|
Name : ASU2_06640 (ASU2_06640) Accession : YP_006817705.1 Strain : Actinobacillus suis H91-0380 Genome accession: NC_018690 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hemolysin activation/secretion protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1467966 - 1469720 bp Length : 1755 bp Strand : - Note : COG2831 Hemolysin activation/secretion protein DNA sequence : ATGTCTTTAAATTTAAAACCTCTAATTTATTCTTCTTTTCTTACCTTTCCTTTGTTTACCTTCGCTGCTCCTACAATTGA TCCAGTCTTAAATGATTTGGACGCGGTAGAACAACAGCGTCAGCAACAGCAAGCACAGCAACGAGAAACGCAATTTACAC CTCAAACTGATATCCGTATGGATACTCGTCAAGAGAATAATTTACACCTGCCGACAGATGAATCGCCTTGTTATCCAATT CATCGAATTTCTTTAATTGATTATTCTGCAGAGCAATTGAATCAAACGAGCCAATTTCAATGGGCATTTAATAAAGCCGT TGCCGATCTAAAACTAACTTTACCACATTGTTTAGGTGGAGAAGGTTTAGGTATTTTAATGAAGCAAACACAAAATAATA TTATTGAAAAAGGTTATGTTACAACACGCGTTGTGGCACAAGAGCAAGATTTACGTTCCGGTGATTTAGTATTGACCGTG ATTGCAGGTAAAGTACGTCATACATTGGTGGCAGACAGTGGCATCGTGCCTCGCTTTACCCCATTACATGCGTTAACCGG TTTAACGTTTGAGAAAGGTGATATTTTAAATGTACGTGATATTGAACAATCGCTAGAGAACTTAAAACGTGTACCGACAG CGGATGCCAATATTGAAATTTTGCCGAGTGAAGGCGAAGGCAGTCAAGTCGGCGAAAGCGATTTAAAAATCAGCTATGCT CAAGCGATTCCGTTTCGTCTTAATCTCGGCTTAGAGGATTCCGGCTCGACCTCAACCGGTAAATGGCAGGCATCGGCAAC CTTATCTTGGGATAATATTTTCTCCGCAAACGACCTTTTCTATACTAGCTTTACCCATAGTATCAAACGTCATTCGGATG ATGAGGGGAAGCGTGCCAGCCGTAACCTTTCTTTCTATTATTCCATTCCTTTCGGTTATTGGCAGTTAACTGCCAACCAT TCGAGTAACCGTTATCACCAACAAGTGTTTGGTGCTTTTGAAAATTATCTGTATGCCGGTGAAAGTGAAACAGATAAGTT AACGCTTTCTCGTGTGCTATACCGAGATGCGGTACGTAAGACCATACTTTCCGGAGGGTTCTGGTCACGCAGTTCTAAAA ACTTTGTTGATAATGCAGAAGTAGATGTTCAGCGCCGCCGAATGGCAGGTTGGGAAGCGGGCATTGCACATAAAGAATAT TTAAGTAACGCCACCTTAGAGGTGGATATGCACTTTAAGCGTGGTACCGGCGTGCGAGGTGCAATCAGCGCTCCGGAAGA AGCGTATAACGAAGGGACATCTCGCCCTAAAATTATCACTGCCACTATCGACTATAAAAAGCCGTTTGAATTAGAAGGAC AAGCTTGGCAATTTCATACCAGTGTCAATGCGCAATGGAATAAAACGCCATTAATTGCCCAAGATCGTATTAGTATTGGC GGGCGTCATAGTGTACGAGGATTTGATGGTGAGTTATCGCTGTCGGGTGAACGCGGTTGGTATTGGCGTAATGAATTGAG TTGGAATGTGGGCAACCGTGGACACTGGTTTTATTGGGGATTAGACGGTGGACGAGTCTCCGGCTTAGATGGTAATTCAC GTTTAGGTCATCATTTAATGGGGACAGTAATTGGCTTACGAGGCGGTTGGAAAGGGTTTTATTACGACTATTTTGTCGGC AGACCAATGCGCCATCCGGAAGGATTTAGAACCTCCAAACATGTGACTGGTTTTAATATCGGCTACAGTTTTTAA Protein sequence : MSLNLKPLIYSSFLTFPLFTFAAPTIDPVLNDLDAVEQQRQQQQAQQRETQFTPQTDIRMDTRQENNLHLPTDESPCYPI HRISLIDYSAEQLNQTSQFQWAFNKAVADLKLTLPHCLGGEGLGILMKQTQNNIIEKGYVTTRVVAQEQDLRSGDLVLTV IAGKVRHTLVADSGIVPRFTPLHALTGLTFEKGDILNVRDIEQSLENLKRVPTADANIEILPSEGEGSQVGESDLKISYA QAIPFRLNLGLEDSGSTSTGKWQASATLSWDNIFSANDLFYTSFTHSIKRHSDDEGKRASRNLSFYYSIPFGYWQLTANH SSNRYHQQVFGAFENYLYAGESETDKLTLSRVLYRDAVRKTILSGGFWSRSSKNFVDNAEVDVQRRRMAGWEAGIAHKEY LSNATLEVDMHFKRGTGVRGAISAPEEAYNEGTSRPKIITATIDYKKPFELEGQAWQFHTSVNAQWNKTPLIAQDRISIG GRHSVRGFDGELSLSGERGWYWRNELSWNVGNRGHWFYWGLDGGRVSGLDGNSRLGHHLMGTVIGLRGGWKGFYYDYFVG RPMRHPEGFRTSKHVTGFNIGYSF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| NMB1762 | NP_274762.1 | hemolysin activation protein HecB | Not tested | IHT-C | Protein | 2e-94 | 43 |
