Gene Information

Name : Syn6312_0744 (Syn6312_0744)
Accession : YP_007060505.1
Strain : Synechococcus sp. PCC 6312
Genome accession: NC_019680
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 746484 - 748091 bp
Length : 1608 bp
Strand : -
Note : PFAM: HMGL-like

DNA sequence :
ATGATCAAGCTATTGGACTGTACCTTAAGAGATGGTGGATACTACAACTCTTGGAATTTCTCACAAAATTTAATTCATAA
ATATCTCCAGTCGATGGCTGCCATTTCTGTAGATTACGTTGAGCTGGGCTTCCGTGGATTTCCTCAGGATGATTTTTTGG
GTGGGTGTGCATATACTACCGATACATTTATCCATAGCTTGGCAATACCAGAGAACTTAAAGATTGGGGTAATGGTCAAT
GCGAGTGAGTTGCTTAAGTATCCAGATGGAATAATACCTGCCCTTAATTTGTTGTTTAAGCCAGCTAGTGACTCTCCAGT
TTCATTAGTCCGTATTCCTTGTCACTACTATGAATTTGAACAAACTTTATTGGGATGTGAATGGTTGAAAGATCAAGGCT
ATCAGGTAGGCATTAACTTAATGCAAGTTGCAGATCGTTCATTAGCTGAAGTTCAACAGTTGGCCCAAATTGCTAGCCGT
TATCATTTAGATGTGCTCTACTTTGCCGATAGCATGGGTAGCATGAATCCTAAACAAACATCGGAGATTATCCAAGCTCT
GCGCGAAGGCTGGTCAGGAGAGCTAGGGATTCATACCCACGATAATATGGGGCGAGCACTATCTAACTGTGTGCAAGCAG
TTAATGACGGTGTCACCTGGATTGATGCAACTGTAACAGGTATGGGACGTGGAGCCGGCAATGCTAAAACTGAATATCTT
GTTATTGAACTAGCTGAAATTCGCCCTGACGTGCCATGCAACATCATACCTTTGATGGGACTGGTTGCAGATTACTTCAG
CCCACTGCAACATGAGTATGGTTGGGGAACAAACACATACTACTACTTGGCTGGGAAGTATGGTATTCACCCGACTTATA
TTCAAGAAATGCTAGCAGATAATCGCTATCTGGATGAGGATATTCTGGGTGTAATTGATCATCTAAAATCATCAGGTGGG
AAGAAGTTTAGTCTTAATGCTCTTAATTCAGCACGACATTTCTATACCGGAGAACCTATCGGAACTTGGTCTCCAAAATC
ATTGATTACTGGTAGAGATGTTCTAATTCTAGGAACCGGTCCCGGAGTAGAAGCTCATCAGCATGCTTTAGAGAACTATA
TCAGTTCTCAGCATCCCATTGTGATTGCTCTAAATACGCAGACTCATATTGCCTCAGATTTAATTGATTTAAGGGCAGCA
TGTCATCCGGTTCGCTTATTAGCTGATTGTCAAGAACACTTAAATTTACCTCAGCCTCTAGTGATTCCATATTCAATGTT
ATCTAAAGATATTAGGAACGAACTAGAAGGCAAAAAGCTTTTAGACTTTGGCTTGGTAGTACAATCTGAAACCTTTAAGT
TTGAAGACAACTATTGTATATTACCTACTTCGATGGTTATTGCCTACTCCTTGGCAATTGCTACTAGTGGAAGGGCTAAA
AGAATCTTATTGGCGGGCTTTGATGGTTATGGGTCGGATGATTTGCGAAATCATGAAATGGATTACCTGTTGAATCTTTA
CAACTCAACTTTAGGAGCATTACCTCTCGTTGCTATTACCCCGACTAAATATAGAATTAAGAGAGCTAGTGTTTACGAAG
TAGGTTAA

Protein sequence :
MIKLLDCTLRDGGYYNSWNFSQNLIHKYLQSMAAISVDYVELGFRGFPQDDFLGGCAYTTDTFIHSLAIPENLKIGVMVN
ASELLKYPDGIIPALNLLFKPASDSPVSLVRIPCHYYEFEQTLLGCEWLKDQGYQVGINLMQVADRSLAEVQQLAQIASR
YHLDVLYFADSMGSMNPKQTSEIIQALREGWSGELGIHTHDNMGRALSNCVQAVNDGVTWIDATVTGMGRGAGNAKTEYL
VIELAEIRPDVPCNIIPLMGLVADYFSPLQHEYGWGTNTYYYLAGKYGIHPTYIQEMLADNRYLDEDILGVIDHLKSSGG
KKFSLNALNSARHFYTGEPIGTWSPKSLITGRDVLILGTGPGVEAHQHALENYISSQHPIVIALNTQTHIASDLIDLRAA
CHPVRLLADCQEHLNLPQPLVIPYSMLSKDIRNELEGKKLLDFGLVVQSETFKFEDNYCILPTSMVIAYSLAIATSGRAK
RILLAGFDGYGSDDLRNHEMDYLLNLYNSTLGALPLVAITPTKYRIKRASVYEVG

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed AAK15338.1 unknown Not tested Not named Protein 1e-144 53