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Name : kdpD (BN424_665) Accession : YP_008057954.1 Strain : Carnobacterium maltaromaticum LMA28 Genome accession: NC_019425 Putative virulence/resistance : Unknown Product : osmosensitive K+ channel His kinase sensor domain protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.3.- Position : 711445 - 714138 bp Length : 2694 bp Strand : + Note : [T] COG2205 Osmosensitive K+ channel histidine kinase DNA sequence : ATGCAGGAAGAGGATATACGGCCAGATCCAGATCAATTGTTACTACAAGTTGGGCAGGATGAGGAAACTACAATGGGGAA ATTACGTGTTTTTTTTGGGTATGCTGCTGGAGTAGGGAAAACTTACGGGATGCTGAAGGAAGCAATTGAACAACAAGAAA CCGGTAAAGTCGTTTTAGCTGGTTATGTAGAACCTCATGCACGTCCTGAAACAATGGCTTTATTAGATCATTTAAATCAA CTGCCTTCTAAAAAGATACCGTATAAAAATATGATGCTAGAGGAATTTGATTTGGATGAAGCACTTAGGCTACAGCCAGA AATAATTTTAGTTGATGAATTAGCACATACTAATGCTCTAGGCTCTAGAAATAAAAAAAGATACCAAGATATTGAAGAGC TATTACAAGCCGGTATAGATGTTTACACAACTGTAAATGTGCAACATATTGAAAGCTTAAATGATATTGTCGAGGATATC ACGCATGTTCGTGTGCATGAAACTGTGCCAGATTCATTTTTTGATGAGGCTCTTATTAAATTAATTGATGTAGAACCTGA TGAATTGTTGGGTCGTTTAAAAGAAGGTAAAATCTATCGTCCTGAGCATGCTAAGAAAGCTATGAATCACTTTTTTACAA AAGAAAATCTTAAATTACTTCGTGAAATTGCGATTCGTCGCGCTGCGGATCATATTGGAATGGATAATCGGATTGAAGAG GCTTATACAGAAAAACGGGCTCATGTTAAATTATTGACTTGTATTGATAGCGAACATCAAACAGGTGCTGAAAAATGTAT TCGTTGGACGGCTCGGTTAGCCAATGCTTTTCGCGCAGAGTGGGTTGTTCTTCATGTGGATGAAAGTGGAGATAATGAGA AAAGTGAAGCAGAATTGGCTTTGTTAAAACGAAATAATGAACTGGCTGAGCGCTTAGGAGCAGAAGTTGTCACGTTATCC GGTCATAATCCAGTGACGACAATTGCTCAATATGCCAAATTGACAGGCGTAACAGATATTATTATCGGAAAGCATCGTCG TAAATTGGATTATCAACGTCTGCTAAAGGATGATATTGAAGATCGCTTGATTAAACATTTAAGTAATGTTGAGTTGCATA TTGTGCCGTTTATTGAAAAATATCCACGAATTAAGAATCGCTTCTTTTCGAAAGAACGTTTAATTCCTAAAAATTTAACA ATAGCAGATAGTCTTAAAACGATGGTGTTATTATTAATGGCGACATTGCTATCAGAAATTTTTTCTTTTCTAGGAATTGG CGATCAAAATGTTATCGTGGTGTATTTGCTCTTTATTTTGATTATTTCACAAGTAACAACAGGCTATTTTTATGGAGTTT TATCTTCTATTATAAGCGTTATATTTTTTAATTGGTTTTTTGTAGATCCATTGTTTTCTCTGACCGTTTATAAAGCTGGT TACCCAATTACGTTATTAATCATGTTAATGGTTGCCTTATTTACCAGTAATATGATGATTCGTGTCAAAAGTCAAGCACG TGAATCAATAAAAAAAGAGCATCAAATGGGTGTCTTATACGATTTCAACAAAAAATTATTAGCTACTCGAAATCTAAATG GTATTATAAATTTAACCAATGATTACCTTGTAAGCACTATGAATCATAGTGTCATATTTTACACGGAGCAAGGGAAAAAT