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Name : HPAKL117_05580 (HPAKL117_05580) Accession : YP_007017640.1 Strain : Helicobacter pylori Aklavik117 Genome accession: NC_019560 Putative virulence/resistance : Unknown Product : pyrimidine nucleoside transport protein (nupC) Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1173724 - 1174980 bp Length : 1257 bp Strand : - Note : COG1972 Nucleoside permease DNA sequence : ATGATTTTTAGCTCTCTTTTTAGTGTTGTAGGGATGGCGGTGCTTTTTCTTATTGCTTGGGTGTTTTCTAGCAATAAAAG GGCTATTAATTATCGCACGATTATCAGCGCCTTTGTGATCCAGGTGGCTTTAGGGGCGTTGGCTTTATATGTGCCTTTGG GTAGGGAAATGTTGCAAGGTTTAGCCAGTGGCATACAAAGCGTGATCGGTTATGGCTATGAGGGGGTGCGTTTTTTATTT GGGAGTCTCGCTCCAAACGCTAAGGGCGATCAAGGGATAGGAGGCTTTATCTTTGCTATTAATGTTTTAGCGATCATTAT CTTTTTTGCTAGCTTGATTTCACTCCTATACTATTTAAAAATCATGCCTTTAGTGATCAATCTCATCGGTGGGGCGTTGC AAAAATGCTTAGGCACTTCTAAAGCAGAAAGCATGAGTGCAGCGGCTAATATTTTTGTAGCGCACACAGAAGCGCCATTA GTCATTAAACCTTATTTGAAAAGCATGAGCGATTCAGAGATTTTTGCGGTCATGTGCGTGGGCATGGCTAGCGTTGCGGG GCCTGTGTTAGCCGGGTATGCGAGCATGGGCATTCCTTTACCTTATTTAATAGCCGCTTCGTTTATGTCCGCTCCTGGGG GTTTGTTGTTCGCTAAAATCATTTACCCGCAAAACGAAACCATTTCCAGCCGTGCAGATGTTTCTGCAGAAAAGCATGTC AATGCCATAGAAGCTATCGCTAATGGGGCAAGCACAGGGCTAAATTTAGCTTTGCATGTGGGAGCGATGCTTTTAGCCTT TGTGGGGATGCTTGCGCTCATTAACGGGCTTTTAGGGGTTGTAGGGGGATTTTTAGGCATGGAGCATTTGTCTTTGGGGT TAATTTTAGGCACGCTCTTAAAACCCTTAGCTTTTATGCTAGGCATTCCTTGGAGCCAGGCCGGGATTGCTGGAGAAATC ATAGGCATTAAAATCGCGCTCAATGAATTTGTGGGCTATATGCAATTTTTACCTTATTTGGGCGATAACCCTCCTTTAAT CTTGAGCGAGAAAACTAAAGCGATCATCACTTTTGCGTTGTGCGGGTTTGCTAACTTAAGCTCAGTCGCTATGCTCATTG GGGGGCTTGGCAGTTTGGTGCCTAAAAAGAAAGATCTCATTGTAAGGCTTGCTTTAAAAGCGGTGCTTGTAGGCACGCTT TCTAATTTCATGAGCGCGACTATCGCTGGGTTATTCATAGGGCTAAACGCTCATTAA Protein sequence : MIFSSLFSVVGMAVLFLIAWVFSSNKRAINYRTIISAFVIQVALGALALYVPLGREMLQGLASGIQSVIGYGYEGVRFLF GSLAPNAKGDQGIGGFIFAINVLAIIIFFASLISLLYYLKIMPLVINLIGGALQKCLGTSKAESMSAAANIFVAHTEAPL VIKPYLKSMSDSEIFAVMCVGMASVAGPVLAGYASMGIPLPYLIAASFMSAPGGLLFAKIIYPQNETISSRADVSAEKHV NAIEAIANGASTGLNLALHVGAMLLAFVGMLALINGLLGVVGGFLGMEHLSLGLILGTLLKPLAFMLGIPWSQAGIAGEI IGIKIALNEFVGYMQFLPYLGDNPPLILSEKTKAIITFALCGFANLSSVAMLIGGLGSLVPKKKDLIVRLALKAVLVGTL SNFMSATIAGLFIGLNAH |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| yutK | YP_005163383.1 | putative sodium/nucleoside cotransporter | Not tested | Not named | Protein | 2e-49 | 41 |
