Gene Information

Name : ndhF1 (BTB_c32370)
Accession : YP_006927858.1
Strain : Bacillus thuringiensis Bt407
Genome accession: NC_018877
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : putative NADH-quinone oxidoreductase subunit 5
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 1.6.99.5
Position : 3128059 - 3129591 bp
Length : 1533 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGTTAATTTCGCTGAGTTCATCAACACTGTTAACTTTATTTTTTATGGCGCTTAGTGCTTTTTGGCTAAGTGGATTATT
GTTTTTACATGCAAGGGTACCTTTACGTTTTGTTCATATCCATATTGGTATCGCTGCTTTACCTTCATTGGTTTCTTTAC
TCGCACTTGTTAATAACAATGGAGATAGAGTTGTGGGGCCTTGGCATCTAGATACTTTAGCTTGGTTAATGGCTTTCTTT
GTTCTTACAATTGGTTTAATCATTCAGCGTTTCTCTGTACGTTACTTAATGGGGGATCACTCATATCGAAAATACTTTGC
ACTTTTTACATTTACTACAGGTGTATCTTCGGTTGCATGGTTAAGTGATGATCTTCGTTTAATGCTCATTTGTTGGGGAG
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TATTTATTTACAATAAGTTGGATTGCCTTACTATCAGCTATCATTTGGCTTTTTCAAGTAACAGGACAGTGGCAGTTAAC
ATCAGTTTTAACGAATGAAAATGTAGCGCTACATGGAACATTGGAGAGAACAGGAATTAACTTATTAATTATATTAGCTG
TGATGATTCCAGCAGCACAATGGCCTTTTCAAAGATGGTTAATTGAGTCTGCTGTTGCTCCAACTCCTGTTTCTGCTATT
ATGCATGCGGGTTTAGTAAATGCTGGCGGTATCATGTTAACTAGATTTTCACCTCTTTTTCATGATGATATTGCACAAAT
AATTTTACTAATTTTCTCTAGTATTTCTGTCTTAATAGGTACAGGAATTAGTTTAGTCCAAGTTGATTATAAACGTCAGC
TAGTAGGTTCAACTATTGCACAAATGGGATTTATGCTTATTCAATGTGCATTAGGCGCCTATTTAGCAGCTGTTATTCAT
TTAATTTTACATGGTTTGTTTAAAGCTACACTATTTTTACAAGCTGGTTCTTCAGTGCAACGTTTTGGGGTAGTGAATCA
GTCTAATGAAAAGATGTCCAATTTGTGGAGTATAGTTGGACGTGTTTTAGGATTATTTATAGCAATTACTTTCTGGTTTA
TGACTTCTGGAGAGGGGTATCAACTAGTTAGTGCGTTAATCTTAGGATGGTCACTATACTTTTCATGGAAACAGCTTGTT
GTTTTTGGAGAGGGAAGAATGGGACGAATTGCTGGCTTAATTGTTTTGATTGGATTTTCTCTCATTTACTTTACTGTTCA
TAATTCTCTTTATAAATGGTTGCATACTGATATTTATCAAAGTGTTCAACCTTCAGCTCCAGCCGTTATCTTTGTTATAT
GTATTTTACTATTTAGTAGTGTTATTAGTACTTTCGTTACTCGTCATCAATCTTCTACTTTATTCGCTGTACTTTATCTT
TGGTTAGTTCGAGTAGGTGAGGCGAGACGAAAGTCAGTAGAAAGTCACCCAAGCTATCTGAAACATTATGTATCAAAGGG
AGGTAATTCGTGA

Protein sequence :
MLISLSSSTLLTLFFMALSAFWLSGLLFLHARVPLRFVHIHIGIAALPSLVSLLALVNNNGDRVVGPWHLDTLAWLMAFF
VLTIGLIIQRFSVRYLMGDHSYRKYFALFTFTTGVSSVAWLSDDLRLMLICWGATLIGLVLLIGLNKGWKVVSEATKISG
YLFTISWIALLSAIIWLFQVTGQWQLTSVLTNENVALHGTLERTGINLLIILAVMIPAAQWPFQRWLIESAVAPTPVSAI
MHAGLVNAGGIMLTRFSPLFHDDIAQIILLIFSSISVLIGTGISLVQVDYKRQLVGSTIAQMGFMLIQCALGAYLAAVIH
LILHGLFKATLFLQAGSSVQRFGVVNQSNEKMSNLWSIVGRVLGLFIAITFWFMTSGEGYQLVSALILGWSLYFSWKQLV
VFGEGRMGRIAGLIVLIGFSLIYFTVHNSLYKWLHTDIYQSVQPSAPAVIFVICILLFSSVISTFVTRHQSSTLFAVLYL
WLVRVGEARRKSVESHPSYLKHYVSKGGNS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAS0410 YP_042536.1 NADH dehydrogenase subunit 5 Not tested vSa¥á Protein 4e-111 52
SAR0452 YP_039900.1 NADH dehydrogenase subunit 5 Not tested vSa¥á Protein 2e-111 52