Gene Information

Name : tktA (Q91_2054)
Accession : YP_006838590.1
Strain : Cycloclasticus sp. P1; MCCC 1A01040
Genome accession: NC_018697
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transketolase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2156246 - 2158249 bp
Length : 2004 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAGCCCAAGACCTTCTCGTCAAACACTAGCGAATGCTATTCGTGTCCTTAGTATGGATGCTGTCCAACAAGCCAACTC
AGGACACCCCGGTGCACCGATGGGGATGGCAGATATTGCAGAAGTACTATGGAATGACTTTTTGTCGCATAACCCAGCCA
ATCCACACTGGGTGAATAGAGATCGCTTCGTATTATCGAACGGTCATGGCTCAATGTTGTTATATTCGTTATTGCACTTG
TCGGGTTACGATTTAGATATTGAAGACATTCGTAATTTTCGTCAGCTGCACTCTAAAACACCGGGTCACCCAGAATACGG
ATATGCGCCAGGGGTAGAAACAACGACAGGTCCTTTAGGTCAAGGTATTAGCAACGCGGTGGGTATGGCTTTAGCTGAAA
AGGTATTAGCTGCACAATTTAATCAACCTAACTTCAAGGTGGTTGACCATTACACGTATACCTTTATGGGGGATGGTTGC
TTGATGGAGGGTATTTCGCATGAAGCATGTTCTTATGCGGGTACGCTTGGCTTAGGCAAATTAATAGCGTTTTGGGATGA
TAACGGTATCTCGATTGATGGCGATGTAGAAGGTTGGTTTACCGATGATACGCCAGCACGTTTTGAAGCCTATGGTTGGC
AAGTAGTTCGTGATGTAGATGGGCATAATGCTAATGATATTAAGCAGGCGATTGAGCAAGCACAAAAAGAAACGAATAAA
CCCACGTTAATTTGCTGTAAAACAGTGATTGGCTCTGGTGCGCCTAATAAAGAAGGGACGCATCATGTACATGGCGCTCC
ATTGGGTGCTGAAGAAATAGCTGCTACCAGAAAAGCATTAGGTTGGGCAGCGCCTGCCTTTGAAATTCCAGCTGAGGTAA
AGAATGCGTGGGATGCAAACGATAAAGGTGAACAAGCAGAAGCTCAATGGGAAGAGTTATTAGAAGCTTATGTGGCTGAA
TACCCAGACCTAGCTGATGAACTATTGCGTCGTTTATCAGGTGAGTTAAGTGCTGATTGGGCAGAAAAATCAGAGGCATT
TGTGCAGGCAGCGCAGCAGGCAGGTGAAACCATTGCCTCACGTAAAGCATCATTAAACACACTTAATGGTTACGGTCCTT
TATTGCCCGAGCTTTTAGGGGGATCAGCTGATTTAACTGGCTCTAATTTAACTAAATGGTCAGGGTGTACAGATGTTGAT
GGGACGAATGCCAACGGCAACTATCTTCATTACGGCGTGCGTGAATTTGGCATGAGCGCAATTCAAAATGGCATTGCATT
ACATGGCGGCTTTATTCCTTATGGCGCAACGTTTTTAACATTTTCTGATTATGCTCGTAATGCTGTGCGTATGGCTGCAT
TGATGAAATTACGAAATATTTTTGTTTTCACGCATGACTCGATAGGGTTGGGTGAAGACGGACCAACACACCAATCGGTT
GAGCATGTATCAAGTTTACGGTTAATTCCAAACTTAGATGTATGGCGTCCGTGTGATGCGGTTGAATCTGCTGTTGCATG
GAAGTATGCGGTTGAAAATGAAAGCACGCCGTCAGCGCTAATTTTTACTCGTCAAAACGTACAGCACCAGCCACGCACAG
CTGACCAAGTGGCGGCTATTTCAAAAGGGGGTTATATCCTTAAAGATTGTGAAGGTGAGCCGCAGGTTATTTTAATGGCT
ACGGGGTCTGAAGTTGAATTAGCGACAACCGCTGCTGACGTATTAGCAGCAGAAGGCGTTAAGGTTCGCGTACTATCTAT
GCCGTGTACAGACCTTTTTGATAGACAAGATATGGCGTATAAAGAATCTATATTGCCTGCCTCAGTAACAGCAAGGGTAG
CGATAGAAGCAGGATCAACAAGCCTTTGGTATAAATACGTGGGCTTGCAAGGTGCGGTGATTGGCTTAGACCGTTTTGGT
GAATCGGCTCCGGCTAAAGAATTGTTTGAATACTTTGGCATCACAGTGGAAAAGTTAGTCGAAGCAGCAAAGAACTTAAT
ATAA

Protein sequence :
MSPRPSRQTLANAIRVLSMDAVQQANSGHPGAPMGMADIAEVLWNDFLSHNPANPHWVNRDRFVLSNGHGSMLLYSLLHL
SGYDLDIEDIRNFRQLHSKTPGHPEYGYAPGVETTTGPLGQGISNAVGMALAEKVLAAQFNQPNFKVVDHYTYTFMGDGC
LMEGISHEACSYAGTLGLGKLIAFWDDNGISIDGDVEGWFTDDTPARFEAYGWQVVRDVDGHNANDIKQAIEQAQKETNK
PTLICCKTVIGSGAPNKEGTHHVHGAPLGAEEIAATRKALGWAAPAFEIPAEVKNAWDANDKGEQAEAQWEELLEAYVAE
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TGSEVELATTAADVLAAEGVKVRVLSMPCTDLFDRQDMAYKESILPASVTARVAIEAGSTSLWYKYVGLQGAVIGLDRFG
ESAPAKELFEYFGITVEKLVEAAKNLI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
tktA AAO17218.1 TktA Not tested tcd island Protein 0.0 69
APECO1_2641 YP_859417.1 transketolase Not tested Not named Protein 0.0 61