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Name : join (B488_12190) Accession : YP_007233466.1 Strain : Liberibacter crescens BT-1 Genome accession: NC_019907 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.2.1.1 Position : 1332082 - 1334072 bp Length : 1991 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTTATCTTGAAAAACATAATAATATGGCTAATGCTATACGGTTATTATCAATAGAAGCGATAGAAAGGGTAAATTC TGGGCATCCAGGACTGCCAATGGGCGTAGCAGATATTGCTACTGTTCTTTTTACTCAATTTATGATTTTTGATCCTAAAA AGCCGTTGTGGCCAAATCGTGATCGATTTGTTTTATCAGCCGGTCATGGTTCTATGTTGCTTTATTCGTTGCTTTACCTA TTGGGTTATGAAGACATGACGATTGAGGACATAAAGAATTTTCGTACAATCAAATCGAAAGCAGCAGGACATCCTGAGTA TGGTCATGCTTCTGGTATTGAAACGACGACTGGTCCTCTGGGTCAAGGTCTTGCAAATGCTGTTGGAATGGCGATTGCTG AACGTAAATTACGAGATGAGTTTGGTAAAGAATTAATACATCACTATACATATGTAATTGCTGGTGATGGTTGTTTGATG GAAGGAATTAGTCATGAAGCTATTTCATTAGCGGGACATCTGCAACTTAATAAATTGATTGTTTTGTGGGATAATAATTC TATTTCTATTGATGGGCCCGTTTCTCTAGCAGATTCTACTGATCAGGGTGCACGATTTTGTGCTGCTGGTTGGAATGTGC TTGCAGTAAATGGACATAATGCTGAAGAGATTATATTGGCTTTAGAGAAAGCTCGTCTTTCTGATAAACCTACAATGATT GATTGTAAAACCATCATTGGTTTTGGTGCACCTTCTAAAGCAGGAACTAATAAGGTTCATGGTTCTCCACTTGGAAAAGA GGAGTTAAGTTCTACTCGTAAAGTATTGCATTGGGATGCAGAGCCCTTTTGTATTCCCGATGATATTCTTGAGGAATGGC GTTTCTCTGGTTCACGCTCTACTCATATACGTGAAGAATGGGAAAAGAATCTTTATTCTGTCAGTTCAGAGATTCGTTCT GAATTTATGCGTCGCTTTGCAGGTGATCTTCCTGATACTTTAGATAGAGAAATTGATAAATATAAAAGGAAGTTATTTGA GATCAGGCCAGAGATTCCTACGCGTAAGGCATCAGAAAACGCATTAGAAATAATAAATGATTGTCTTCCTGAGACCATAG GAGGATCAGCAGATCTCACAGGTTCTAATAATACTAAAACCAGTCAAACAAGATCTATTACAGCATGTGATTTTTCTGGG CGTTATTTGCATTATGGTGTGCGTGAGCATGGTATGTCTGCTGCAATGAATGGAATAACATTGCATGGAGGCTTGATTCC GTATTCAGGGACTTTTTTAGTTTTTTCTGACTATAGTCGACCAGCAATTAGGCTTGCGGCTTTGATGGGGATTAGAGTTA TTCATGTGTTAACGCATGATTCTATTGGTCTTGGTGAGGATGGCCCTACACATCAGCCAGTTGAACATATGGCTGCTTTG AGAGCAATTCCAAATCTTTTGATGTTTAGACCAGCTGATTCTGTGGAAACTTTGGAATGTTGGCAAGTTGCAATCAAAGA AAAAAACGTCCTTCAGGGATCGCTTTATCACGGCAAAACCTTCCTTTTGTGCGTCTTCAGTATGAAGAAAAGAATTGTTG TTCTTATGGCGCTTATGAACTTGTTACTGCAGTTGATGCACAGGTCACTATTTTTGCTTCTGGATCTGAAGTAAAGATAG CTCTTGATGCTTGTAAATTATTGACTGCACGTAATATTCTTACACGTGTTGTATCAGTACCTTGTTTTGAACTTTTTTTT GAACAGGAAGATTCCTATAAAAAGGAAATTATCGGTACATCTCCTGTTAAAATTGCTGTTGAGGCAGGATTAAAGCAGGC TTGGGATGTTTTCCTTGGCACTGATGGTGTTTTTGTTGGTATGAAAGGTTTTGGAGCTTCAGGTCCTTGCGAAGAGCTTT ACCAATATTTTGGTATTACCTCTGCAGCTGTGGTAGCTGCTGCAGAAAAGATGCTTGCATCATGTGTTTAA Protein sequence : MIYLEKHNNMANAIRLLSIEAIERVNSGHPGLPMGVADIATVLFTQFMIFDPKKPLWPNRDRFVLSAGHGSMLLYSLLYL LGYEDMTIEDIKNFRTIKSKAAGHPEYGHASGIETTTGPLGQGLANAVGMAIAERKLRDEFGKELIHHYTYVIAGDGCLM EGISHEAISLAGHLQLNKLIVLWDNNSISIDGPVSLADSTDQGARFCAAGWNVLAVNGHNAEEIILALEKARLSDKPTMI DCKTIIGFGAPSKAGTNKVHGSPLGKEELSSTRKVLHWDAEPFCIPDDILEEWRFSGSRSTHIREEWEKNLYSVSSEIRS EFMRRFAGDLPDTLDREIDKYKRKLFEIRPEIPTRKASENALEIINDCLPETIGGSADLTGSNNTKTSQTRSITACDFSG RYLHYGVREHGMSAAMNGITLHGGLIPYSGTFLVFSDYSRPAIRLAALMGIRVIHVLTHDSIGLGEDGPTHQPVEHMAAL RAIPNLLMFRPADSVETLECWQVAIKEKNRPSGIALSRQNLPFVRLQYEEKNCCSYGAYELVTAVDAQVTIFASGSEVKI ALDACKLLTARNILTRVVSVPCFELFFEQEDSYKKEIIGTSPVKIAVEAGLKQAWDVFLGTDGVFVGMKGFGASGPCEEL YQYFGITSAAVVAAAEKMLASCV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 5e-137 | 49 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 5e-132 | 47 |
