Name : C270_03045 (C270_03045) Accession : YP_006795521.1 Strain : Leuconostoc carnosum JB16 Genome accession: NC_018673 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 635639 - 638320 bp Length : 2682 bp Strand : + Note : COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) DNA sequence : ATGACAAAAAAACTACTTTTAATTGATGGCAATTCACTAGCGTTTCGTGCATTTTATGCGATGTATCAGCAACTCGATCG TATGATATCTCATAACGGATTACATACAAATGCCTTGGTAGCATTTAATAACTTTTTAGACCAGATTGTTGATCCGATGC AACCTGATTTGGCACTTGTTGCTTGGGATGCAGGTTCTGGAAAAGACACTTATCGTGGGCAACTATTTCCTGAATATAAA GATGGCCGTTCAAAAACACCATCAGAATTTAAAGAACAGTTTCCCTATTTACGTGAAATGGTTGCGCTTCATGGCTTAAG AAATTACGAAAAAATAGGGCTCGAGGCTGATGACATTATTGGAACGTATTCTCGTATGGGTGAGGCAGCTGGTTATTCAG TCACCATTATCACTGGGGATCAGGATTTAATTCAGTTAGCAACGGATAACATTACTGTTAATGTGACTAAAAAAGGTGTC ACAGAACTTGAACGCTATACGCCAGCTTACATCATGGAAAAGTATGGTTTGACACCACAGCAAATTATTGAGAAAAAAGC ATTAACAGGTGATACATCAGATAATTATCCAGGTGTCACTAAAGTAGGTGAAAAAACTGCATTAAAATTGTTAGCGGAAT ACGAAAATATTGATAATTTGTATGCAAACATTGAAGACATGAAAAAGTCTAAAATGAAAGAGAATTTGATTAATGATCGT GAATCTGCGTTTCGTGCTAGAAAATTAGCAACAATTAGTACAGATGCAACATTAGATTTGCCACTGCAAGAAATCGAGTA TCGGGGCATAGATTATGATAAGCTTGTACTTTTTTATCAAGATTTAGATTTTAAACAACAGTTAGCAAAAATTAAAGCAT TACGAAAATCAGGGCAAATAGCCGGTGGTGATGAACAAAACGAAACTCAAGTTCATGTTGTGACATTGACTGACACTAAT CTGCGAGCTGTGACCATGCTTGGCAAAAAAGTTGCTGTACATATTGAAACCACTGGTGATAACTATCATATTGATGAGAT GATTGGATTTGTGATAGGAAATCCAGAAGTCGGTTATTATGCTAGTCGTGATATGACACTGTTACAAACAACAGAATTAA AGTCAATTATTGAAGATGAGAACGTTGTAAAAAATGTGTTTAATGTTAAAGCACAGTTGATCTTGTTTAAGCGTTTAGGT TTGCAACTAAAGGGCACCTATTTTGATTTTCTATTAGCTGCTTATTTATTGGATACGACGGATAATGATAATGAATTATC TACATTAGCCCAGCGCTTTGATGTTTATATGTCATCTGATGATGAAATTTATGGTAAAGGTGCTAAATTTGCTGTACCAG ATGATGAGGGACGTGTTTTGATGCATCTCGCACATAAAGCTGACACGTTAATGCAACTAGAATTACCTGCGTTGGCTGCG TTAAAAGCGCATGAGCAAATGCATCTTTATACTGAAATTGAGTTACCATTGGCGCACGTATTGGCTGATATGGAATACCA AGGTATTAGAATTAACCAAACGCGCCTATACGATATGGGTGTGGATTTGCAAGGACGTATTCATACTATAGAGGATGCCA TTTATATTGAAGCCGGTGAAAAATTTAATATTAATTCACCCAAGCAGTTAGGTATTTTACTTTTTGAAAAGATGGGGCTT