Name : nifJ (BN424_3081) Accession : YP_006993817.2 Strain : Carnobacterium maltaromaticum LMA28 Genome accession: NC_019425 Putative virulence/resistance : Virulence Product : pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.2.7.1 Position : 3094494 - 3098051 bp Length : 3558 bp Strand : - Note : [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit DNA sequence : ATGAGAAGACAGAAAACAATGGATGGCAATACAGCAGCTGCCTATATTTCCTATGCTTTTACTGAAGTAGCTGCAATTTA CCCCATTACCCCCAGTTCAACAATGGCTGAATTAGTTGATCAATGGGCATCGGATGGCAAGAAAAATTTATTTGGACAAG AAGTAAAAATTGTTGAAATGCAATCAGAGGCGGGAGCTGCAGGCGTTGTTCATGGCTCGCTAAAAACGGGAACCATGACA ACCACATACACTGCTTCACAAGGATTATTATTAATGATTCCAAATATGTATAAGATTGCAGGAGAGTTATTGCCAACGGT ATTTCATGTAGCAAGTCGTGCAGTGACGACTAATGCATTGAACATTTTTGGTGACCATGGAGATGTCATGGCGGCTCGTC AAACGGGCTTTGCCATGTTAGCTGAAGGTAGTGTTCAAGAAGTTATGGACTTATCAGCAGTCGCTCATTTATCAACTTTA ACAAGTTCTTTGCCTTTTATGAACTTTTTCGATGGGTTTAGGACAAGTCATGAAATTCAAAAAATTGACGTATTAGAATA CGATGAATTAAAAGGTCTTATGGATAAAGACGCTCTGACCGCTTTTAGACATAATGGGATGAACCCAAATCATCCAACGG TCTCTGGGACCAATCAAAATCCTGATATTCATTTCCAACAAAGAGAAACGATTAATAGTCATTATGACCGCTTACCTGAA ATTGTTGAAAAATATATGCATGAAATCAACCAACTACGTGGAACTGATTATGAGTTAGTTAATTATTATGGAGCAGCTGA TGCGACAGATATTTTAATTGCTATGGGCTCTGTCACACCAGTCATTGAGCAAACCATTGATTATTTAAGACAAAGTGGAA AAAAAGTCGGTTTATTAAATATTCGCTTATATCGACCTTTCCCGGTTGAGCATTTTCTAAAGGCTGTACCGGAAACAGTT GAACGAGTTGCTGTTTTAGATCGAACAAAAGAGCCTGGTGCAGGTGGAGAGCCATTACTTTTAGATGTGCAAAGTGCTTT CTATGATTCAAAATTCCGACCAACTATTATTGGAGGACGTTATGGATTAGGGTCTAAAGATGTGACACCTGCTGATATTT TAGGGATTTTTGATCATTTAGCTACTGAAACAGAATTAAAAAGTCGATTTACAATTGGAATTGAAGATGATGTGACTTAT TTATCTCTGCCAAAAGGGGAAGAAGTTGATTTAACATCTGCTGGTACGTATCAAGCAAAATTCTGGGGTTTTGGTAGTGA TGGAACTGTTGGAGCTAATAAATCAGCGATTAAATTAATTGGGGATCATACAGATAAATATGTACAAGGTTATTTTTCCT ATGATTCGAAAAAATCGGGCGGCTTGACGGTATCTCATTTACGTTTTGGTGATAATCCAATAAAATCAACCTTTTTAATT GAGCAAGCTGATTTTATTGCTTGCCACACAGCGGCTTATTTATCTAAATATGATTTAGTTAAAGGTTTAAAAAAAGGTGG AACGTTCCTCTTAAATACAGTTTGGGATGATGAAAAATTAGCACAAATGCTCCCATACAAATTAAAGAAATATCTAGCTG AAAATGAGATTAAATTTTATACGATTAATGCGGTACAGTTAGCCAATCAAATTGGTTTGGGACGACGGATTAATACCATT ATGCAAACAGCCTTTTTTAAGGTTACCTCTATTATGCCGATTGCGGAAGTTGTAGAGTTGTTAAAAGCGGACGCAATGAA AACCTATGGACGTAAATCGCAAGAGATCGCTGAAAAAAATTGCCAAGCCATTGAAATGGCTGCAGAAATGGTCCATCAAG TTGAAGTGCCAAATACATGGTTAACAGAGCCTGAAATAAGTGAAGAACGAGATACCAACCACTTACCAAAATTTGTTTTT AATATTTTAGAACCGATGAATCGTCAAGAAGGCGATTCGTTAAGCGTTGGAACCCTAATAGAACATGGCATGACTAGTGG AGAAATTCCAGTTGGAATGGCAGCTTATGAAAAACGTGGTGTTGCTTTAGAAGTACCGGAATGGATTCCTGAAAACTGTA CGATGTGTAATGAGTGTGCGTTTGTTTGTCCCCATGCGGCAATTCGCCCATTCTTAGCGGATGAAGATGAAATGGAAGAG GCACCAGCTGGTTATATTGTTCGAGATATTCGTGGAGCTGACGGATTACAATATCGTATTCAAGTTGCAGTTGATGATTG