|
Name : C548_038 (C548_038) Accession : YP_006796568.1 Strain : Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC Genome accession: NC_018676 Putative virulence/resistance : Unknown Product : seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 48317 - 49582 bp Length : 1266 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTAGATATTAAATTAATTTGCAACAATTTTAATAATGTTGTTAAAAAATTAGCCAGCCGTGGTTATGAATTAGATAT TAAAAAAATTAAAACGTTGCTAGAAATACGCAATAAGTTTAAAACTAATACTGAAACTTTACAAAATAAACGCAATATTA TATCTAAAACTATAGGAAACAACAAGAATTATATATTAAAAGTACAAAAGTTATTTGTAAAAGTAAAAAAAATAAATCAT AAACTTCATAAAAATATTTTATGTTTAGAAGTAACCAACAAAAAAATTTATAATATTTTATTTAAAATACCAAACTTACC ACATAATAGTGTACCAATTAAAACCAATATAGAGATAATACGTTGGGGAGTTCCTAAATCATTTAACTTTTCCATACGTG ATCATATTAAGATAGGCTTATTAAATGGTGATATTGATTTTGAATTAGCAACTAAAATAACTGGTTCTAATTTTACTTTA ATACGTGGAAATTTAGCTAAATTACATCGTGCTTTAATACAATTTATGTTAGATAAGCAAATTAATGATCATGGTTATGA AGAAATGTATGTGCCATATATAATTAATAGAACTTCTTTAGTAGGTACAGGTCAATTACCTCAATTTAATAAAAATGTTT TTGAACTTGAAGGAGAAAATGAATATTTTCTTATTCCTACAGCTGAAGTCCCTTTAGTTAATAGTGTCAGTGGTAAACTT TTCAATGTTAATGATTTACCAATTAAATTAACAGCACATTCTCCTTGTTTTAGAAACGAACCTGTATCTTATGGAACTGA TTCTCGTGGTATGTTGAGACAGCTACAGTTTGATAAAATAGAATTAGTTCAAATAGTACATCCTGAAAAATCTTATGTTG TATTAGAAGATATGACTAACCATGCTGAAGAAATTTTAAAAGCATTAAATTTGCCTTATAGAGTTATAAGTTTATGTAAG GAAGATATTAGTTTTTGTGCATCTAAAACTTATGATATAGAAGTTTGGATTCCTAGTCTTGAAACTTATTTAGAGATTTC ATCGATATCTAATTGTGAGGATTTTCAAGCAAGAAGAATTAAAACTAGATTTCGTATTAATAAAGACAAAGCAAAGCCTA AATTTGTACATACACTTAATGGCTCTGGACTAGCTGTTGGTCGTTGTTTGTTAGCCGTATTGGAATATTATCAAAACGAA GATGGCTCTATTACAGTTCCAGATAGTTTGCGCTCTTATATGTGTGGTATTAACCGTCTTTATTAG Protein sequence : MLDIKLICNNFNNVVKKLASRGYELDIKKIKTLLEIRNKFKTNTETLQNKRNIISKTIGNNKNYILKVQKLFVKVKKINH KLHKNILCLEVTNKKIYNILFKIPNLPHNSVPIKTNIEIIRWGVPKSFNFSIRDHIKIGLLNGDIDFELATKITGSNFTL IRGNLAKLHRALIQFMLDKQINDHGYEEMYVPYIINRTSLVGTGQLPQFNKNVFELEGENEYFLIPTAEVPLVNSVSGKL FNVNDLPIKLTAHSPCFRNEPVSYGTDSRGMLRQLQFDKIELVQIVHPEKSYVVLEDMTNHAEEILKALNLPYRVISLCK EDISFCASKTYDIEVWIPSLETYLEISSISNCEDFQARRIKTRFRINKDKAKPKFVHTLNGSGLAVGRCLLAVLEYYQNE DGSITVPDSLRSYMCGINRLY |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 7e-82 | 44 |
