Gene Information

Name : F92_06330 (F92_06330)
Accession : YP_007009263.1
Strain : Francisella tularensis F92
Genome accession: NC_019537
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transketolase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1082629 - 1084620 bp
Length : 1992 bp
Strand : +
Note : COG0021 Transketolase

DNA sequence :
ATGTCTTTATCTATTCCACGCGAGTTTTCAAACGCTATAAGATTTTTATCTATTGATGCAACACTTAAAGCTAAATCAGG
ACATCCTGGAATGCCTATGGGGATGGCTGATATTGCCACAGTGTTATGGACAAAGTTTCTTAAGCACAATCCAAATAATC
CACATTGGATAAATAGAGATAGATTTGTTCTTTCAAATGGGCATGGCTCAATGCTTTTATATTCTCTGTTACATCTGACA
GGTTATGATCTATCTATTGAGGATATTAAAAATTTTAGGCAGTTACACTCAAAAACTCCAGGGCACCCTGAGTATGGCTA
TATGCCAGGAGTTGAGACAACAACTGGTCCATTAGGGCAAGGAGTAGCAAATGCTGTGGGTATGGCTTTAGGTGAAAAGC
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ATGGAGGGTGTTTCTCATGAAGCATGCTCATTAGCAGGGACTCTAGGTTTAAACAAATTAGTAGCATTTTGGGATGATAA
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TTATAGAAAATGTTGATGGTCATGAGTTTGTTGCGATTGAAAAAGCTATAAATGAAGCCCATTCTCAGCAGCAAAAACCA
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AATACTGGGATGCTAGGGAAAAAGGACAAGCTTTAGAAGCAAATTGGCAAGGGCAATGGAATTTATTTAAAGACAGTCCT
AAGTTTGACGAATTTGAACGAGTTTTAAGTAAAGAGTTGCCAGTTGGATTAGAAAGCGCTATTAATGACTATATAGCTTC
GCAATTGAGTAATCCTGTCAAAGTGGCAACACGTAAAGCTTCACAAATGGCGCTTGAAGTCTTGTGTAAGAATATGCCTG
AGATGTTTGGTGGATCAGCAGATTTGACAGGATCAAATAATACTAATTGGAGTGGTTCAGTTTGGCTAAATAATACTCAA
GAAGGCGCAAATTATCTTTCTTATGGTGTTAGAGAGTTTGGTATGGCTGCAATAATGAATGGTCTAAGCCTTTATGGTGG
TATCAAACCTTATGGTGGTACATTCTTGGTATTTAGCGATTATTCAAGAAACGCGATAAGAATGTCAGCGTTGATGAAAC
AGCCTGTAGTTCATGTTATGTCGCATGACTCAATTGGTTTGGGAGAAGATGGACCAACTCATCAACCTATAGAACATGTT
CCGAGTTTAAGACTTATACCTAACTTAAGTGTTTGGCGACCTGCTGATACAATTGAAACAATGATAGCATGGAAAGAGGC
TGTAAAATCTAAAGATACGCCAAGTGTAATGGTACTTACACGTCAAAACTTAATGCCAGTAGTGCAAACACAGCATCAGG
TAGCAAATATTGCTAGAGGTGGTTATCTAGTTAAAGATAATCCTGATGCTAAATTAACTATTGTTGCTACTGGCTCTGAA
GTTGAGCTTGCTGTCAAAGTTGCTAATGAATTTGAAAAGAAAGGTATAAAATTAAATGTTGCTTCTATACCGTGTGTAGA
AGTTTTTGCTACTCAAGCTCACGAGTATAAAAAAACAGTAATAAAAGATGATATCCCGGCAGTTTTTGTTGAGATGGCGC
AACCTGATATGTGGTATAAATATATGCCAAAAGCTGGAGGGGAAGTAAAAGGAATCTATAGCTTTGGTGAGTCAGCACCG
GTTGAAGATTTATTTAAACATTTTGGATTTACTGTAGAAAATATTAGCAATATTGTTGCTAAATATGTTTAA

Protein sequence :
MSLSIPREFSNAIRFLSIDATLKAKSGHPGMPMGMADIATVLWTKFLKHNPNNPHWINRDRFVLSNGHGSMLLYSLLHLT
GYDLSIEDIKNFRQLHSKTPGHPEYGYMPGVETTTGPLGQGVANAVGMALGEKLLSDRYNTPDLKVIDHHTYVFLGDGCL
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TLICCKTVIGFGSPEKAGTASVHGSPLSDQERASAAKELNWDYQAFEIPQDVYKYWDAREKGQALEANWQGQWNLFKDSP
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PSLRLIPNLSVWRPADTIETMIAWKEAVKSKDTPSVMVLTRQNLMPVVQTQHQVANIARGGYLVKDNPDAKLTIVATGSE
VELAVKVANEFEKKGIKLNVASIPCVEVFATQAHEYKKTVIKDDIPAVFVEMAQPDMWYKYMPKAGGEVKGIYSFGESAP
VEDLFKHFGFTVENISNIVAKYV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
tktA AAO17218.1 TktA Not tested tcd island Protein 0.0 56
APECO1_2641 YP_859417.1 transketolase Not tested Not named Protein 4e-180 55