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Name : secA (BN424_2734) Accession : YP_006993472.2 Strain : Carnobacterium maltaromaticum LMA28 Genome accession: NC_019425 Putative virulence/resistance : Unknown Product : preprotein translocase, SecA subunit Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2715214 - 2717733 bp Length : 2520 bp Strand : - Note : [U] COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase) DNA sequence : ATGGCTAATTTTTTAAAGCAGTTAATTGAAAACGATAAAAAAGAAATTAAAAGCCTAGAAAAAGTTGCTGATAAGATTGA TGCTTATGGCGATCGAATGGCGGCTTTATCTGACGAAGAGTTACAAGCAAAAACACCTGAATTTAAGAAACGTTACCAAG CGGGTGAAACATTAGATGATCTTTTACCAGAGGCATTTGCAGTTGTTCGTGAAGCTGCTAAACGTGTTTTGGGATTGTAC CCTTACCGTGTCCAATTAATGGGTGGAATGACTTTGCATAAAGGGAATATCCCTGAAATGAAAACAGGTGAAGGGAAAAC CTTGACTGCGACAATGCCGGTTTACTTAAATGCATTAGCAGGCGAAGGGGTTCATGTTGTTACAGTAAATGAATATTTAG CAAGTCGTGATGCAACAGAAATGGGAGAGTTATATACTTTCTTAGGATTAACTGTTGGGTTGAATTTAAATTCTAAAAGT TCAGAAGAAAAACGTGAAGCGTACAATGCTGATATTACCTACAGTACAAATAATGAATTAGGTTTTGATTACCTAAGAGA CAACATGGTTGTTTACCGTGAACAAATGGTTCAACGTCCATTAAACTATGCGATTGTGGATGAAGTCGATTCAATCTTAA TTGATGAAGCGAGAACGCCGCTAATTATTTCAGGACAAGCTGAAAAATCAACAGCGTTGTATACACGTGCTGACTTTTTT GTGAAAAGTTTGACAGCTGAAGCAGATTATACTATTGATGTTCAATCAAAAACAATTGCATTAACTGAAGAAGGTATGGT TAAAGCTGAGAAAACCTTTAAAGTTGAAAACTTATATGATATTGATAATACAGCCTTGATTCACCACATTGATCAAGCAT TACGTGCGAACTACATTATGTTACGTGATATTGATTATGTTGTTCAAGAAGGTGAAGTACTGATTGTTGATCAATTTACA GGTCGTATTATGGATGGTCGTCGTTATTCAGATGGTTTACACCAAGCGATCGAAGCTAAAGAAGGCGTTGAAATTGAAAA TGAATCAAAAACAATGGCCAATGTAACGTTCCAAAACTTCTTTAGAATGTATAAAAAATTATCTGGAATGACTGGTACTG CTAAAACAGAACAAGAAGAATTCCGCGAAATTTACAATATACAAGTAGTTGAAATCCCAACGAATAAGCCGATTATTCGT GATGATCGTCCTGATTTATTGTATCCAACATTAGAAAGTAAATTTAATGCAGTGGTTGAGGACATTAAAACACGTCATGC TAATGGACAGCCAATTTTAGTTGGTACTGTAGCTGTTGAAACATCTGAATTATTATCAGATCTATTAACTAAAGCTAAAA TCCATCATGAAGTTTTAAATGCTAAAAATCACTTTAAAGAAGCTGAAATTATCATGAGCGCAGGTCAAAAAGGAGCAGTT ACCATCGCAACGAATATGGCTGGACGTGGTACAGATATCAAGTTAGGTGCTGGCGTTATTGAAGCTGGTGGTTTATGTGT