Gene Information

Name : nifJ (BN424_3081)
Accession : YP_006993817.2
Strain : Carnobacterium maltaromaticum LMA28
Genome accession: NC_019425
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 1.2.7.1
Position : 3094494 - 3098051 bp
Length : 3558 bp
Strand : -
Note : [C] COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit

DNA sequence :
ATGAGAAGACAGAAAACAATGGATGGCAATACAGCAGCTGCCTATATTTCCTATGCTTTTACTGAAGTAGCTGCAATTTA
CCCCATTACCCCCAGTTCAACAATGGCTGAATTAGTTGATCAATGGGCATCGGATGGCAAGAAAAATTTATTTGGACAAG
AAGTAAAAATTGTTGAAATGCAATCAGAGGCGGGAGCTGCAGGCGTTGTTCATGGCTCGCTAAAAACGGGAACCATGACA
ACCACATACACTGCTTCACAAGGATTATTATTAATGATTCCAAATATGTATAAGATTGCAGGAGAGTTATTGCCAACGGT
ATTTCATGTAGCAAGTCGTGCAGTGACGACTAATGCATTGAACATTTTTGGTGACCATGGAGATGTCATGGCGGCTCGTC
AAACGGGCTTTGCCATGTTAGCTGAAGGTAGTGTTCAAGAAGTTATGGACTTATCAGCAGTCGCTCATTTATCAACTTTA
ACAAGTTCTTTGCCTTTTATGAACTTTTTCGATGGGTTTAGGACAAGTCATGAAATTCAAAAAATTGACGTATTAGAATA
CGATGAATTAAAAGGTCTTATGGATAAAGACGCTCTGACCGCTTTTAGACATAATGGGATGAACCCAAATCATCCAACGG
TCTCTGGGACCAATCAAAATCCTGATATTCATTTCCAACAAAGAGAAACGATTAATAGTCATTATGACCGCTTACCTGAA
ATTGTTGAAAAATATATGCATGAAATCAACCAACTACGTGGAACTGATTATGAGTTAGTTAATTATTATGGAGCAGCTGA
TGCGACAGATATTTTAATTGCTATGGGCTCTGTCACACCAGTCATTGAGCAAACCATTGATTATTTAAGACAAAGTGGAA
AAAAAGTCGGTTTATTAAATATTCGCTTATATCGACCTTTCCCGGTTGAGCATTTTCTAAAGGCTGTACCGGAAACAGTT
GAACGAGTTGCTGTTTTAGATCGAACAAAAGAGCCTGGTGCAGGTGGAGAGCCATTACTTTTAGATGTGCAAAGTGCTTT
CTATGATTCAAAATTCCGACCAACTATTATTGGAGGACGTTATGGATTAGGGTCTAAAGATGTGACACCTGCTGATATTT
TAGGGATTTTTGATCATTTAGCTACTGAAACAGAATTAAAAAGTCGATTTACAATTGGAATTGAAGATGATGTGACTTAT
TTATCTCTGCCAAAAGGGGAAGAAGTTGATTTAACATCTGCTGGTACGTATCAAGCAAAATTCTGGGGTTTTGGTAGTGA
TGGAACTGTTGGAGCTAATAAATCAGCGATTAAATTAATTGGGGATCATACAGATAAATATGTACAAGGTTATTTTTCCT
ATGATTCGAAAAAATCGGGCGGCTTGACGGTATCTCATTTACGTTTTGGTGATAATCCAATAAAATCAACCTTTTTAATT
GAGCAAGCTGATTTTATTGCTTGCCACACAGCGGCTTATTTATCTAAATATGATTTAGTTAAAGGTTTAAAAAAAGGTGG
AACGTTCCTCTTAAATACAGTTTGGGATGATGAAAAATTAGCACAAATGCTCCCATACAAATTAAAGAAATATCTAGCTG
AAAATGAGATTAAATTTTATACGATTAATGCGGTACAGTTAGCCAATCAAATTGGTTTGGGACGACGGATTAATACCATT
ATGCAAACAGCCTTTTTTAAGGTTACCTCTATTATGCCGATTGCGGAAGTTGTAGAGTTGTTAAAAGCGGACGCAATGAA
AACCTATGGACGTAAATCGCAAGAGATCGCTGAAAAAAATTGCCAAGCCATTGAAATGGCTGCAGAAATGGTCCATCAAG
TTGAAGTGCCAAATACATGGTTAACAGAGCCTGAAATAAGTGAAGAACGAGATACCAACCACTTACCAAAATTTGTTTTT
AATATTTTAGAACCGATGAATCGTCAAGAAGGCGATTCGTTAAGCGTTGGAACCCTAATAGAACATGGCATGACTAGTGG
AGAAATTCCAGTTGGAATGGCAGCTTATGAAAAACGTGGTGTTGCTTTAGAAGTACCGGAATGGATTCCTGAAAACTGTA
CGATGTGTAATGAGTGTGCGTTTGTTTGTCCCCATGCGGCAATTCGCCCATTCTTAGCGGATGAAGATGAAATGGAAGAG
GCACCAGCTGGTTATATTGTTCGAGATATTCGTGGAGCTGACGGATTACAATATCGTATTCAAGTTGCAGTTGATGATTG
TACGGGTTGTGGTTTATGTGTAGCAGCTTGTCCAGCTAAGGAAAAAGCGATAAAAATGCGTCCTTATGAAGAACAAAAAG
AACAAGCTGTTAATTGGGCTTTCTCAATGACTTTAAAAGCTAAGAAAAATCCATTTAAGAAAAATACAGTTCGTGGCTCA
CAGTTTGAACAACCTTTAGTTGAATTTTCTGGAGCATGCTCTGGTTGTGGGGAAACACCATATGTTAAACTTTTAACTCA
GCTATTTGGCGATCGAATGATGGTGGCGAATGCTACAGGATGCTCTTCTATCTGGGGCGGTTCAAGTCCAGCAACTCCTT
ATACAACGAATAGTGCAGGCTGCGGTCCAGCTTGGTCAAATTCATTATTAGAAGACAATGCCGAATTTGGTTTTGGTATG
CATTTAGCTCATCAAACACGACGTGAAGGGATTGCGTTAAAAATGGGGCAAGCTATTGAAACTGGAACGATTAGTAGTGA
ACTTGAAGAAGCCTTTACTGAATGGTTGACGGGAATCAATGAAAGTGATGGCACCCAAGAAAGGGCAGCTAACTTAAAAT
TCTCATTAATCCAAGAAAAAACAGGAAATCCGATATTAGAAGCAATCTATGAAGAAAAGGATCTCTTTGTTAAACCTAGT
CAATGGATGATTGGGGGAGATGGTTGGGCTTATGATATTGGTTTCGGTGGAATTGACCATGTTTTAGCTAGCGGCGAAGA
TGTAAATATGCTTGTAATGGATAATGAAGTTTATTCAAATACTGGTGGACAAACATCTAAAGCGACACCAACATCGGCAA
TTGCTAAATTTGCAGCTAGTGGCAAGTACGTATCTAAAAAAGATTTAGGGATGATGGCGATGAGCTATGGCAATGTTTAT
GTCGCTCAAATTGCTTTAGGAGCAAATCAAGCGCAAACGATTAAAGCTATCGAGGAAGCTGAAAAATTCCCTGGACCTTC
ATTGATTATTGCCTATACTCCATGTATTGTCCATGGCTTAATTGGTGGTATGGGGAATGCTCTAAAAGAAACAAAAGAAG
CGGTAGAATCTGGCTATTGGTCGCTTTATCGTTTCAATCCAAGTTTGGCTGAAAAAGGGAAGAATCCAATGAGTTTAGAT
TATAAAAAACCAGCTTTTGCTGATATGAAAGACTTTATGCTGACTCAAACACGCTTTACTTCTTTATTTAAAGCCAATCC
AACAGTAGCTGATCATTTATTTGATAAAACGGTCAATGATGCAAAAATTAGATTTTATAATTATGCGCGACTGTCAGGAC
AAGAAGAAAAAATCAGAGCTAAATTAGAAAAAGAATAA

