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Name : A911_01890 (A911_01890) Accession : YP_006857476.1 Strain : Campylobacter jejuni PT14 Genome accession: NC_018709 Putative virulence/resistance : Unknown Product : seryl-tRNA ligase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 6.1.1.11 Position : 354063 - 355298 bp Length : 1236 bp Strand : + Note : COG0172 Seryl-tRNA synthetase DNA sequence : ATGCTAGATTTAAAAAATTTGCAAAATAATTTTGATGAAGTGGCTAAAAAGTTAAAAAATAAAAAAGTTGATGAAAATAT CTTAAAAAAACTTGCTGAACTTTTTGCAAGTTTAAAAAAAGAAAAAACAGCTTTAGAAGAATTTCAAGCTTTTCAAAATA AATTCAGTAAAGAACTTGCTACAGCCGAAGATAAAGAAAGTTTAAAAGCAAAATTAAGCGAAAATAAAAGTAAAATTAAT GAGCAAAGCACTAAAGTAAATGCTTTAGAAAATGAGCTTGAAGAAATCGCTCATGCCATCCCAAATATCCCTGATGAATG TGTGCCTGTGGGTGAAGACGAAGATGAAAATGTGGAGCTTAAAAAAGTTTTAAATCCACCTAGCTTTGATTTTACTCCAA AAGAACATTTTGAATTAGGTGAGAGTTTAAATTGGCTTGATTTTGTGCGTGGGGTAAAAATTTCACAAAGCCGTTTTTGT GTGCTTAAGAACGAAGGAGCTTTATTAAGCCGTGCTTTGGTAAATTATATGATAGATTTTAATAGAAGTCGTGGATTTGA ATTTGTTAATGTACCTTTTTTGGTAAATGGTGCTACTATGTTTGGGACAGGTCAGTTGCCAAAATTTAAAGAAGATATGT ATAAGGTAGATGATGAGGATTTGTATTTGATCTCAACTTCTGAAATTCCAGTAACCAATCTTTATAGTGGAGAAATTTTA GCTAGTGAAACTTTACCGATAAAAATGACTTGTTATAGTGCTTGTTTTAGAAAAGAAGCAGGCAGTGCAGGGCGTGATAC AAGAGGTATTATAAGACAACACCAGTTTGAAAAAGTAGAGCTTGTAAGTATCGCTAAACCTGAGCAAAGTGATAGCGTGT TTAATGAAATGCTTGAGTGTGCAAGTGATTTACTCAGTTCTTTAGGTTTAGCACATAGACATTTGATGCTTTGCACCGGA GATTTGGGTTTTAGTGCGGCAAAAACTGTAGATCTTGAAGTGTGGCTTCCAGGACAAAATAAATATCGTGAGATCAGCTC GGTTTCAAATTGTCGTGATTTTCAAGCAAGACGTGCTAAAATTCGCTATAAAAACGAACAAGGAAAAAATGAACTCGTTC ACACTCTTAATGGCTCATCTTTGGCAGTAGGAAGAACCTTGGTAGCGATTATGGAAAATTATCAAGATAAAGAAGGAAAA ATTCATATTCCTGATGCTTTGAAAAAATATTTTTAA Protein sequence : MLDLKNLQNNFDEVAKKLKNKKVDENILKKLAELFASLKKEKTALEEFQAFQNKFSKELATAEDKESLKAKLSENKSKIN EQSTKVNALENELEEIAHAIPNIPDECVPVGEDEDENVELKKVLNPPSFDFTPKEHFELGESLNWLDFVRGVKISQSRFC VLKNEGALLSRALVNYMIDFNRSRGFEFVNVPFLVNGATMFGTGQLPKFKEDMYKVDDEDLYLISTSEIPVTNLYSGEIL ASETLPIKMTCYSACFRKEAGSAGRDTRGIIRQHQFEKVELVSIAKPEQSDSVFNEMLECASDLLSSLGLAHRHLMLCTG DLGFSAAKTVDLEVWLPGQNKYREISSVSNCRDFQARRAKIRYKNEQGKNELVHTLNGSSLAVGRTLVAIMENYQDKEGK IHIPDALKKYF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 3e-86 | 49 |
