAATAGGATTTTTTCTCTTCTTTCAGAGAGAAAGGTCTCCATACATTTAGATAGCCAAGTGATC GATTGGTTGTCTGAACGCGGCTATGACCCTGTTTATGGTGCTAGGCCTTTAAAAAGAATTATACAAAGATATGTTCAGGA TCCGTTAGCTGAAAAAATTCTATCTAATAGCATCCCGGATGGTGCATCTATTAAAGTTTCTGTAGGATCAGATCGGCTTA ATTTTCAAGTTTTCGATTCAACATATGAAAATTCTAAGGAGGAATTTTCAACAGCTTAG Protein sequence : MDIAKYSELVRSYLQTSQTYALEQGHQQLIPEHILYVMLEDSQGMASLLIERAGGDIKKLSTCNKAILSKLPKITGSDVQ VYISQNLVTLFSKAEEISKKAGDSFVTVERLLLAMASPKSSLAQLLKDSGITFDNLNKVINEIRKGRVADSANAEERFDS LKKYARDLTVEAREGKLDPVIGRDDEIRRTIQVLSRRTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLALRIINGDVPETLKDKKLMAL DMGALIAGTKMRGEFEERLKALLNEIQSENGGVILFIDEMHTLVGAGKADGAMDASNLLKPALARGELHCIGATTLDEYR KHVEKDPALARRFQSVIVDEPTVEDTISILRGLKERYEQHHKVRISDSSLVAAATLSNRYITDRFLPDKAIDLMDEAASR VRIQVDSKPEKLDELDRRIIQLKIEKEALKKERDSSSADRLNILEKELVTLEEQAHILTVRWQADKRKLVYAADLKKRLE AMRNELAIAQRNGEFQRAGELSYGLIPELEKELKAAESKDNETSAMIQEVVTADNIASVVSRWTGIPVDKMLESDRAKFL SMEDELAKSVIGQDIAVKAVSNAVRRSRAGLQDPNRPLGSFIFLGPTGVGKTELTKTLAKFMFDSDLAMVRIDMSEYMEK HSVARLIGAPPGYVGYEEGGSLTEAVRRRPYQVILFDEIEKAHSDVFNILLQVLDEGRLTDGQGRTVDFRNTMIIMTSNL GAEYLVEANDDDIDQKLQDQVMEVVRSSFRPEFLNRIDEIILFQRLRKSEIGKIVNIQLNRIFSLLSERKVSIHLDSQVI DWLSERGYDPVYGARPLKRIIQRYVQDPLAEKILSNSIPDGASIKVSVGSDRLNFQVFDSTYENSKEEFSTA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| STY0294 | NP_454876.1 | ClpB-like protein | Not tested | SPI-6 | Protein | 2e-111 | 42 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| B488_02820 | YP_007232530.1 | ClpB protein | VFG2076 | Protein | 1e-121 | 41 |
