Gene Information

Name : Syn6312_2971 (Syn6312_2971)
Accession : YP_007062572.1
Strain : Synechococcus sp. PCC 6312
Genome accession: NC_019680
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : sodium--glutamate symport carrier GltS
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2914242 - 2915450 bp
Length : 1209 bp
Strand : +
Note : PFAM: Sodium/glutamate symporter; TIGRFAM: sodium--glutamate symport carrier (gltS)

DNA sequence :
ATGAACTTAATTCAACTGGATGTTCGTCAAACGATTATTAGTGCCATTTTAGTGCTCTACTTTGGAAAGTACTTAACCAA
GCACGTCAGATTCTTACGCGAATACAACATTCCAGATGCGGTTTCAGGAGGGTTGATTGCTTCACTTTTTTTTGGGATTT
GCTATAGCCTATTAAAAACCCAAGTTGAATTTCATCTCCCCATTCGGGACATTCTTTTAGTGGTTTTCTTTACCACGATT
GGACTATCAGCTAAATTACAAACCCTCCTCAAAGGGGGCAAACCCTTAACCATTCTCTTAATTACGGCTGTAATCTATCT
GTTCTTACAAAATATTACCGGAATTACCGTGGCCAGAATCATCGGTGTGGATTTACCTATTGGTGTTTTAGCTGGTTCAG
TTTCCCTCAGTGGTGGTCACGGAACAGCCATTGCTTGGGCCCCCATTTTTCAACGGGATTATGGGATTGTGAACGCGTCT
GAGATTGGCATTGCCAGTGCGACCTTTGGCCTGGTTTTGGGTGGCATCATTGGTGGGCCTGTGGCTCGATTCTTAATTAA
ACGACATCGTTTAAAAGCCGACTGCATTGATCAAGAGTTAACGGTGGGGATTCGCCAAGATCAAGAGAATGTCCAAATTA
ACTACAATACAATGCTCAATGCCGTGTTTGTGATTGGCTTAACCGTGGGTCTGGGGATTCAAATTAATGGAATTACGGAT
GCATTGGGCTTGAAACTCCCTTTGTTTGTCGCTTGTTTGCTGGCGGGAATTATCCTCACCAATACTATGCCTTACCTGTT
TAAGCGTTTACCCTGGCCGGCTGGAACCTCCTCCTTAGCCTTGATTGCAGATGTGAGTCTCGGCTTATTTTTAGCCATGT
CTTTGATGAGTTTACAGTTATGGACATTGGCGGGAGTGGCTGGCCCTGTGACAATATTGCTATTAGTACAATTTGGATTA
AGCACCGTTTACACCATTTTTGTTGTGTTTCCAGTCATGGGAAAAAATTACAATGCTGCGGTAATTGCAGCGGGCTATTC
CGGGTTAACTTTAGGCGCAACTCCCACAGCGATTGCCAACATGACCGCCGTCACAGAACGCTTTGGAGCCTCCCCCCAGG
CCTTTATTATTTTGCCGTTGGTCGGGGCATTTTTTATTGATCTTGTCAATGCCTTTGCGATTCAACGATTTCTCAGCTTT
ATGGGTTAA

Protein sequence :
MNLIQLDVRQTIISAILVLYFGKYLTKHVRFLREYNIPDAVSGGLIASLFFGICYSLLKTQVEFHLPIRDILLVVFFTTI
GLSAKLQTLLKGGKPLTILLITAVIYLFLQNITGITVARIIGVDLPIGVLAGSVSLSGGHGTAIAWAPIFQRDYGIVNAS
EIGIASATFGLVLGGIIGGPVARFLIKRHRLKADCIDQELTVGIRQDQENVQINYNTMLNAVFVIGLTVGLGIQINGITD
ALGLKLPLFVACLLAGIILTNTMPYLFKRLPWPAGTSSLALIADVSLGLFLAMSLMSLQLWTLAGVAGPVTILLLVQFGL
STVYTIFVVFPVMGKNYNAAVIAAGYSGLTLGATPTAIANMTAVTERFGASPQAFIILPLVGAFFIDLVNAFAIQRFLSF
MG

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
gltS NP_273147.1 sodium/glutamate symport carrier protein Not tested IHT-A Protein 9e-54 42