|
Name : C548_101 (C548_101) Accession : YP_006796631.1 Strain : Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC Genome accession: NC_018676 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 113217 - 114707 bp Length : 1491 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATTATAAAAAATTATTTAATTAAAGATCGTTTAAATAAGTTACAAGTATTGAGTAAAACCGCGAATAAAGCTGGAAA AAGTGCATTTTATAATAAATTTCGTCGTACTAGTTTAGCAAAAAGTTTAAAAAAAATTTTTGGAGAAAAGAATAAAAAAC AATTGGTTAATTTAAAGTTAACAACAGCAGTTGCAGGACGTATTATGCGTAAAAGGGGGCCTTTTATAGTTGTTCAAGAT GTAAGTAGTAACATTCAGCTTTATATAGATAAAAAAACAATTTCTAATGAAATTCATAAATATATAAAAGATTGGGATAT TGGAGATATAATTGGAGCAATAGGTGACATTGATAAATCAAAAATTGGTGAACTATATTTATTGGTTAAAAAAGCTTATA TTTTAACTAAAAGCATAAGACCTTTACCAAGTAAATTTCACGGTATAAAAGATCAAGAAATTAGATATAGGCACAGATAT TTAGATTTTATTATGAATAAAGAGGTACGTAAATCGTTTAAAATTCGCACACGTATTATATCGGCGCTTAGAAAGTTTTT TTATGAACTTTATTTTTTAGAAGCAGAGACTCCTATATTACATTCAATGCCAGGGGGAGCAATAGCAAAACCTTTTGAAA CTTATAATTATTCATTAAATATAAAATTGTATTTACGAATCGCCCCTGAACTTTATTTAAAAAGGTTAGTTGTTGGTGGT TTTGAACGTGTATTTGAAATAAATAAAAACTTTCGTAATGAAGGCCTTTCAACTTGGCATAATCCTGAATTTACTATGTT AGAATTTTATTGGGCTTTTGCGACTTATAAGGATTTGATGGAAATCACAGAACATATGATAAGATTTGTTGCGAATGAAG CGTTAGGTACAACAATTATTAACATCGGAAATATTTTAAACATTGATTTATCAGAACCTTTTGATTGTTTAAGTATGCGA GACTCGCTCATTAAGTATGGTAAAACTTTTTCAATTAATAACTCTGATTTTTATGATCTAGAAAGTTTGCTTTTTTTATC TAAACGAATTGGATTGACCGTAGCTAACTATAACAATTATGGAAATTTACTTAATAAACTATTTGAAGTAATTGTAGAAC GAAAATTAATTAAACCAACTTTTGTCACAGACTATCCAGTAGAAGTTAGTCCTTTAGCAAGAAGTAAAGATAGTAACCTG AATATAACAGAAAGATTTGAATTGTTTATAGGGGGTAGAGAAATAGCTAATGGTTTTTCGGAATTAAATGATTATATAGA ACAATCTAACCGATTTTATTTGCAATTGAGAAACAAATATACTTATGATTTGAGTAATTTTGATATGGACTATATACGTG CCTTAGAATATGGAATGCCTCCAACTGCTGGAGAAGGAGTAGGAATTGATCGTCTTGTTATGATACTTACAAATAAAGAT TCAATTCGAGATGTATTACTTTTTCCTTTGCTGCGTAGCCGTAAAGTTTAA Protein sequence : MIIKNYLIKDRLNKLQVLSKTANKAGKSAFYNKFRRTSLAKSLKKIFGEKNKKQLVNLKLTTAVAGRIMRKRGPFIVVQD VSSNIQLYIDKKTISNEIHKYIKDWDIGDIIGAIGDIDKSKIGELYLLVKKAYILTKSIRPLPSKFHGIKDQEIRYRHRY LDFIMNKEVRKSFKIRTRIISALRKFFYELYFLEAETPILHSMPGGAIAKPFETYNYSLNIKLYLRIAPELYLKRLVVGG FERVFEINKNFRNEGLSTWHNPEFTMLEFYWAFATYKDLMEITEHMIRFVANEALGTTIINIGNILNIDLSEPFDCLSMR DSLIKYGKTFSINNSDFYDLESLLFLSKRIGLTVANYNNYGNLLNKLFEVIVERKLIKPTFVTDYPVEVSPLARSKDSNL NITERFELFIGGREIANGFSELNDYIEQSNRFYLQLRNKYTYDLSNFDMDYIRALEYGMPPTAGEGVGIDRLVMILTNKD SIRDVLLFPLLRSRKV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 2e-89 | 46 |
| lysS | YP_005163386.1 | lysyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 4e-58 | 42 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| C548_101 | YP_006796631.1 | lysyl-tRNA synthetase | VFG1668 | Protein | 1e-89 | 46 |
