Gene Information

Name : pdpC2 (FTS_1130)
Accession : YP_007012003.1
Strain : Francisella tularensis FSC200
Genome accession: NC_019551
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : PdpC protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1104013 - 1107999 bp
Length : 3987 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
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ATTATATTATGGCAAAACTATACCTTTTTTGTTGATTAGTAGCGAAACTGTAAGATATTCTTCATCAGAAACTCACTACT
ATATACCAACAGAAGAAAACTTTGAAAATATACTTAAAATTGCTCTTAATAGTGCCTCAAAACCAGTAATAGAAAGATTC
TTAATTATTCTTAACATATATAATAACACTATTGATGATAATACTTTAATTTTAATACGATGCCGTTTAACAATAATATT
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TATAGCTAAAGCAAACGAGTTAAACTTTTATCAACTTATAATAAGACTTATTGAAATATCAACCTATCATAGAATACTTA
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ATAAATAAGCTATTTATTTATAAAAACAAGGATCTAAATACTGATAAATATAAAGCCTTTCACACTAAGCTTATAACTAT
TGAAAAAACCTATAAGAAAATAAATAGCTTATATAAATCAGACTTTTTTAAAAAAATATCATCATAG

Protein sequence :
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SFIIAILSLDKIIHKTKFITFGHKTVIFDFKKLWGLVDFVIVHTSNKTWVNHKLTSFMPSITYCNQNIIHLAYHSDFLYI
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NILILSLVEELKPKCSEYKKNMINQQIIAKANELNFYQLIIRLIEISTYHRILTKSIITNTTSLLYDILNKPEFQTINKS
INKLFIYKNKDLNTDKYKAFHTKLITIEKTYKKINSLYKSDFFKKISS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
pdpC2 YP_170614.1 hypothetical protein Not tested FPI Protein 0.0 99
pdpC1 YP_001121167.1 pathogenicity determinant protein pdpC Virulence FPI Protein 0.0 99
pdpC2 YP_001121570.1 pathogenicity determinant protein pdpC2 Virulence FPI Protein 0.0 99
pdpC1 YP_001891773.1 PdpC Not tested FPI Protein 0.0 99
pdpC2 YP_001892268.1 PdpC Not tested FPI Protein 0.0 99
pdpC1 YP_170306.1 hypothetical protein Not tested FPI Protein 0.0 99
pdpC AAP58966.1 PdpC Not tested FPI Protein 0.0 95