Name : C694_06100 (C694_06100) Accession : YP_006935098.1 Strain : Helicobacter pylori 26695 Genome accession: NC_018939 Putative virulence/resistance : Unknown Product : pyrimidine nucleoside transport protein (nupC) Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1247931 - 1249187 bp Length : 1257 bp Strand : - Note : COG1972 Nucleoside permease DNA sequence : ATGATTTTTAGCTCTCTTTTTAGTGTTGTAGGGATGGCGGTGCTTTTTCTTATTGCTTGGGTGTTTTCTAGCAATAAAAG GGCTATTAATTATCGCACGATTGTCAGTGCCTTTGTGATTCAAGTGGCTTTAGGGGCGTTGGCTTTATATGTGCCTTTGG GTAGGGAAATGCTGCAAGGCTTAGCCAGCGGCATACAAAGCGTGATTTCTTACGGCTATGAGGGGGTGCGTTTTTTATTT GGCAATCTCGCTCCAAACGCTAAGGGCGATCAAGGGATAGGGGGGTTTGTCTTTGCGATCAATGTTTTAGCGATCATTAT CTTTTTTGCTAGCTTGATTTCACTTCTATATTATTTAAAAATCATGCCTTTATTTATCAATCTCATCGGTGGGGCGTTGC AAAAATGCTTAGGCACTTCTAGAGCAGAAAGCATGAGTGCAGCGGCTAATATTTTTGTAGCGCACACCGAAGCGCCCTTA GTCATTAAACCTTATTTGAAAAGCATGAGCGATTCAGAGATTTTTGCGGTCATGTGCGTGGGCATGGCTAGCGTTGCGGG GCCTGTGTTAGCCGGGTATGCGAGCATGGGCATTCCTTTGCCTTATTTGATCGCCGCTTCGTTTATGTCCGCTCCTGGGG GGTTGTTGTTCGCTAAAATCATTTACCCACAAAACGAAACCATTTCTAGCCATGCAGATGTTTCTATAGAAAAGCATGTC AATGCCATAGAAGCTATCGCTAATGGGGCAAGCACAGGGCTAAATTTAGCCTTGCATGTGGGAGCGATGCTTTTAGCCTT TGTGGGGATGCTCGCGCTCATTAACGGGCTTTTAGGGGTTGTAGGGGGTTTTTTAGGCATGGAGCATTTGTCTTTAGGGT TGATTTTAGGCACGCTCTTAAAACCCTTAGCCTTTATGTTAGGCATTCCTTGGAGCCAGGCCGGGATTGCCGGAGAAATC ATAGGCATTAAAATCGCGCTCAATGAATTTGTGGGCTATATGCAGTTATTGCCTTATTTGGGCGATAACCCTCCTTTAAT CTTGAGCGAGAAAACTAAAGCGATCATCACTTTTGCGTTGTGCGGGTTTGCTAATTTAAGCTCAGTCGCTATGCTCATTG GAGGGCTTGGCAGTTTAGTGCCTAAAAAGAAGGATCTCATTGTAAGGCTTGCTTTAAAAGCGGTGCTTGTAGGCACGCTT TCTAATTTCATGAGCGCGACTATCGCCGGGTTATTCATAGGGCTAAACGCTCATTAA Protein sequence : MIFSSLFSVVGMAVLFLIAWVFSSNKRAINYRTIVSAFVIQVALGALALYVPLGREMLQGLASGIQSVISYGYEGVRFLF GNLAPNAKGDQGIGGFVFAINVLAIIIFFASLISLLYYLKIMPLFINLIGGALQKCLGTSRAESMSAAANIFVAHTEAPL VIKPYLKSMSDSEIFAVMCVGMASVAGPVLAGYASMGIPLPYLIAASFMSAPGGLLFAKIIYPQNETISSHADVSIEKHV NAIEAIANGASTGLNLALHVGAMLLAFVGMLALINGLLGVVGGFLGMEHLSLGLILGTLLKPLAFMLGIPWSQAGIAGEI IGIKIALNEFVGYMQLLPYLGDNPPLILSEKTKAIITFALCGFANLSSVAMLIGGLGSLVPKKKDLIVRLALKAVLVGTL SNFMSATIAGLFIGLNAH |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
yutK | YP_005163383.1 | putative sodium/nucleoside cotransporter | Not tested | Not named | Protein | 8e-50 | 41 |