CCTGTCATTAAAAAAACAAAAACTGGTTACTCCACTGCAGTTGATGTATTAGAAAAATTGGCGTCACAAGCACCGATTGT TGACCATATACTGCAATATCGCCAATTAGCTAAGTTGAAATCTACCTACATTGATGGCATGTTGTCTGTTGTTTATCCAC AAGATAGTAAAATTCATACACGTTTCTTACAAACTTTAACCCAAACAGGGCGATTATCATCAGTAGACCCTAATTTACAA AACATTCCCATGCGAACAGAAGAAGGGCGTTTAATCCGAAAGGCATTCGTACCGAGTGAACCAAATTGGCAAATATTTGG CGCTGATTATTCCCAAATTGAGTTACGCGTATTGGCTCACATCACTGGCGATAAAAACATGCAAAAGGCTTTCCTAAATG GTGAGGACATTCATGCTGAGACAGCTCGCGCTGTTTTTGGATTAGCTGATGATACACCGGTTGATGCTAACATGCGTCGT ACAGCCAAGGCTGTTAATTTTGGTATTGTATATGGTATTTCTGACTTTGGGTTAGCTAACAACCTAGGTATTTCACGTGC TGAGGCAAAGCAATTTATAGACACTTATTTTAAAGAATTTCCGCAAATTCATGAATGGATGGATAAAATTAAACAAAGTG CGCACGAGTTAGGATTTGTTGAAACAATCGCGAAACGACGTCGTTATTTACCAAATATACAATCAAAAAATTTTAATTTA CGTAGTTTTGCTGAACGAACTGCGATGAATTCTCCAATTCAAGGTTCTGCTGCAGATATTATTAAAATTGCTATGATTAA AGTGAATAGCGCATTGAAAGAAAACAATTTGCAAGCACGTATGTTGTTACAAGTGCACGATGAATTAATCTTTGAAGCGC CATCAAATGAAATTAGTGAATTATCGGAATTGGTGACTAGTGTCATGGATTCAGCTGTGTCACTGGATGTCCCAATGAAG GTTGATAATCATTATGGTGACACGTGGTATGATGCCAAGTAA Protein sequence : MTKKLLLIDGNSLAFRAFYAMYQQLDRMISHNGLHTNALVAFNNFLDQIVDPMQPDLALVAWDAGSGKDTYRGQLFPEYK DGRSKTPSEFKEQFPYLREMVALHGLRNYEKIGLEADDIIGTYSRMGEAAGYSVTIITGDQDLIQLATDNITVNVTKKGV TELERYTPAYIMEKYGLTPQQIIEKKALTGDTSDNYPGVTKVGEKTALKLLAEYENIDNLYANIEDMKKSKMKENLINDR ESAFRARKLATISTDATLDLPLQEIEYRGIDYDKLVLFYQDLDFKQQLAKIKALRKSGQIAGGDEQNETQVHVVTLTDTN LRAVTMLGKKVAVHIETTGDNYHIDEMIGFVIGNPEVGYYASRDMTLLQTTELKSIIEDENVVKNVFNVKAQLILFKRLG LQLKGTYFDFLLAAYLLDTTDNDNELSTLAQRFDVYMSSDDEIYGKGAKFAVPDDEGRVLMHLAHKADTLMQLELPALAA LKAHEQMHLYTEIELPLAHVLADMEYQGIRINQTRLYDMGVDLQGRIHTIEDAIYIEAGEKFNINSPKQLGILLFEKMGL PVIKKTKTGYSTAVDVLEKLASQAPIVDHILQYRQLAKLKSTYIDGMLSVVYPQDSKIHTRFLQTLTQTGRLSSVDPNLQ NIPMRTEEGRLIRKAFVPSEPNWQIFGADYSQIELRVLAHITGDKNMQKAFLNGEDIHAETARAVFGLADDTPVDANMRR TAKAVNFGIVYGISDFGLANNLGISRAEAKQFIDTYFKEFPQIHEWMDKIKQSAHELGFVETIAKRRRYLPNIQSKNFNL RSFAERTAMNSPIQGSAADIIKIAMIKVNSALKENNLQARMLLQVHDELIFEAPSNEISELSELVTSVMDSAVSLDVPMK VDNHYGDTWYDAK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
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