Gene Information

Name : C270_00255 (C270_00255)
Accession : YP_006794969.1
Strain : Leuconostoc carnosum JB16
Genome accession: NC_018673
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : oligo-1,6-glucosidase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 65306 - 67027 bp
Length : 1722 bp
Strand : +
Note : COG0366 Glycosidases

DNA sequence :
ATGACAAAAGAATTGTGGTGGCAGAATTCAGTTGTTTATCAAGTTTATCCTAAAAGTTTCCAGGATAGTGATAACGATGG
TATAGGTGATTTGAGAGGAATAATTAATCGATTAGATTATATTAAAAAGTTAGGTATCGACATCATTTGGCTAAATCCAA
TCTATAAAACATCTAATATTGATGGTGGCTATGATATTTCGGATTATCAAAGCATTAATCCTACTTTTGGAAATATGTCT
GATTTTCAGGAGTTGTTAGACAAAGCACACCAACTCGGATTAAAAATTATGATGGATTTGGTTGTTAACCACAGTTCTTT
TGAACATGAGTGGTTTCAGAAGAGCATTGCAGATTATAGTAAAAACAATCATTATCGCGATTATTATATTTGGCGTGATC
CGGTCGATAACCATGAACCAAATAATTGGGGTTCTTTCTTTTCAGGACCTGCTTGGACTTATGATGAAGATTCTGGTCAA
TATTATTTACATTTATTTGCTAAAGAGCAGCCTGATTTGAATTGGGATAATCAAGAAGTTAGACATTCAATTTTTGATAT
GATGAATTGGTGGGCTAGTAAAGGTATTGACGGTTTTCGAATGGATGTTATTTCTCTGATTTCAAAACCCACAGGATTAC
CAAATGCGCCGGTTGAAGAGGATTCCTTGTATGGTAATGCTGGTGACGCCTGCGCAAATGGTCCGCATGTTCATGAGTAT
CTTAGAGAGATGAATGAACAAGTGTTACAGAAACATGATTGGATCACTGTTGGTGAAACAGCGGGTGTAACAACAAGTGA
AGCAGAAAAATATGCCAATTTGAACGGCACCGAGTTGAACATGGTGTTCCAATTTGAACATGTTAGTTTAGATGGTAATA
GTAATTCAGCACTTGGTAAGTGGTCTGATAAAAAAGTTTCATTAATGGATCTTCGTGAGAATTTGGTGAAATGGCAGAAG
GCATTAGCTGGGAAAGCATGGAATAGTTTGTATTGGAATAATCATGACCAACCTCGTGCCGTATCTCGGTTCGGCAATGA
TAGCGTTGAATATCGTGAAGTTTCTGCAAAAATGCTTGCAGCTTTATTGCATTTCATGCAGGGGACACCTTATATTTACC
AAGGTGAAGAACTCGGTATGACGAATGCAAATTTTCAGAAGTTATCACAATACAGTGATTTAGAATCGATTAATGCTTAT
CATGAGTTAGTGGAACAAGCGCATTTACTTAATTCAGATGACATGATGCGTTATTTACGCGCACGGTCACGGGATAATTC
ACGAACACCGATGCAGTGGGATAACACAAATCATGCAGGATTCAGTGATGCAGAACCTTGGTTAGCGGTTAATAATAATT
ATCAATCAATCAATGCAGCATCTGAGTTAAAAAATCCAAATTCCATATTTTATTTCTATCAAAAATTGATTGAATTACGG
CATACAAAACCGATCATCACACATGGTATTTTTGATTTAGTTGAAGGTAATGAAAATGATGAAGAAGTGTTTGCCTATAC
ACGGAAAAGTGAGGGTGAAACGCTACTTGTGGTTGCCAACTTTACATCGCATGATGTTAATCGTCAATATAATATTCCTA
CAAACAGTGAATTATTGATTCAAAACTATAAAAGTATTCAAGATGATATATTACGCCCTTATGAAGTAAGAGCCTATCTT
TTCCTTGATACCAGTAAAATAACCACAACAAAAGAAGGTTAA

Protein sequence :
MTKELWWQNSVVYQVYPKSFQDSDNDGIGDLRGIINRLDYIKKLGIDIIWLNPIYKTSNIDGGYDISDYQSINPTFGNMS
DFQELLDKAHQLGLKIMMDLVVNHSSFEHEWFQKSIADYSKNNHYRDYYIWRDPVDNHEPNNWGSFFSGPAWTYDEDSGQ
YYLHLFAKEQPDLNWDNQEVRHSIFDMMNWWASKGIDGFRMDVISLISKPTGLPNAPVEEDSLYGNAGDACANGPHVHEY
LREMNEQVLQKHDWITVGETAGVTTSEAEKYANLNGTELNMVFQFEHVSLDGNSNSALGKWSDKKVSLMDLRENLVKWQK
ALAGKAWNSLYWNNHDQPRAVSRFGNDSVEYREVSAKMLAALLHFMQGTPYIYQGEELGMTNANFQKLSQYSDLESINAY
HELVEQAHLLNSDDMMRYLRARSRDNSRTPMQWDNTNHAGFSDAEPWLAVNNNYQSINAASELKNPNSIFYFYQKLIELR
HTKPIITHGIFDLVEGNENDEEVFAYTRKSEGETLLVVANFTSHDVNRQYNIPTNSELLIQNYKSIQDDILRPYEVRAYL
FLDTSKITTTKEG

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
malL YP_251987.1 oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase Not tested SCCmec Protein 2e-154 54