|
Name : copB (BN424_1426) Accession : YP_006992182.2 Strain : Carnobacterium maltaromaticum LMA28 Genome accession: NC_019425 Putative virulence/resistance : Resistance Product : copper-translocating P-type ATPase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.6.3.4 Position : 1468148 - 1470190 bp Length : 2043 bp Strand : + Note : [P] COG2217 Cation transport ATPase DNA sequence : ATGCACGAACATAATCATTCGATGATGTCTCACGATGAGATGGATCATATGTCACACGAATCAATGCCTGGTATGGGACA TATGGCTCATATGGGTAATTTAAAAGTAAAATTTTTCTGGTCATTAGTTTTAGCAATTCCAATTATTATTTTATCTCCTA TGATGGGCATGGAATTACCGTTTCAATTTACATTTCCAGGATCTGATTGGCTTGTTTTAATTCTAGCAACGATTCTATTT ATTTATGGTGGAAAACCATTTTTAAGTGGTGCTAAAATGGAGCTGAAAGATAGAAGTCCAGCAATGATGACGTTAATTTC ACTAGGTATTTCAGTGGCTTATTTTTATAGTTTATATGCCTTTATTATGAATCATTTTATTAATTCCAATGCTCATATAA TGGATTTCTTTTGGGAATTAGCTACGTTAATTGTAATTATGCTATTAGGCCATTGGATTGAAATGCGCGCTGTGAGCAAT GCTGGAGATGCTTTGAAAAAAATGGCTGAACTTTTGCCAACTCAAGCTAATCGCTTGGAAAAAGATGGTTCAAGTAAAAA GATTTTATTAAAAGAGGTTCAGGTAGGAGATTTACTTTTAATTAAAGCGGGTGAAAAAATTCCAGCCGATGGTAAAATTG TTGAAGGTCAATCTTCGATCAATGAATCTATGGTAACTGGTGAGGCAAAAGAGGTTAAAAAAAATCGTGGTGATAAGGTC ATCGGAGGAGCTGTAAACGGCAGCGGTACTTTGACTATTGAGGTGTCTGGAACAGGAGATACGGGTTATTTAGCTCAAGT AATGAATTTAGTTGGAGATGCTCAAAAAGAAAAATCAAAAGTAGAATCTTTATCAGATAAAGTGGCAAAATGGCTATTTT ATGTAGCGCTTTTCGTTGGGATCTTTACCTTCATTATCTGGTTTTTCTTAACTAAAGAATTGACTACGCCTTTAGAACGA ATGGTGACTGTCCTAGTGATTGCGTGTCCCCATGCATTGGGTTTGGCTATTCCGTTAGTAACGGCACGTTCGACTTCATT AGGTGCTAAAAATGGATTGTTGATTCGGAATCGCAATGCTTTAGAAGCAGCCAAAAAAATTGATAGTATCTTAATGGATA AAACAGGTACCTTAACTGAAGGGGCTTTTAAAGTTCATACAGTTGAAAGTTTAACTAAAGAGTATTCAGAGGAACAAATT TTAGCTTACTTTGCAGCTCTAGAACGGACATCTACTCATCCTTTGGCTGTAGGGATTTTAACGAAGGCAGAAGCAGAAAA AGTGACTATTCCAGTCGCTACTGAAACGAAAAACATGCCAGGAATTGGCTTGTCAGGTAAAATTAATCAAGAAGAGATTT CTATTGTAACGGCGGCTTATTTAGAAAAGATGGGGATTGTTTATGACAAAAAGCATTTTGAAGAATTAGCTAGTTTAGGC AATTCAATTAGCTATCTAGTTCGCAAAGGTGAGGCTGTTGGCTTAATCGCTCAAGGCGATAAAATTAAATCTGGAGCTAA AGCTATGATAGCTGCTCTGATTGCTGAAGGGATTGAACCAGTGATGGTAACTGGAGATAACGCAGCATCAGCTGAAATGG TAGCCAATCAGCTAGGAATCAATCAGGTTTATGCAGGTTTAATGCCAGAAGATAAAGAAAAAATTGTGAAAGATTATCAA AAAAATAAAAAAGTTGTGATGATGGTTGGAGATGGTGTCAATGATGCACCAAGTTTAGCAAGGGCAGATGTAGGAGTTGC GATTGGTGCAGGAACAGATATTGCCATTGATTCTGCGGATGTTATTTTGGTTAAAAGTGATCCAAATGATATCTTACATT TTCTCTCATTAGCAAAAAATACAACGCGAAAAATGATTCAAAACTTATGGTGGGGAGCAGGCTATAATATTATTGCCATT CCATTAGCTGCTGGTATTTTAGCGCCGATTGGTTTTATCTTAAGTCCAGCAGTAGGTGCGATTTTGATGTCACTAAGTAC GGTAATTGTGGCTTTAAATGCACTTACGTTAAGAATCAAATAA Protein sequence : MHEHNHSMMSHDEMDHMSHESMPGMGHMAHMGNLKVKFFWSLVLAIPIIILSPMMGMELPFQFTFPGSDWLVLILATILF IYGGKPFLSGAKMELKDRSPAMMTLISLGISVAYFYSLYAFIMNHFINSNAHIMDFFWELATLIVIMLLGHWIEMRAVSN AGDALKKMAELLPTQANRLEKDGSSKKILLKEVQVGDLLLIKAGEKIPADGKIVEGQSSINESMVTGEAKEVKKNRGDKV IGGAVNGSGTLTIEVSGTGDTGYLAQVMNLVGDAQKEKSKVESLSDKVAKWLFYVALFVGIFTFIIWFFLTKELTTPLER MVTVLVIACPHALGLAIPLVTARSTSLGAKNGLLIRNRNALEAAKKIDSILMDKTGTLTEGAFKVHTVESLTKEYSEEQI LAYFAALERTSTHPLAVGILTKAEAEKVTIPVATETKNMPGIGLSGKINQEEISIVTAAYLEKMGIVYDKKHFEELASLG NSISYLVRKGEAVGLIAQGDKIKSGAKAMIAALIAEGIEPVMVTGDNAASAEMVANQLGINQVYAGLMPEDKEKIVKDYQ KNKKVVMMVGDGVNDAPSLARADVGVAIGAGTDIAIDSADVILVKSDPNDILHFLSLAKNTTRKMIQNLWWGAGYNIIAI PLAAGILAPIGFILSPAVGAILMSLSTVIVALNALTLRIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SH0105 | YP_252020.1 | hypothetical protein | Not tested | SCCmec | Protein | 7e-140 | 58 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| copB | YP_006992182.2 | copper-translocating P-type ATPase | BAC0079 | Protein | 0.0 | 63 |
| copB | YP_006992182.2 | copper-translocating P-type ATPase | BAC0383 | Protein | 2e-140 | 50 |
| copB | YP_006992182.2 | copper-translocating P-type ATPase | BAC0629 | Protein | 3e-126 | 48 |
