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Name : C730_00695 (C730_00695) Accession : YP_006935671.1 Strain : Helicobacter pylori Rif2 Genome accession: NC_018938 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease (lctP) Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 152050 - 153705 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : GTGCTAGAATTTCATCAAATTTATGATCCTTTGGGTAATATTTGGCTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTGCCGATTTTATT GTTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTATACAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCCTTATCAGCCGTTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTCCTTTACGGCTTTCTTTATGGCTTATGGCCGATC GCTTGGATCATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT CCAGTCCATCACTTTAGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGGGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACCGCAGCGATTTTAGTGGGCTTAGGGTTAAGCCCTTTGTATTCTGCCGGGTTATGT TTGATCGCTAATACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGTGCTATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTAATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTAGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAAGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGTGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTATTTAGGGCCAGAATTGCCTGGTATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGCGATTTTTAGAAGCGACGGCAAAGCGGCTTCGTTCACTAAGAGTAACCATCATATTTGTAAGA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTAGTTTTAGTGATTGTGCTATGGATACAGCCTTTTTTTAAAGCCTTGTTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAAGCCAATCAAAGCGTGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTCTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTTGTTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTCTTTGGCGAGACTTTAAAA GAAATGCGTTACCCCATTCTCACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACGCATACGGGTTTGGCTTTCACCTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTAGGCGTGTTTTTAA CCGGGAGCGATACGAGTTCCAATCTTTTGTTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGGTT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTAGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC GGTGGGGTTAGCCGGGAAAGAGAGCGATTTGTTCAAATTCACGGTTAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TTGTGATCAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MLEFHQIYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYTAAFLSVALSAVIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYSAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKAIFRSDGKAASFTKSNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEANQSVSFPVVFKFLLINTVGTSIFLAALVSMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEV LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-98 | 52 |