TACGGGTTGTGGTTTATGTGTAGCAGCTTGTCCAGCTAAGGAAAAAGCGATAAAAATGCGTCCTTATGAAGAACAAAAAG AACAAGCTGTTAATTGGGCTTTCTCAATGACTTTAAAAGCTAAGAAAAATCCATTTAAGAAAAATACAGTTCGTGGCTCA CAGTTTGAACAACCTTTAGTTGAATTTTCTGGAGCATGCTCTGGTTGTGGGGAAACACCATATGTTAAACTTTTAACTCA GCTATTTGGCGATCGAATGATGGTGGCGAATGCTACAGGATGCTCTTCTATCTGGGGCGGTTCAAGTCCAGCAACTCCTT ATACAACGAATAGTGCAGGCTGCGGTCCAGCTTGGTCAAATTCATTATTAGAAGACAATGCCGAATTTGGTTTTGGTATG CATTTAGCTCATCAAACACGACGTGAAGGGATTGCGTTAAAAATGGGGCAAGCTATTGAAACTGGAACGATTAGTAGTGA ACTTGAAGAAGCCTTTACTGAATGGTTGACGGGAATCAATGAAAGTGATGGCACCCAAGAAAGGGCAGCTAACTTAAAAT TCTCATTAATCCAAGAAAAAACAGGAAATCCGATATTAGAAGCAATCTATGAAGAAAAGGATCTCTTTGTTAAACCTAGT CAATGGATGATTGGGGGAGATGGTTGGGCTTATGATATTGGTTTCGGTGGAATTGACCATGTTTTAGCTAGCGGCGAAGA TGTAAATATGCTTGTAATGGATAATGAAGTTTATTCAAATACTGGTGGACAAACATCTAAAGCGACACCAACATCGGCAA TTGCTAAATTTGCAGCTAGTGGCAAGTACGTATCTAAAAAAGATTTAGGGATGATGGCGATGAGCTATGGCAATGTTTAT GTCGCTCAAATTGCTTTAGGAGCAAATCAAGCGCAAACGATTAAAGCTATCGAGGAAGCTGAAAAATTCCCTGGACCTTC ATTGATTATTGCCTATACTCCATGTATTGTCCATGGCTTAATTGGTGGTATGGGGAATGCTCTAAAAGAAACAAAAGAAG CGGTAGAATCTGGCTATTGGTCGCTTTATCGTTTCAATCCAAGTTTGGCTGAAAAAGGGAAGAATCCAATGAGTTTAGAT TATAAAAAACCAGCTTTTGCTGATATGAAAGACTTTATGCTGACTCAAACACGCTTTACTTCTTTATTTAAAGCCAATCC AACAGTAGCTGATCATTTATTTGATAAAACGGTCAATGATGCAAAAATTAGATTTTATAATTATGCGCGACTGTCAGGAC AAGAAGAAAAAATCAGAGCTAAATTAGAAAAAGAATAA Protein sequence : MRRQKTMDGNTAAAYISYAFTEVAAIYPITPSSTMAELVDQWASDGKKNLFGQEVKIVEMQSEAGAAGVVHGSLKTGTMT TTYTASQGLLLMIPNMYKIAGELLPTVFHVASRAVTTNALNIFGDHGDVMAARQTGFAMLAEGSVQEVMDLSAVAHLSTL TSSLPFMNFFDGFRTSHEIQKIDVLEYDELKGLMDKDALTAFRHNGMNPNHPTVSGTNQNPDIHFQQRETINSHYDRLPE IVEKYMHEINQLRGTDYELVNYYGAADATDILIAMGSVTPVIEQTIDYLRQSGKKVGLLNIRLYRPFPVEHFLKAVPETV ERVAVLDRTKEPGAGGEPLLLDVQSAFYDSKFRPTIIGGRYGLGSKDVTPADILGIFDHLATETELKSRFTIGIEDDVTY LSLPKGEEVDLTSAGTYQAKFWGFGSDGTVGANKSAIKLIGDHTDKYVQGYFSYDSKKSGGLTVSHLRFGDNPIKSTFLI EQADFIACHTAAYLSKYDLVKGLKKGGTFLLNTVWDDEKLAQMLPYKLKKYLAENEIKFYTINAVQLANQIGLGRRINTI MQTAFFKVTSIMPIAEVVELLKADAMKTYGRKSQEIAEKNCQAIEMAAEMVHQVEVPNTWLTEPEISEERDTNHLPKFVF NILEPMNRQEGDSLSVGTLIEHGMTSGEIPVGMAAYEKRGVALEVPEWIPENCTMCNECAFVCPHAAIRPFLADEDEMEE APAGYIVRDIRGADGLQYRIQVAVDDCTGCGLCVAACPAKEKAIKMRPYEEQKEQAVNWAFSMTLKAKKNPFKKNTVRGS QFEQPLVEFSGACSGCGETPYVKLLTQLFGDRMMVANATGCSSIWGGSSPATPYTTNSAGCGPAWSNSLLEDNAEFGFGM HLAHQTRREGIALKMGQAIETGTISSELEEAFTEWLTGINESDGTQERAANLKFSLIQEKTGNPILEAIYEEKDLFVKPS QWMIGGDGWAYDIGFGGIDHVLASGEDVNMLVMDNEVYSNTGGQTSKATPTSAIAKFAASGKYVSKKDLGMMAMSYGNVY VAQIALGANQAQTIKAIEEAEKFPGPSLIIAYTPCIVHGLIGGMGNALKETKEAVESGYWSLYRFNPSLAEKGKNPMSLD YKKPAFADMKDFMLTQTRFTSLFKANPTVADHLFDKTVNDAKIRFYNYARLSGQEEKIRAKLEKE |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
unnamed | AFJ97267.1 | pyruvate ferredoxin | Virulence | Not named | Protein | 0.0 | 52 |