|
Name : polA (BN424_1142) Accession : YP_006991899.2 Strain : Carnobacterium maltaromaticum LMA28 Genome accession: NC_019425 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I family protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.7.7 Position : 1189810 - 1192470 bp Length : 2661 bp Strand : + Note : [L] COG0749 DNA polymerase I - 3'-5' exonuclease and polymerase domains DNA sequence : ATGACAAAAAAAAATAAATTACTATTAATTGATGGTAGTAGTATTGCGTTTCGAGCGTTTTATGCAATTCCAGGTTCATT AGATCGTTTTATGAATAAAAATGGTTTACACACAAATGCGCTGTTTAGTTTTCATCGTATGTTAGACAATGAAATGAAAA AAGAGCAACCTACTCATGTTCTAGTTGCTTTTGATGCTGGGAAAACAACTTTTCGTAATGCTTTTTACGATGCCTATAAA GATGGTCGCCAAAAAACGCCAGGTGAATTTAAAGAACAAATGCCTTATTTGCGTGACTTGTTAGAAGGTTTTGGGATTCC TCATTATGAGTTAGATAATTATGAAGCGGATGATATTATTGGGACATTAGCTACTGTTGTTGATCCAAATGAATTTGATG TTGTTGTAGTTTCAGGTGACCGAGATTTAACTCAGTTAGCGAAAGAAAATGTGCGAGTAGATATTACAATTAAAGGTGTT AGTGAAATTGAAGAGAATACACCTGCCTATCTAATGGAAAAATATGGCATTGAACCTCATCAAATTATTGACATGAAAGG TTTAGCTGGAGATTCTTCTGATAATATTCCAGGAGTAACAAATATTGGAGAAAAAACAGCTTTAAAACTGTTACATGAAT TTGGTTCTGTTGAAGGTGTTTATGAAAATATAGATGGCATGAAGCCAAGTAAACGTAAAGAAAATCTGATTAACGATAAA GAACAAGCTTTGTTAAGTAAAAAATTAGCAACGATTGAGGTCGATGCTCCACTTGAAATAAAAGTAGATGAATTGCTTTA CACTGGCAAAGATGTTGGTAAGCTAATAGAGTTTTATAAAGAAATGGATTTCAAGTCATTCCTAAAAGATTTGGATACAA CAGAGTATGATGAAGAAAATAAAATTGAAAAAGCCGAAATTATTTTTGAATTTGTTACAGAATTAAAAGCGGATATGTTT GGGCCAATCGGCGGATTATATGTCGAAATGCTAACGGATAATTATCACACTGCGGAGATTGTTGGTTTAAGTTGGAGTAA TGGTGAGAAGATTTATGTTGCAGAACCTGACGTAGCTTTGGCATCTCCTATTTTTCAAGAGTGGGCCAAAGATCCAGAAA ATAAAAAACAAGTTTTTGATGCAAAACGTACAGTTGTGGCTTTACAACGTTACGATACAACCTTAGAAGGGGTTGATTTT GACGTCCTACTAGCATCTTACATTCTAAATACAAATGATAATAGTAAAGATTTAGCCGAAGTAGCTATGGAACATGATTA TTATGAAGTTGCTGCAGATGAAAGCATTTATGGAAAAGGGGCTAAGCTTGCCATACCAGAAGATGCTTCTGTTTTGAATG AACATCTTGCTCGAAAAATTAAAGCAATAGAAGTCTTAAGTATCAAATTAAAGCAAGAGTTGATTGATAGCGAACAAACA GCTTTATTTTATGAGATGGAATTGCCTTTATCCATGGTGTTAGCTGAAATGGAAATGACTGGAATTAAAGTCAATGCGAA TCGTTTACTAGAAATGAAAGCTGAGTTTGCCATTCGTTTAACAGATATTGAAAATCGCATTTACGAAGAAGCTGGAGAAA