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Name : Sta7437_0919 (Sta7437_0919) Accession : YP_007131468.1 Strain : Stanieria cyanosphaera PCC 7437 Genome accession: NC_019748 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.2.1.3 Position : 1025194 - 1027200 bp Length : 2007 bp Strand : + Note : PFAM: Transketolase, thiamine diphosphate binding domain; Transketolase, C-terminal domain; Transketolase, pyrimidine binding domain; TIGRFAM: transketolase, bacterial and yeast; COGs: COG0021 Transketolase; InterPro IPR005478:IPR005474:IPR005475:IPR00547 DNA sequence : ATGGTAGTTGCCACCCAGTCACTCGAAGAACTTTGCATCAATTCTATTCGCTTTTTAGCTATAGACGCGGTTGAAAAAGC TAAATCCGGTCATCCAGGACTGCCCATGGGGGCTGCTCCAATGGCTTTTGTTCTTTGGGACCGCTTTATGAAGCATAATC CCAAAAACCCTAAGTGGTTTAATCGCGATCGCTTTGTGCTTTCTGCCGGTCATGGTTGTATGTTGCTGTATGCTTTAATG TATCTTACAGGCAGCGATGTGGTTACTCTCGACGAAATTAAAAACTTCCGTCAGTGGGGTTCCAAAGCACCAGGACACCC AGAAAATCATATTACTGAAGGAGTTGAAGTAACTACTGGACCACTAGGACAAGGTATTGCTAATGCTGTTGGTTTAGCGA TCGCTGAAGCTCATCTTGCTGCTAAATATAATAAAGAAGATTGCAAATTAGTAGATCATTACACTTACGTCATCCTCGGT GATGGCTGTAACATGGAAGGTATTTCCGGTGAAGCTTGTTCTTTAGCTGGACATTTAGGTTTAGGAAAACTGATTGCTCT CTACGATGACAACCATATTTCCATTGATGGCTCTACTGATGTTTCCTTTACCGAGGATGTCAGCAAGCGATTTGAAGCTT ATGGTTGGCACGTACTCCATGTTAAAGACGGTAATAGCGATCTAGACGAAATTGCCAAAGCCATTGAAGACGCTAAAGCA GTTACCGATAAACCTTCGATGATCAAGGTTACCACCACAATTGGTTACGGTTCTCCCAATAAAGCTAATACTGCTGGCGT TCACGGTGCTGCTCTCGGTGGAGATGAAGTAAAAGCCACCCGTGAAAACTTGGGTTGGAATCATGAACCGTTTGTAGTTC CTGATGATGCTCTAGCTCACTTCCGTAAAGCAGTAGAACGCGGTGCTAGTTATGAAGCAGAATGGCAAGAAACTTTAGCT CACTACAAAACTAAATATCCCCAAGAAGCTGCTGAATTTGAGCGGATTATTAGTAGTACTTTACCAGAAGGTTGGGATAA AGTTCTACCTAGCTACACTCCCGAAGATAAAGCTCTAGCAACTCGGAAACATTCAGAAATTACTCTCAACGCTCTTGCTC CTGTGTTACCAGAACTAATTGGTGGTTCGGCGGACTTGACACACTCTAACTTAACTTACTTAGAAGTCTCTGGTAGTTTC CAAAAAGGTGCTTACCAAAACCGCAACCTCCGCTTTGGGGTAAGAGAACACGCTATGGGGGCAATTTGTAATGGAATTGC ATTACATAGTCATGGTTTAATTCCTTACGGTGCTACCTTCTTGGTATTTACCGATTATATGCGGAATTCAATTCGTCTCT CTGCTTTATCGGAAGCCAGAGTGATTTGGGTAATGACTCATGATTCGATTGGTTTGGGTGAAGATGGCCCTACTCACCAA CCCGTTGAACACGTTGCTTCTTTACGTGCTATTCCTAACCTCACTGTTTATCGTCCTGCTGATGGTAATGAAACTTCCGC AGCTTACAAGGTAGCAGTTGAAAATACTCACGGCCCAACTTTACTCGCTCTTTCTCGTCAGGGACTACCCAACCTAGCTG GCTCTTCAATTGAAGCTGCTGCTAAAGGTGGTTATATTCTTAGTGATAGCGATGGTACTCCAGATATTATTTTGATTGGT ACTGGTAGCGAAGTTGCACTCTGTGTTCAAGCAGCCGAAAAATTAACTAGCGAAGGTAAAAAAGTTCGGGTAGTTTCTCT ACCTAGCTGGGAACGCTTTGAGGCTCAAGGTGCAGAATATAAAGAATCTGTACTACCAAAAGCAGTTAAAAAACGTTTAG CTGTTGAAGCTGGTTGTACAATGGGCTGGTGTCGCTATGTTGGTGATGAAGGTGGAGTCATTGGTGTTGATACCTTTGGC GCTTCTGCTCCAGCTAATATTGTTTTTGAAAAATATGGCTTTACCGTTGATAACGTTGTTGCTAAGGCTAAAGAAATTTT AGGTTAA Protein sequence : MVVATQSLEELCINSIRFLAIDAVEKAKSGHPGLPMGAAPMAFVLWDRFMKHNPKNPKWFNRDRFVLSAGHGCMLLYALM YLTGSDVVTLDEIKNFRQWGSKAPGHPENHITEGVEVTTGPLGQGIANAVGLAIAEAHLAAKYNKEDCKLVDHYTYVILG DGCNMEGISGEACSLAGHLGLGKLIALYDDNHISIDGSTDVSFTEDVSKRFEAYGWHVLHVKDGNSDLDEIAKAIEDAKA VTDKPSMIKVTTTIGYGSPNKANTAGVHGAALGGDEVKATRENLGWNHEPFVVPDDALAHFRKAVERGASYEAEWQETLA HYKTKYPQEAAEFERIISSTLPEGWDKVLPSYTPEDKALATRKHSEITLNALAPVLPELIGGSADLTHSNLTYLEVSGSF QKGAYQNRNLRFGVREHAMGAICNGIALHSHGLIPYGATFLVFTDYMRNSIRLSALSEARVIWVMTHDSIGLGEDGPTHQ PVEHVASLRAIPNLTVYRPADGNETSAAYKVAVENTHGPTLLALSRQGLPNLAGSSIEAAAKGGYILSDSDGTPDIILIG TGSEVALCVQAAEKLTSEGKKVRVVSLPSWERFEAQGAEYKESVLPKAVKKRLAVEAGCTMGWCRYVGDEGGVIGVDTFG ASAPANIVFEKYGFTVDNVVAKAKEILG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 3e-159 | 54 |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 7e-160 | 54 |
