|
Name : C270_02050 (C270_02050) Accession : YP_006795324.1 Strain : Leuconostoc carnosum JB16 Genome accession: NC_018673 Putative virulence/resistance : Unknown Product : OpuABC protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 428438 - 430144 bp Length : 1707 bp Strand : + Note : COG4176 ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component DNA sequence : ATGCTTAATTTACCAAAAATCCCACTAGAAAGTTGGGTAACTGATGCTGTTAATTGGTTGACACAGCATTTAGCTGCTTT ATTTAATTTCATGCAGTCAGTTGGTAAAATTGTGATGGATAATATGACGGCAGGTTTAATAGCTATTCCTATGCCGTTAA TGATTGCGGGTATTACATTAATTGCTATTTTGACAACATCGAAGAAATTCGGTTTTCCACTTTTTACTTTAGTCGGGTTG TCATTGATTGCTAACCAAGATTTGTGGAATGATTTGATGAATACCGTTACTTTGGTAATTATGGCATCGGTCATTTCGTT AATTATCGGTATTCCATTGGGTATTTTGACTGCCAAGTCTGCAAAAACGGCTGCAGTTGTTAAACCAATTCTTGATTTTA TGCAGACAATGCCTGGTTTTGTATACTTGATTCCAGCTGTTGCATTCTTTGGTATTGGTGTTGTACCTGGGGTCTTCGCC TCAATAATATTTGCTTTACCACCTATGGTACGTATGACAGATTTGGGTATCCGTCAAGTACCTACTGCTTTAGTTGAAGC AGCTGATTCTTTTGGCTCAACAACTTGGCAAAAATTGATTAAGTTAGAATTACCAAGTGCAAGAAATACTATTTTAGCTG GTGCCAATCAAACTATTATGTTGGCCTTATCGATGGTGGTAACAGCATCGATGATTGGTGCGCCTGGATTAGGACGTGGT GTGTTGTCTGCTGTACAGCATGCTGATGTGGGATCTGGTTTCGTTAATGGTTTAGGATTGGTTATTTTAGCTATTATCAT TGACCGTTTCACACAGAAATTGAATACAACATCAGGTCAAAAAACAGTCGCTAAACCATGGCGTCGCTGGGCTATATTAG CTGCAGTAGTTGTTATGATTGGTGGTGGTGTTGTGAACTCACTGACTTCCAATAAAACTACTGGACAAAAAGTCAATATC GGCTATGTGGAATGGGATTCGGAAGTGGCATCTACTAATGTTGTAGCAGAATCATTACGTCAGCATGGTTACGATGTTAC AATTACACCGCTAGATAATGCTGTTTTATGGCAATCAGTAGCTAATGGCCAGGTAGATGCTTCAGTAAGTGCATGGCTAC CCGTAACACATAAAACCTTATACGATAAGTATAAGAAAGATTTGAAGGTACTAGGACCAAACTTACGCGGAGCTAAAACA GGGCTTGTTGTGCCAGATTATATGAAAGCTAACTCTATTGAAGATCTGACTAATCAAGCTGGCAAAACAATTACTGGTAT TGAACCAGGGGCTGGTGCTATGGCTAGTGCCCAAAAGACTATTGATAGTTATTCAAATCTGAAAGGATGGAACCTATTAG GATCATCATCTGGAGCTATGACAACAGCGTTAGATAAGGCATATAAAAATAAGCAAGATATTATCGTGACCGGTTGGTCA CCTCATTGGATGTTTAGTAAGTATCATTTGAAATACTTAGAAGATCCGAAGGGAACAATGGGTAAAGGTGAAAACATCAA TACTTTTGTTCGTAAGGGGCTTAAAAGTGACAATCCAAAGTTGGAAAAAATATTTGATCGATTCCACTGGACTAAATCAG ATATGGAGAGTGTGATGCTAGAAATTCAAAATGGCAAATCACCTAAACAAGCAGCAGCTGACTGGATAAAAGCAAATAAA AAATCAGTTGATAGTTGGTATAAATAA Protein sequence : MLNLPKIPLESWVTDAVNWLTQHLAALFNFMQSVGKIVMDNMTAGLIAIPMPLMIAGITLIAILTTSKKFGFPLFTLVGL SLIANQDLWNDLMNTVTLVIMASVISLIIGIPLGILTAKSAKTAAVVKPILDFMQTMPGFVYLIPAVAFFGIGVVPGVFA SIIFALPPMVRMTDLGIRQVPTALVEAADSFGSTTWQKLIKLELPSARNTILAGANQTIMLALSMVVTASMIGAPGLGRG VLSAVQHADVGSGFVNGLGLVILAIIIDRFTQKLNTTSGQKTVAKPWRRWAILAAVVVMIGGGVVNSLTSNKTTGQKVNI GYVEWDSEVASTNVVAESLRQHGYDVTITPLDNAVLWQSVANGQVDASVSAWLPVTHKTLYDKYKKDLKVLGPNLRGAKT GLVVPDYMKANSIEDLTNQAGKTITGIEPGAGAMASAQKTIDSYSNLKGWNLLGSSSGAMTTALDKAYKNKQDIIVTGWS PHWMFSKYHLKYLEDPKGTMGKGENINTFVRKGLKSDNPKLEKIFDRFHWTKSDMESVMLEIQNGKSPKQAAADWIKANK KSVDSWYK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 2e-140 | 60 |
