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Name : HPAKL86_06305 (HPAKL86_06305) Accession : YP_007019310.1 Strain : Helicobacter pylori Aklavik86 Genome accession: NC_019563 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1322399 - 1324045 bp Length : 1647 bp Strand : - Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : ATGGAATTTCATCAAGTCTATGACCCATTAGGCAATATTTGGCTGAGCGCTTTAGTGGCGCTATCGCCTATTGCACTCTT TTTTGTCTCTCTTATTGTTTTTAAACTTAAGGGGTATAGCGCTGGGTTTTTGAGTTTGGCGCTTTCGGTGTTGATCGCAC TATTTGTGTATAAGATGCCTACTGAAATGGTGAGCGCGAGTTTTATTTATGGATTTCTTTATGGCTTATGGCCGATCGCA TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTGAAAGAAAGCATTTT AACCCTAACGCCGGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCGGTT TTGGAGGCCCGGTAGCAATCACTGCAGCGATTTTAGTCGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGATTGTGCCTA ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGTATTCCTATTACGGCAATGGCTAGTGTGGTGGGTATCCCTGA GTTAGAAATTTCTCAAATGGTGGGCAGAGTGTTACCAATTTTTTCCATTGGTATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAGAGGGATTAGAGAAACTTTTCCTGCAGTGGCTGTTACCGGGTTTAGTTTCGCTATCGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATCTAGGGCCGCAACTCCCGGATATTATTTCAGCCTTAGTGTCATTGATTGCTACCACTTTGTTTTTAAAATT CTGGCAGCCCAAGCGCATTTTCACTAGCAATGGCAAAGAGCCTGCAATCAGCACAGAAAAACACCATATTTGTAAGGTGA TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACTATTACGATTATCATATGGACGCAACCCTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGCGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTCAGTTCTATCAGTCAAAAGATTTTTAAAACCGCTCCCAT TGTTACTGAGGCAAAAAGCTTTCCTGTTGTGTTCAAATTCCCTTTGATTTTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CTCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGTGTAAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCTACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCCACGCTCGCTTT AGCGTTAGCGGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTTGTAGGTTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGTTCTTTGCAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCAAACACTTCAGGGGGTGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGTT AGTGGGGAAAGAGAGTGAATTGTTCAGATTTACGGTAAAATATTCCGTCGCTTTGGCGATCATTATGGGGATTATTTTCA CTCTTATTGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATCCCCATCATTCCTTAA Protein sequence : MEFHQVYDPLGNIWLSALVALSPIALFFVSLIVFKLKGYSAGFLSLALSVLIALFVYKMPTEMVSASFIYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKFWQPKRIFTSNGKEPAISTEKHHICKVIVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFSSISQKIFKTAPIVTEAKSFPVVFKFPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSVALAIIMGIIFTLIAYVFPFIIPIIP |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-132 | 56 |
