Gene Information

Name : CKCE_0736 (CKCE_0736)
Accession : YP_007184670.1
Strain : Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii
Genome accession: NC_019815
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transketolase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 764693 - 766750 bp
Length : 2058 bp
Strand : +
Note : identified by sequence similarity; putative

DNA sequence :
ATGAACAAAGACATATATAAATCTAAAATTGTTTTGGCTGATGCCATTCGTGTTCTAGCAATGGATGCAGTGCAGCAAGC
TAACTCTGGGCATCCTGGTGCTCCTATGGGTATGGCAGAGATGGCACAGGCAATATGGAAAGATAATTTAAAACATAATC
CAAATGATCCAGGATGGATTAATAGAGATCGTTTTGTTTTGTCAAATGGTCACAGTTCTATGTTGCTTTACGCTGTTTTG
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ATCTCCTTTAGGTAAGGATGAGATATTAGCATCTAGAGAATTTCTTGGATGGCCTCATGATCCATTCGTGATTCCTCAAG
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AAACTTTATAAAAACAACAGTTAAAAAAGCAGAAACCTTAGCTACAAGAAAAGCTTCTCAACTTGCAATTGCAGAGATAG
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GTTAGAGCTGCTAATGATAAAGGGATATCATTTGGAAGACATATTAATTACGGTGTTCGTGAATTCGGTATGGCTGCAAT
TATGAATGGTATTGCATTGCATGGAGGCTACTTGCCTTTTGGCGGAACATTTTTAACTTTCTCAGATTATTCTCGTAATG
CAATTCGTATGGCTGCCTTAATGAAACAAAGGGTTATACATGTATTCACGCATGATTCTATAGGATTAGGAGAAGATGGT
CCCACTCATCAGTCTATTGAACATGTGGCTAGTTTACGTCTGATTCCAAATTTATCAGTATGGAGGCCTTGTGATACTGT
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CATTATTGCTTTCCAGGCAAAACCTTCCTTTTGTCGAACGTGATTCTTCTACAATTAACTCTATAGAAAAGGGCGGTTAT
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TAAATTAAATGAATTAGGTATTGGGGTTAGGATAGTTTCTATGCCTAGCACCGATGTTTTTGATAAACAAGATAATAGTT
GGAAAGAAAAAGTTTTGCCAGGCAATCTTCCAAAGATTGCAATAGAAGCTGGTGTAACTTCCGGATGGTATAAGTATGTT
GGCTTAGATGGTTTGGTTTTAGGTATAGATCGTTATGGAGAATCAGCTCCAGCCGGAGAGTTATTTAAATTTTTTGGATT
GACATCAGATAATGTTGTTTCGTCAGTGAAAAAGATTTTGTCATTGAAAGGGGTTTAG

Protein sequence :
MNKDIYKSKIVLADAIRVLAMDAVQQANSGHPGAPMGMAEMAQAIWKDNLKHNPNDPGWINRDRFVLSNGHSSMLLYAVL
HLTGYDVSMNDIRNFRQLHSKTPGHPEVGITPGIETTTGPLGQGLANAVGMALAESLLAEEFNKPGFDIINHNTYAMVGD
GCLMEGISHEVCSLAGTLKLSKLIVLYDDNGISIDGNVKHWFNDDTAGRFRGYGWNVITDINGHDASAINAAIKLARSQS
KKPTIIICKTTIGKGSPNMAGTHNVHGSPLGKDEILASREFLGWPHDPFVIPQEMYDAWDARESGEKAQAIWKSKFDSYA
IEYPSFAHELKRRMNGELPCNFDEFVQNFIKTTVKKAETLATRKASQLAIAEIANTLPEFLGGSADLTGSNYTDWKGVAP
VRAANDKGISFGRHINYGVREFGMAAIMNGIALHGGYLPFGGTFLTFSDYSRNAIRMAALMKQRVIHVFTHDSIGLGEDG
PTHQSIEHVASLRLIPNLSVWRPCDTVETVVAWEYAIKRPVSVGMDVRDGGPTALLLSRQNLPFVERDSSTINSIEKGGY
ILKDVDNAQAIIIATGSEIAIALDAQNKLNELGIGVRIVSMPSTDVFDKQDNSWKEKVLPGNLPKIAIEAGVTSGWYKYV
GLDGLVLGIDRYGESAPAGELFKFFGLTSDNVVSSVKKILSLKGV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
tktA AAO17218.1 TktA Not tested tcd island Protein 0.0 60
APECO1_2641 YP_859417.1 transketolase Not tested Not named Protein 7e-174 55