CATTTAATATTAATTCTCCTAAGCAATTAGGTGTGATTTTATTTGAAAAAATGCAGTTACCAGTTATTAAGAAAACAAAA ACGGGTTATTCAACGGCTGTTGATGTTTTAGAACAACTGCGCCCACAAGCACCGATTGTAGATGATATTTTACATTATCG TCAAATTGCTAAAATCCAATCAACCTATGTTGAAGGATTATTAAAAGTTATTAACGGGAATACAGGAAAAGTTCATACTA GATATGTTCAAACGTTAACTCAAACGGGCCGTCTAAGCTCTGTTGATCCTAATTTACAAAATATCCCGATTCGCTTAGAA GAAGGTCGCAAAATTCGTCAAGCTTTTGTACCAAGTCATGAGGGCTGGAAGATCTTTGCTAGTGATTATTCACAAATTGA ATTGCGTGTTTTAGCGGATATTTCAAATGATCAGCATTTGAAAGAAGCCTTTTTAGAAGGTCAGGATATTCACTCAAGTA CAGCAATGCGTGTTTTTGGCATTGAAAAAGCTGAAGATGTAACTGGGAATATGCGCCGTCAAGCAAAAGCCGTGAACTTT GGAATTGTCTATGGTATCAGTGATTATGGTTTATCGCAAAATCTTGGAATAACCAGAAAAGAAGCACAAACCTTCATAGA TACTTATTTTGAAAAGTATCCTGGAGTAAAACAATATATGAGTGATATCGTTCGAGAAGCTAAGGATAAAGGCTATGTAG AAACTTTATTCCATCGCCGTCGTTTCTTAAAAGATATTAATTCACGCAACTTTAATCTACGCTCATTTGCTGAAAGAACA GCGATGAATACACCGATTCAAGGTAGTGCTGCCGATATTATTAAAGTTGCCATGATTCAAATGGATCGTCGCTTAAAAGC CGAGAATTTAAAAACAAAGATGTTGCTACAAGTACATGATGAATTGATTTTTGAGGCACCTGAGGAAGAAATTGCTATTT TAGAAAAATTAGTTCCTGAGGTTATGGAATCAGCAGTTAAATTAAATGTACCTTTAAAAGTCGATAGCAGCTATGGTGAT AGTTGGTACGATGCAAAATAA Protein sequence : MTKKNKLLLIDGSSIAFRAFYAIPGSLDRFMNKNGLHTNALFSFHRMLDNEMKKEQPTHVLVAFDAGKTTFRNAFYDAYK DGRQKTPGEFKEQMPYLRDLLEGFGIPHYELDNYEADDIIGTLATVVDPNEFDVVVVSGDRDLTQLAKENVRVDITIKGV SEIEENTPAYLMEKYGIEPHQIIDMKGLAGDSSDNIPGVTNIGEKTALKLLHEFGSVEGVYENIDGMKPSKRKENLINDK EQALLSKKLATIEVDAPLEIKVDELLYTGKDVGKLIEFYKEMDFKSFLKDLDTTEYDEENKIEKAEIIFEFVTELKADMF GPIGGLYVEMLTDNYHTAEIVGLSWSNGEKIYVAEPDVALASPIFQEWAKDPENKKQVFDAKRTVVALQRYDTTLEGVDF DVLLASYILNTNDNSKDLAEVAMEHDYYEVAADESIYGKGAKLAIPEDASVLNEHLARKIKAIEVLSIKLKQELIDSEQT ALFYEMELPLSMVLAEMEMTGIKVNANRLLEMKAEFAIRLTDIENRIYEEAGETFNINSPKQLGVILFEKMQLPVIKKTK TGYSTAVDVLEQLRPQAPIVDDILHYRQIAKIQSTYVEGLLKVINGNTGKVHTRYVQTLTQTGRLSSVDPNLQNIPIRLE EGRKIRQAFVPSHEGWKIFASDYSQIELRVLADISNDQHLKEAFLEGQDIHSSTAMRVFGIEKAEDVTGNMRRQAKAVNF GIVYGISDYGLSQNLGITRKEAQTFIDTYFEKYPGVKQYMSDIVREAKDKGYVETLFHRRRFLKDINSRNFNLRSFAERT AMNTPIQGSAADIIKVAMIQMDRRLKAENLKTKMLLQVHDELIFEAPEEEIAILEKLVPEVMESAVKLNVPLKVDSSYGD SWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 59 |