Protein sequence :
MRRQKTMDGNTAAAYISYAFTEVAAIYPITPSSTMAELVDQWASDGKKNLFGQEVKIVEMQSEAGAAGVVHGSLKTGTMT
TTYTASQGLLLMIPNMYKIAGELLPTVFHVASRAVTTNALNIFGDHGDVMAARQTGFAMLAEGSVQEVMDLSAVAHLSTL
TSSLPFMNFFDGFRTSHEIQKIDVLEYDELKGLMDKDALTAFRHNGMNPNHPTVSGTNQNPDIHFQQRETINSHYDRLPE
IVEKYMHEINQLRGTDYELVNYYGAADATDILIAMGSVTPVIEQTIDYLRQSGKKVGLLNIRLYRPFPVEHFLKAVPETV
ERVAVLDRTKEPGAGGEPLLLDVQSAFYDSKFRPTIIGGRYGLGSKDVTPADILGIFDHLATETELKSRFTIGIEDDVTY
LSLPKGEEVDLTSAGTYQAKFWGFGSDGTVGANKSAIKLIGDHTDKYVQGYFSYDSKKSGGLTVSHLRFGDNPIKSTFLI
EQADFIACHTAAYLSKYDLVKGLKKGGTFLLNTVWDDEKLAQMLPYKLKKYLAENEIKFYTINAVQLANQIGLGRRINTI
MQTAFFKVTSIMPIAEVVELLKADAMKTYGRKSQEIAEKNCQAIEMAAEMVHQVEVPNTWLTEPEISEERDTNHLPKFVF
NILEPMNRQEGDSLSVGTLIEHGMTSGEIPVGMAAYEKRGVALEVPEWIPENCTMCNECAFVCPHAAIRPFLADEDEMEE
APAGYIVRDIRGADGLQYRIQVAVDDCTGCGLCVAACPAKEKAIKMRPYEEQKEQAVNWAFSMTLKAKKNPFKKNTVRGS
QFEQPLVEFSGACSGCGETPYVKLLTQLFGDRMMVANATGCSSIWGGSSPATPYTTNSAGCGPAWSNSLLEDNAEFGFGM
HLAHQTRREGIALKMGQAIETGTISSELEEAFTEWLTGINESDGTQERAANLKFSLIQEKTGNPILEAIYEEKDLFVKPS
QWMIGGDGWAYDIGFGGIDHVLASGEDVNMLVMDNEVYSNTGGQTSKATPTSAIAKFAASGKYVSKKDLGMMAMSYGNVY
VAQIALGANQAQTIKAIEEAEKFPGPSLIIAYTPCIVHGLIGGMGNALKETKEAVESGYWSLYRFNPSLAEKGKNPMSLD
YKKPAFADMKDFMLTQTRFTSLFKANPTVADHLFDKTVNDAKIRFYNYARLSGQEEKIRAKLEKE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed AFJ97267.1 pyruvate ferredoxin Virulence Not named Protein 0.0 52