Gene Information

Name : C270_06075 (C270_06075)
Accession : YP_006796123.1
Strain : Leuconostoc carnosum JB16
Genome accession: NC_018673
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1275968 - 1277206 bp
Length : 1239 bp
Strand : -
Note : COG3641 Predicted membrane protein, putative toxin regulator

DNA sequence :
ATGAGTATTAAAGCAGATGGTCACAAATGGGCCACAAAAGAATCTCAAGAAGTACGTAATGAAGAGTATGCACGTAAAGC
CACTGAAATTGCAACGGTTGAGTTTAGTGGTGCTACAGAATTAAAATTGAAGGATTTTTTCTTTAAAGTACTGTCTGGAT
CAGCGCAAGGTATTTTGATTGGTGTGCTACCTTCAGCTGTTATGAAGTATATCATTCAATACTCTGGTTTGGGTGCAACA
GATTTTGGTGCTAACTTAAGTGCGATTTTAACTTTGTTTACATCATTGATACCATTCTTAATTGGTATGGCGGTTGCATT
ACAGTTTAAAATGAAGAGTTTGGATGTCGGTGTTGTTGCCGTTGCAACAGCAGTTGCCTCTGGATCCATCAAGTGGGCAA
CTGCACCAGCGGGCTTTACCAATCCAGTTACAGGGTTGAAGTCGATAGCACCAGCTAATGTTTATATTGCTAGTGGTGCC
GGTGATGTTATCAATGCGATGATTGTTGCTGCTATTGCTGTACTAGTAACATGGTTGGTATCACGATATCTTAAAGGATT
TGGTTCAGTTGCTATTATTTTAAGTCCCATTATCGTTGGTGGCGGTGTCGGCTTAATAGGTAAGTATATTGCACCTTACG
TCGGATTAGTAACAACAGAAATTGGTGATTTGGTAGCAACATTTACTAAACTCGCGCCAATTCCAATGTCTATTCTGATT
GCCATGGCATTTGCCATTATTATTATTACACCAGTATCAACAGTTGGAATTGCTTTGGCTATTTCATTGTCTGGTATTGG
TTCGGGTGCTGCAGCCATGGGTGTTGTGGCAACAACGATTGTATTATTGATTAATTCTTGGCGTGTTAATAAGCCTGGTG
TGACTATTGCCATTGCTTTAGGTGCTATGAAAGGCATGATGCCTTCAGTATTTGCTAAGCCAGTTACAATGTTACCATTC
TTATTGACAGCAGCTATTTCTGGTATTCCTGTTGCTTTGTTTAATATTCAAGGAACACCGGTAACGGCTGGATTTGGTTA
TATTGGGTTAGTTTCACCAATTCAATCTATGGTAAAAGATCCAAGTGTACCAGCGAGCGTAATGAACCACTTCATTAACC
CTATTGTGGCGTTAATTGCTTGGTTGATTGTTCCAATAATTGCTGGATTTATCGCTCAGTTTATATTTAGCAAGTTATTG
AAATTATATTCTCCAATGGATTTTCAACAAGATTTATAA

Protein sequence :
MSIKADGHKWATKESQEVRNEEYARKATEIATVEFSGATELKLKDFFFKVLSGSAQGILIGVLPSAVMKYIIQYSGLGAT
DFGANLSAILTLFTSLIPFLIGMAVALQFKMKSLDVGVVAVATAVASGSIKWATAPAGFTNPVTGLKSIAPANVYIASGA
GDVINAMIVAAIAVLVTWLVSRYLKGFGSVAIILSPIIVGGGVGLIGKYIAPYVGLVTTEIGDLVATFTKLAPIPMSILI
AMAFAIIIITPVSTVGIALAISLSGIGSGAAAMGVVATTIVLLINSWRVNKPGVTIAIALGAMKGMMPSVFAKPVTMLPF
LLTAAISGIPVALFNIQGTPVTAGFGYIGLVSPIQSMVKDPSVPASVMNHFINPIVALIAWLIVPIIAGFIAQFIFSKLL
KLYSPMDFQQDL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
ef0036 AAM75242.1 EF0036 Not tested Not named Protein 2e-43 48
EF0516 NP_814295.1 hypothetical protein Not tested Not named Protein 2e-43 48