TATTGGCACTGAGCGTCATGAGTCACGACGTATTGATAATCAATTACGTGGTCGTGCTGGTCGTCAAGGAGATCCTGGGG TGACTCAATTCTATCTATCATTAGAAGATGAATTGATGAAACGATTTGGTTCTGAAAGAATCCAAGCAATTTTAGAACGT TTAAGAGTTCAAGAAGAAGATGCGGTTATCCAAAGTAAAATGATTTCACGTCAAGTTGAATCTGCACAAAAACGTGTTGA AGGAAACAACTATGATACTCGTAAAAACGTTTTAGAATATGATGATGTTATGCGTGAACAACGTGAAATTATGTACGGAC AACGTTTGGAAGTTATTATGGCAACTGAATCATTGAAAAAAATTACAATGGCTATGATTCAACGTACAGTGAATCGTATG GTAAGTGTTAACACACAAGGAAATAAAGAAGAGTGGAACTTACAAGGTATTCATGATTTTGCAACATCTGCAATTGTCCA TGAAGATAGCTTGACTGTTCAAGATTTAGAGAACAAAACACCAGAAGAAATTGAAGCTTTATTAATGAAACGTGTTGAAG ACATCTATACAACTAAAGAACAACAATTTAACGAACAAATGCTTGAATTTGAAAAAGTTGTTATTCTACGTGTTGTTGAT AGTAAGTGGACAGATCATATCGATACAATGGATCAACTACGTCAAGGAATTGGTTTACGAGCATATGCGCAAACAAATCC ACTGGTTGAATACCAAGCTGAAGGATTCAAATTATTTGAAGAAATGATTGCAGCAATCGAATATGATGTAACACGTCTAT TGATGAAATCAGAAATTAGACAAAATCTACAAAGAGAACAAGTGGCTCAAGGTTCACCAGCCCGTTCAACAGGTGATGGG GACGTAGTAGAAGCTGCAAAACATAAACCAGTTAAGAACGATGATAAGATTGGTAGAAATGATCCATGTCCATGTGGCAG TGGCAAAAAATATAAAAATTGTCATGGCAAGGATAAATAG Protein sequence : MANFLKQLIENDKKEIKSLEKVADKIDAYGDRMAALSDEELQAKTPEFKKRYQAGETLDDLLPEAFAVVREAAKRVLGLY PYRVQLMGGMTLHKGNIPEMKTGEGKTLTATMPVYLNALAGEGVHVVTVNEYLASRDATEMGELYTFLGLTVGLNLNSKS SEEKREAYNADITYSTNNELGFDYLRDNMVVYREQMVQRPLNYAIVDEVDSILIDEARTPLIISGQAEKSTALYTRADFF VKSLTAEADYTIDVQSKTIALTEEGMVKAEKTFKVENLYDIDNTALIHHIDQALRANYIMLRDIDYVVQEGEVLIVDQFT GRIMDGRRYSDGLHQAIEAKEGVEIENESKTMANVTFQNFFRMYKKLSGMTGTAKTEQEEFREIYNIQVVEIPTNKPIIR DDRPDLLYPTLESKFNAVVEDIKTRHANGQPILVGTVAVETSELLSDLLTKAKIHHEVLNAKNHFKEAEIIMSAGQKGAV TIATNMAGRGTDIKLGAGVIEAGGLCVIGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDPGVTQFYLSLEDELMKRFGSERIQAILER LRVQEEDAVIQSKMISRQVESAQKRVEGNNYDTRKNVLEYDDVMREQREIMYGQRLEVIMATESLKKITMAMIQRTVNRM VSVNTQGNKEEWNLQGIHDFATSAIVHEDSLTVQDLENKTPEEIEALLMKRVEDIYTTKEQQFNEQMLEFEKVVILRVVD SKWTDHIDTMDQLRQGIGLRAYAQTNPLVEYQAEGFKLFEEMIAAIEYDVTRLLMKSEIRQNLQREQVAQGSPARSTGDG DVVEAAKHKPVKNDDKIGRNDPCPCGSGKKYKNCHGKDK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 9e-140 | 42 |