TTACTGAATCACAAAGCTTTAGCCTTCGAAAACAAGCAGGATATTGAGGTTTTAACGGGATCTGATGAAGAAGCTGTTGC TAATTGGGTTTTTAATAATCAAAAGGTTGCAGGTTACGGAACTGATACATTAATGGGTGCGAAGGGTTTTTATTTACCCG TCCTTTCTCAAGGGCGAGTTTTGGCTGTTATTGGTGTCTTGTTATCAAAAGAAAATCCATTGACACATGAGAATTTAAAC TTTTTAAAATTAATTGCATCTCAACTTTCTTTAGCTTTAGAAAGACAATATTTAGTTACAGAGCAACAACAAATCATGTT GGAAACTGAAAAAGAGAAAATGCGAAGTAATTTATTAAGAGCTATTTCTCATGATTTACGCACACCTTTGACAGGAATAC TAGGAGCTAGCTCAGCTATTCTTGAAAATAAAGATAAATTTGATGAGGAATTAAAACTGAGTTTAATTAAAGATATTAAA GAAGATTCAGAATGGCTTATCCGCATGGTAGAAAATCTATTGTCTGTTACCCGAATTGATGAAGGAACGATGAAAGTTAA AAAAATGCCGGAAGCTGTTGAAGAAATTGTTGCTGGTGCTGTGCGCCGCATTCGCAAACGATTTAAGGAACAAGAATTAA TAGTTAAAGTTCCAGATGAATTTTTATTGGTTCCGATGGATGGAACGTTGATTGAACAAGTTTTAATTAATTTAATGGAG AATGCGATTAAGCATTCTGGTTCAAAAGGCGCGATATCTGTCATTGTGAAGCGAAATCGGAACAAAGCTATTTTTGAAGT GACAGATAATGGTATTGGTATTCCAGAAAAAAAATTAGCTTCGTTGTTTGATCAATTTGGAAAAGAAAGTGACACACCAA TTGATGCAACTCGAGGAATGGGAATTGGATTGTCGATTTGTAAAACCATTGTTGCCGCTCATAGTGGTACAATAGAAGTG ACGAACAAGCAACAAGGTGGAGCTGTCTTTAGATTTACTTTACCAATAGATTAA Protein sequence : MQEEDIRPDPDQLLLQVGQDEETTMGKLRVFFGYAAGVGKTYGMLKEAIEQQETGKVVLAGYVEPHARPETMALLDHLNQ LPSKKIPYKNMMLEEFDLDEALRLQPEIILVDELAHTNALGSRNKKRYQDIEELLQAGIDVYTTVNVQHIESLNDIVEDI THVRVHETVPDSFFDEALIKLIDVEPDELLGRLKEGKIYRPEHAKKAMNHFFTKENLKLLREIAIRRAADHIGMDNRIEE AYTEKRAHVKLLTCIDSEHQTGAEKCIRWTARLANAFRAEWVVLHVDESGDNEKSEAELALLKRNNELAERLGAEVVTLS GHNPVTTIAQYAKLTGVTDIIIGKHRRKLDYQRLLKDDIEDRLIKHLSNVELHIVPFIEKYPRIKNRFFSKERLIPKNLT IADSLKTMVLLLMATLLSEIFSFLGIGDQNVIVVYLLFILIISQVTTGYFYGVLSSIISVIFFNWFFVDPLFSLTVYKAG YPITLLIMLMVALFTSNMMIRVKSQARESIKKEHQMGVLYDFNKKLLATRNLNGIINLTNDYLVSTMNHSVIFYTEQGKN LLNHKALAFENKQDIEVLTGSDEEAVANWVFNNQKVAGYGTDTLMGAKGFYLPVLSQGRVLAVIGVLLSKENPLTHENLN FLKLIASQLSLALERQYLVTEQQQIMLETEKEKMRSNLLRAISHDLRTPLTGILGASSAILENKDKFDEELKLSLIKDIK EDSEWLIRMVENLLSVTRIDEGTMKVKKMPEAVEEIVAGAVRRIRKRFKEQELIVKVPDEFLLVPMDGTLIEQVLINLME NAIKHSGSKGAISVIVKRNRNKAIFEVTDNGIGIPEKKLASLFDQFGKESDTPIDATRGMGIGLSICKTIVAAHSGTIEV TNKQQGGAVFRFTLPID |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| kdpD | NP_814336.1 | sensor histidine kinase KdpD | Not tested | Not named | Protein | 8e-180 | 47 |
| ef0090 | AAM75293.1 | EF0090 | Not tested | Not named | Protein | 3e-180 | 47 |
