Name : polA (GGS_1845) Accession : YP_006860458.1 Strain : Streptococcus dysgalactiae RE378 Genome accession: NC_018712 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.7.6 Position : 1993256 - 1996030 bp Length : 2775 bp Strand : - Note : similar to DNA polymerase I [Streptococcus pyogenes SSI-1] DNA sequence : ATGCTTATCATAACCCAACACCATAGAAGTCTAGGAAATCTCCTAGGCTTTTTTAAGTTGGGGTGGTTAGCTTCTCTGCA AAAGCAATGGCTTGAAGGAGCCAAGCCCGCTCTACTGTGTTATAATAAGGCTATGGAAAACAAGAATAAATTACTATTAA TTGATGGCTCATCTGTTGCCTTTCGTGCCTTTTTTGCCCTCTACAATCAAATTGACCGCTTTAAAAATCATAGCGGTCTT CATACCAATGCCATTTATGGCTTTCATTTGATGCTAGACCACATGATGAAAAGAGTCCAGCCTACTCACGTGCTGGTGGC TTTTGATGCGGGCAAAACCACCTTCCGAACAGAAATGTATGCCGATTATAAGGCGGGTCGCGCTAAAACCCCAGATGAAT TTCGTGAGCAATTTCCTTATATTCGTGAGATGTTGACAGCCCTTGGGATTGCTTATTATGAGTTGGAACACTACGAAGCA GACGATATTATCGGGACGCTGGATAAAATGGCGGAGCGCACAGAAGTGCCTTTTGATGTGACCATTGTCAGTGGTGATAA AGATTTGATCCAGTTAACTGACGAAAATACCGTGGTTGAAATTTCTAAAAAAGGGGTTGCCGAATTTGAAGAATTCACAC CGGCTTACCTCATGGAAAAAATGGGCTTGACGCCAAACCAGTTTATTGACCTCAAAGCCTTGATGGGGGATAAATCGGAT AATATTCCAGGAGTGACCAAAATCGGTGAAAAAACTGGGCTTAAGCTCCTTCATGAATTTGGTAGTTTAGAAGGTATCTA CGAGCACGTTGAAGGTTTCAAAGCTTCCAAAATGAAAGAAAACTTGATCAATGACCGTGACCAAGCTTTCCTATCTAAAA CGCTCGCCACTATCAATACAGCATCTCCTATCACAATTGGCTTAGATGATATTGTCTACAATGGTCCAGATGTTGCTAGC CTCTCTCAATTTTACGATGAAATGGATTTTGTCCAACTGAAAAAAGGTTTGGCGAGTCAGATGCCTCAAGAGCCAGTAGC TGCCATTTCCTATCAAGAAGTGACCAATGTGTCTGCTGATTTGTTTAGCGCAGAAGACATCTTCTACTTTGAAACGCTTC GGGATAATTACCATCGTGAGGCCATCATTGGTTTTGCTTGGGGACATGGTGAGCAGATTTACGCATCCACTGACCTTAGC CTATTAGCGACGGATAGTTTTAAGCAGGTCTTCCAAAAACCCATTGCCACTTATGATTTTAAACGTAGCAAGGTCTTGTT GAGCCACTTAGGAATTGAGTTGGTAGCACCTAGCTATGATGCTAGATTAGCTAATTACCTTCTGTCAACTGTAGAAGACA ATGAGCTTAGCACCATTGCCCGTATTTTTACTGACATCTCTTTGGAAGAAGACGATACAGTCTATGGTAAAGGTGCTAAA CGGGCTGTTCCTGATAAAGACGTTTTACTAGAACACTTAGCTCGTAAGGTCAAAGTATTATTAGATAGCAAGTCTCAAAT GCTAGACAAGCTCACTGCCCATGAGCAACTAGACCTCTATCAGAATATTGAATTGCCTTTGGCTAATGTCCTTGCTAAAA TGGAAATTGAAGGGATCAAGGTTAATAGGGCGACTTTGCAAGATATGGCAGAGCAAAACAAGGTCATTATTGAAGCGCTC ACCCAAGAGATTTATGACATGGCTGGCCAAGAATTTAACATTAATTCGCCTAAACAGCTGGGCAGTATCTTGTTTGAGAA