Gene Information

Name : yocR (BN389_17880)
Accession : YP_007015353.1
Strain : Listeria monocytogenes LL195
Genome accession: NC_019556
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : Uncharacterized sodium-dependent transporter yocR
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1812798 - 1814153 bp
Length : 1356 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGCAAGAAAACAGAGAAGAATGGGGCTCAAAAGTCGGGTTTATATTAGCATCCGCTGGGTCCGCAATAGGAATTGGCGC
GATTTGGAAACTGCCTTATGTGGCTGCAACTGCAGGAGGTGGCGCATTTTTCTTATTGTTTTTAGTTTTAACTTTACTCG
TTGTGATGCCACTTTTAATTGCAGAATTTGTGATTGGACGAGGCTCTGGCGGAGATGCTGTTCAAGCTTATAAAACACTC
GCGCCCGGAACAAAGTGGAATTTACTTGGAAAATTAGGCGTTGTAGGCGCAAGTATTTTATTTTCGTTTTATAGCGTAGT
TGGTGGTTGGATTATCACTTACTTAATTAAAACACTTGCTGGCGGGATTGCTGGCGAAAATCAAGCAAGTCTGCTGCATG
ATTTCCAAGTGACGACAGCTAACCCGTGGATATCAGTTGGCGCAACGATTCTCTTTATTTTACTAAATGTCATTGTTATT
AGCCGCGGAGTTGTTAGTGGAATTGAAAAAATGAGTAAGTTTATGATGCCAGCTCTATTTATTTTATTTATTGTTTTAAT
TATCAGGTCCTTAACACTACCTGGTGCGATGGAAGGTGTCGCATTTTTCTTACGTCCAGATTTTAGTCATTTCACAGCGC
AAACGGTTCTTATAACGCTTGGTCAGGCCTTCTTCTCACTCAGTGTGGGGATTTCAGTAATGGTGACCTATAGTTCTTAT
TTAAATCGGTCGACTAGTTTACCGCAGTCTGCCATTTCGGTTTCGCTTATGAATGTGTTTGTGTCGCTTCTTGCGGGATT
GGCCATTTTCCCGGCAGCATTTTCGTTTAATATTACACCAGATGCGGGACCTGGATTGCTATTCGTTATTTTACCTTCGA
TCTTCAATCAAATGCCCTTTGGGATGTTGTTCTTTATTATTTTCTTGATTTTATTCTTATTCGCCGCATTAACCTCTAGT
TTCTCGATGCTTGAAGCAACGGTTGCGCCACTGATGAATGCGGGTGTTAATCGTAAAAAAGCAAGTCTTTGGATGGGGCT
CGTGATTGTCTTGATGGCTATTCCAAGTGCGCTTAGTTTTGGCGTTTGGAGCGATGTTCAGATTTTCGGACTAAGTATTT
TTGATGCTGCCGATTATCTTGTGTCGAATATTATCTTGCCAGTTGGTGCTTTATTTATCGCAATTTTCGTTGGTTACCGA
TTACCTCGTGAATTACTTTTAAAAGAATTTACCACAAGCAGCCATTTTGGAAAAAAAGTGTTTATTCTTTGGCTCTTTCT
TATTAAATATATTGCACCAATCGCGATTATTTTCGTCTTCCTCTCCGCAACTGGTTTAATCGATTTTCTGTTTTAA

Protein sequence :
MQENREEWGSKVGFILASAGSAIGIGAIWKLPYVAATAGGGAFFLLFLVLTLLVVMPLLIAEFVIGRGSGGDAVQAYKTL
APGTKWNLLGKLGVVGASILFSFYSVVGGWIITYLIKTLAGGIAGENQASLLHDFQVTTANPWISVGATILFILLNVIVI
SRGVVSGIEKMSKFMMPALFILFIVLIIRSLTLPGAMEGVAFFLRPDFSHFTAQTVLITLGQAFFSLSVGISVMVTYSSY
LNRSTSLPQSAISVSLMNVFVSLLAGLAIFPAAFSFNITPDAGPGLLFVILPSIFNQMPFGMLFFIIFLILFLFAALTSS
FSMLEATVAPLMNAGVNRKKASLWMGLVIVLMAIPSALSFGVWSDVQIFGLSIFDAADYLVSNIILPVGALFIAIFVGYR
LPRELLLKEFTTSSHFGKKVFILWLFLIKYIAPIAIIFVFLSATGLIDFLF

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAR0458 YP_039907.1 sodium:neurotransmitter symporter family protein Not tested vSa¥á Protein 2e-60 46
SAS0416 YP_042543.1 sodium:neurotransmitter symporter family protein Not tested vSa¥á Protein 2e-60 46