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Name : Cyan10605_0242 (Cyan10605_0242) Accession : YP_007160438.1 Strain : Cyanobacterium aponinum PCC 10605 Genome accession: NC_019776 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.2.1.1 Position : 307176 - 309188 bp Length : 2013 bp Strand : - Note : PFAM: Transketolase, thiamine diphosphate binding domain; Transketolase, C-terminal domain; Transketolase, pyrimidine binding domain; TIGRFAM: transketolase, bacterial and yeast; COGs: COG0021 Transketolase; InterPro IPR005478:IPR005474:IPR005475:IPR00547 DNA sequence : ATGGTGGTTGCAACCCAATCTATTCAAGAACTTTGCATTAATGCAATCCGTTTTCTCTCCATTGACGGTGTAGAAAAAGC AAAATCTGGACACCCCGGACTACCTATGGGCGCAGCGCCTATGGCGTTTGTGTTATGGGATCAGTTCATGAAATTTAATC CCAAAAATCCTCAATGGTTCAATCGTGACCGTTTCATCCTTTCTGCTGGTCATGGTTCTATGCTTCAGTATTCTTTATTA CATTTATACGGTTATGATAGTGTAACTATTGAAGATATTAAGCAGTTCCGTCAATGGAAATCTAAAACTCCCGGACACCC TGAGAATTTCGTTACTGCAGGAATTGAAGTTACCACAGGTCCTTTAGGACAAGGTATTGCTAATGGAGTTGGTTTAGCTT TAGCAGAAGCTCATTTAGCGGCTAAATTCAATAAACCTGATGCGACTATCGTTGATCATTACACTTATGTTATTCTCGGT GATGGTTGCAATATGGAAGGTATTTCTGGAGAAGCGGCTTCTTTGGCTGGACATTGGGGCTTAGGTAAGTTAATCGCTCT CTATGATGATAACCACATTTCTATTGATGGTTCTACCGACATCGCTTTTACTGAAGATGTTTGCAAGCGTTATGAGGCTT ATGGTTGGCACGTTCAACACGTAGAAAATGGTAATACTGATTTAGAGGCGATCGCATCTGCCATTGAGGCGGCTAAAGCT GTTACTGATAAACCTTCTTTGATTAAAGTTACTACTACTATCGGTTATGGTTCTCCTAATAAAGCTGATACTGCTGGAGT TCACGGTGCGGCCTTAGGTGCGGATGAAGTGGCTTTAACCCGTAAAGAATTGGGTTGGAATTACGATCCTTTCGTTGTTC CAGAAGAAGTTTATAATCACTTCCATAAAGCCATCGAAAGAGGTGCTAGTTTACAAGCTGAGTGGGAAGAAACCTTTGCT ACTTACAAAACCAAGTATCCTGCTGAAGCTACTGAATTTGAAAATCAAATCTCTGGTAAATTACCTGAAAATTGGGCGGA CTGTTTACCTTCTTACACTCCCGAAGATAAAGCCTTAGCAAGTCGTAAGCACTCTGAAATCTGCTTAAATGCGATCGCAC CTGTTTTACCTCAATTAGTCGGTGGTTCTGCGGACTTAACCCACTCTAACTTAACCGAAATTCATTGCTCTGGCGACTTC CAAAAAGGTGCTTACGAAAATCGTAATATCCACTTCGGTGTTAGAGAACACGCTATGGGAGCAATCTGTAATGGTATTGC TTTACACAATAGCGGTTTAATTCCCTACGGTGCTACTTTCTTAGTCTTTACTGACTACATGAGAAACTCCATCCGTTTAT CTGCTTTATCTGAAGCCAAAGTAATCTGGGTCATGACTCACGATTCCATCGCATTAGGGGAAGATGGACCTACTCACCAA CCCGTAGAACACGTTATGTCTTTGCGCATGATTCCCGACTTATTAGTGTTCCGCCCCGCCGATGGTAATGAAACCTCTGG AGCTTACAAAGTTGCGATCGAAGCTGATAAAACCCCTTCCTTAATGGCTTTAACCCGTCAAGGCTTACCTAACTTAGCGG GATCTTCCATCGATGCAGTGGCTAAAGGTGGTTATGTACTTTCCTGTGGATTCGCTCCGGAAGAATTAGATTTAATCTTA ATCGGTACTGGTAGCGAAGTTGGTCTTTGTGTTGAAGCCGCAGAAAAATTAAAAGCCGAAGGCTTAAAAGTTCGTGTTGT TTCCATGCCTTGTGTTGAATTATTTGATCAACAAGATGAGGCTTACAAGGAATCTGTATTACCTAAATCCGTGAAAAAAC GTATCTCCGTTGAAGCTGGTGTTACCTATGGTTGGGAACGCTTTGTTGGTGATGAAGGAGTTTGCATCGGTATTAATACT TTTGGTGCGTCTGCTCCCGGTGGTGTTGTCATGGAAAAATTTGGCTTCACTGTTGATAATGTAGTTGCCCAAGCTAAAGC CATTTTAGGTTAA Protein sequence : MVVATQSIQELCINAIRFLSIDGVEKAKSGHPGLPMGAAPMAFVLWDQFMKFNPKNPQWFNRDRFILSAGHGSMLQYSLL HLYGYDSVTIEDIKQFRQWKSKTPGHPENFVTAGIEVTTGPLGQGIANGVGLALAEAHLAAKFNKPDATIVDHYTYVILG DGCNMEGISGEAASLAGHWGLGKLIALYDDNHISIDGSTDIAFTEDVCKRYEAYGWHVQHVENGNTDLEAIASAIEAAKA VTDKPSLIKVTTTIGYGSPNKADTAGVHGAALGADEVALTRKELGWNYDPFVVPEEVYNHFHKAIERGASLQAEWEETFA TYKTKYPAEATEFENQISGKLPENWADCLPSYTPEDKALASRKHSEICLNAIAPVLPQLVGGSADLTHSNLTEIHCSGDF QKGAYENRNIHFGVREHAMGAICNGIALHNSGLIPYGATFLVFTDYMRNSIRLSALSEAKVIWVMTHDSIALGEDGPTHQ PVEHVMSLRMIPDLLVFRPADGNETSGAYKVAIEADKTPSLMALTRQGLPNLAGSSIDAVAKGGYVLSCGFAPEELDLIL IGTGSEVGLCVEAAEKLKAEGLKVRVVSMPCVELFDQQDEAYKESVLPKSVKKRISVEAGVTYGWERFVGDEGVCIGINT FGASAPGGVVMEKFGFTVDNVVAQAKAILG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 9e-154 | 54 |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 8e-151 | 52 |