GATGCAACTACCTCTTGAGATGACTAAGAAGACCAAAACAGGTTATTCTACAGCTGTTGATGTTTTGGAACGTTTGGCAC CGATTGCTCCAATTGTGGCTAAAATTTTGGATTACCGCCAGATTACTAAATTGCAATCCACCTATGTGATTGGTTTACAG GATTATATTCTGGCTGATGGCAAGATTCATACCCGCTATGTGCAGGATCTCACCCAGACAGGGCGTTTGTCTAGTGTGGA CCCTAATCTTCAAAATATTCCCATTCGTTTGGAACAGGGGCGTTTGATTCGTAAAGCCTTTACCCCATCTCAAGAAGATG CCGTCTTGTTGAGTTCAGATTACTCACAGATTGAATTGCGGGTACTGGCACATATTTCAGGGGATGAGCATTTGATTGCT GCCTTTAATGAAGGGGCAGACATTCATACCTCAACGGCTATGCGTGTCTTTGGCATTGATAAAGCAGAAGATGTTACTGC CAATGACCGCCGTAATGCCAAGGCTGTTAACTTTGGAATTGTGTATGGGATTTCTGATTTTGGTTTGTCAAATAACCTTG GTATCACCCGTAAACAGGCCAAGTCTTATATTGATACCTATTTTGAACGCTATCCTGGGATTAAAGCCTATATGGAAAAT GTGGTGCGTGAGGCTAAAGACAAGGGCTATGTAGAGACCCTCTTTAAGCGTCGTCGTGAATTACCGGATATCAACTCTCG TAATTTCAACGTTCGCTCTTTTGCGGAGCGTACTGCTATCAATTCACCAATTCAAGGGAGCGCAGCTGATATTCTAAAAA TTGCCATGATTAACCTGGACAACGCCTTGCAAGCAGGTGGTTTTAAAGCTAAAATGCTCCTTCAAGTGCACGATGAAATC GTTTTGGAAGTGCCAAATGATGAGTTGACTGCTATAAAAAAACTTGTCAAAGACACCATGGAAGCTGCTGTTGATTTAGC TGTTCCTTTACGCGCAGATGAAAATGCAGGACAGAGCTGGTACGAAGCCAAGTAA Protein sequence : MLIITQHHRSLGNLLGFFKLGWLASLQKQWLEGAKPALLCYNKAMENKNKLLLIDGSSVAFRAFFALYNQIDRFKNHSGL HTNAIYGFHLMLDHMMKRVQPTHVLVAFDAGKTTFRTEMYADYKAGRAKTPDEFREQFPYIREMLTALGIAYYELEHYEA DDIIGTLDKMAERTEVPFDVTIVSGDKDLIQLTDENTVVEISKKGVAEFEEFTPAYLMEKMGLTPNQFIDLKALMGDKSD NIPGVTKIGEKTGLKLLHEFGSLEGIYEHVEGFKASKMKENLINDRDQAFLSKTLATINTASPITIGLDDIVYNGPDVAS LSQFYDEMDFVQLKKGLASQMPQEPVAAISYQEVTNVSADLFSAEDIFYFETLRDNYHREAIIGFAWGHGEQIYASTDLS LLATDSFKQVFQKPIATYDFKRSKVLLSHLGIELVAPSYDARLANYLLSTVEDNELSTIARIFTDISLEEDDTVYGKGAK RAVPDKDVLLEHLARKVKVLLDSKSQMLDKLTAHEQLDLYQNIELPLANVLAKMEIEGIKVNRATLQDMAEQNKVIIEAL TQEIYDMAGQEFNINSPKQLGSILFEKMQLPLEMTKKTKTGYSTAVDVLERLAPIAPIVAKILDYRQITKLQSTYVIGLQ DYILADGKIHTRYVQDLTQTGRLSSVDPNLQNIPIRLEQGRLIRKAFTPSQEDAVLLSSDYSQIELRVLAHISGDEHLIA AFNEGADIHTSTAMRVFGIDKAEDVTANDRRNAKAVNFGIVYGISDFGLSNNLGITRKQAKSYIDTYFERYPGIKAYMEN VVREAKDKGYVETLFKRRRELPDINSRNFNVRSFAERTAINSPIQGSAADILKIAMINLDNALQAGGFKAKMLLQVHDEI VLEVPNDELTAIKKLVKDTMEAAVDLAVPLRADENAGQSWYEAK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 99 |