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Name : Riv7116_3244 (Riv7116_3244) Accession : YP_007056261.1 Strain : Rivularia sp. PCC 7116 Genome accession: NC_019678 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase subunit I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 4031580 - 4033289 bp Length : 1710 bp Strand : - Note : PFAM: Cytochrome C and Quinol oxidase polypeptide I; TIGRFAM: cytochrome c oxidase, subunit I DNA sequence : ATGACTAACACTCAATCAAAAAACACTGAGGTTGTAAAAAAGCAACATCAACCTCAGAGTCAACCACAGCATCAAACACA CCATCCTCATCCACCGACAACGTGGAAGACCTATTTTACTTTTAGTACCGACCATAAAGTAATTGGTATTCAATATATAG TTACAGCCTTTATATTTTTCTTGCTTGGTGGAATACTTGCCATGATAATCAGGGGTGAATTAATGACTCCTGAATCTGAC TTAGTAGATCGCACCGTTTACAACTCAATGTTTACGATGCATGGAACGTTAATGCTATTTATGTGGACTTTCCCCATATT GGCAGGCTTAGCGAACTATCTCGTACCTTTGCAGATTGGTGCTAAAGATATGGCATTTCCTCGCCTGAACGCTTTAGCTT TTTGGATGGTGCCCCTGTTCGGCATCGTACTTATGGCGAGTTTCTTCGTTCCTGGCGGTTCAGCACAAGCAGGTTGGTGG TCTTATCCTCCTGTAAGTACTCAGAATCCCACAGGTAACTTGGTTAATGGAGAACTCTTATGGTTAGTAGCTGTAGCATT ATCGGGTGTTTCATCCATTTTAGGCGCGGTTAATATTGTTACTACTATTTTCCGGATGAGAGCGCCAGGAATGGGCTTTT TCAAAATGCCTGCTTATGTATGGACAGTCTTAAGCGCTCAGATGATTCAATTATTTGGATTGCCTGCTTTGACTGCTGGT GCGGTAATGCTATTGTTTGACTTAACGGTAGGTACTGCATTTTTCGACCCCGTACAAGGCGGCGACCCGGTATTATACCA GCACTTTTTCTGGTTCTATTCTCATCCAGCAGTCTACGTAATTATACTACCTATCTTCGGAATCTTTTCAGAGATATTTC CCGTTTACTCTCGCAAACCTTTATTTGGTTATAAGGTAGTTGCAGTTTCATCCTTAATTATCACTGGATTAAGCGCAGTG GTATGGGTTCACCACATGTATGCTAGCGGTACCACAGGCTGGATGCGGATGCTGTTCATGTTCTCCACAATGCTGATTTC GGTACCCACAGGAATTAAAGTATTTGCTTGGTTAGGAACAATTTGGGGAGGTAAATTACGCTTAGATACACCAATGTTGT TTGCATTGGGTGGATTAGTGATGTTTGTATTTGCAGGTATCACCGGTATCATGCTTTCCTCGGTTCCCATCGACATTCAC GTTAACAATACTTACTTCGTCGTTGGGCACTTCCACTATGTTATTTACGGTGCGGTAGTGATGGGTATCTATGCAGCCAT CTATCACTGGTTCCCTAAGATGACTGGAAAGATGTATTACGAAGGTTTAGGTAAGCTACATTTTTGGTTAACCTTCATTG GTGCTAATTTAAATTTCTTCCCCATGCACCCATTAGGATTGCAAGGAATGCCCCGTCGAGTTGCTTCTTACGATCCAGAA TATTTAGGTTGGAATGTAGTTGCTAGTGTTGGCGCATTTATTTTAGGAATGTCTACATTACCGTTTTTACTTAACGTTAT AAGTTCTTGGATTGACGGTAAAAAAGCATCGGATAATCCTTGGCGTGCAATTGGTTTGGAATGGTTAGTATCCTCACCAC CACCCGTAGAAAACTTTGAAAAACAGCTTCCCATTGTATTAGAAGAACCATACGGTTACGGTAAATCGAAACCAGAAGAT TTAGTCGCGAATGCTTCAGAACTTAATTAA Protein sequence : MTNTQSKNTEVVKKQHQPQSQPQHQTHHPHPPTTWKTYFTFSTDHKVIGIQYIVTAFIFFLLGGILAMIIRGELMTPESD LVDRTVYNSMFTMHGTLMLFMWTFPILAGLANYLVPLQIGAKDMAFPRLNALAFWMVPLFGIVLMASFFVPGGSAQAGWW SYPPVSTQNPTGNLVNGELLWLVAVALSGVSSILGAVNIVTTIFRMRAPGMGFFKMPAYVWTVLSAQMIQLFGLPALTAG AVMLLFDLTVGTAFFDPVQGGDPVLYQHFFWFYSHPAVYVIILPIFGIFSEIFPVYSRKPLFGYKVVAVSSLIITGLSAV VWVHHMYASGTTGWMRMLFMFSTMLISVPTGIKVFAWLGTIWGGKLRLDTPMLFALGGLVMFVFAGITGIMLSSVPIDIH VNNTYFVVGHFHYVIYGAVVMGIYAAIYHWFPKMTGKMYYEGLGKLHFWLTFIGANLNFFPMHPLGLQGMPRRVASYDPE YLGWNVVASVGAFILGMSTLPFLLNVISSWIDGKKASDNPWRAIGLEWLVSSPPPVENFEKQLPIVLEEPYGYGKSKPED LVANASELN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 2e-107 | 48 |
