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Name : HPAKL117_00700 (HPAKL117_00700) Accession : YP_007016694.1 Strain : Helicobacter pylori Aklavik117 Genome accession: NC_019560 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 147204 - 148859 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : GTGCTAGAATTTCATCAAATTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGTTGAGCGCTCTTGTAGCCTTATTGCCGATCTTATT ATTTTTCTTATCTTTAATCGTGTTCAAATTCAAAGGTTATACAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCTCTGTCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTTCTCTATGGTTTATGGCCGATC GCATGGATCATCATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT TCAGTCCATCACTTTAGATCACAGGATTTTAGTGATCTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACAGCAGCGATTTTAGTGGGCTTAGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGATTGTGC CTAATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGTGCGATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTGATTTCAGCCATGACGGGTAAAATTCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTCGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCTGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTATTGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTACTTGGGGCCAGAATTGCCCGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGTGATTTTTAGAAGCGATGGCAAAGCGGCTTCATTCACTAAGAGTAACCATCATATCTGTAAGA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTGTTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAATCCGATCAAAGCGCGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTTCTTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTCATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTCTTTGGCGAAACTCTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTTACCATTGGTTTAGTTTTAAGCTTTGCTTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TTTAGCCTTAGCGCTCACCCATACAGGCTTAGCTTTCACCTTTTTCTCGCCTTTGATTGGGTGGGTGGGCGTGTTTTTAA CCGGAAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGATT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTGGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC AGTGGGATTGGCCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTCAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TTGTGATTAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MLEFHQIYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLIVFKFKGYTAAFLSVALSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLNPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLFVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAIAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKVIFRSDGKAASFTKSNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVESDQSASFPVVFKFSLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-96 | 52 |
