Gene Information

Name : HIMB59_00007540 (HIMB59_00007540)
Accession : YP_006758128.1
Strain : alpha proteobacterium HIMB59 HIMB59
Genome accession: NC_018644
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cytochrome c oxidase subunit I
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 1.9.3.1
Position : 695848 - 697443 bp
Length : 1596 bp
Strand : +
Note : PFAM: Cytochrome C and Quinol oxidase polypeptide I; TIGRFAM: cytochrome c oxidase, subunit I

DNA sequence :
ATGAGCACAGCTGCTACATCACTAGACGATCATCACGATCATAAGCCAAATTTTTTTGTACGATGGTTTTTTTCAACGAA
CCATAAAGACATAGGAACTCTTTATTTTATTTATGCGATTATAGCTGGAGTCATTGGTGGAGCTTTATCTGTCATCATGA
GAATGGAGCTAGCAGACCCGGGTATGCAAGTAGTAACTGACGGTCAGATGTGGAATGTTATCATCTCTGCTCATGGACTT
TTGATGATTTTTTTCGTTGTTATGCCTGCTCTAATTGGTGGTTTTGGTAACTGGTTCGTTCCATTAATGATTGGCGCTCC
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TTGTTGGGAGTGGTGCTGGAACAGGATGGACTATTTATCCTCCTTTGAGTTCGATTACTGGCCATAGTTCTCCTGCAGTA
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GGTGGAGGTGACCCTGTTCTTTTCCAACACCTTTTCTGGTTCTTTGGACACCCTGAAGTTTACATTATGATCCTTCCTGC
CTTTGGTATCATCTCTCATATCGTTTCTACTTTTTCTAAAAAGCCTGTTTTTGGTTACTTAGGTATGGCCTATGCTATGG
TAGCAATTGGGTTTATCGGTTTTGTTGTATGGGCTCACCATATGTACACAGTTGGATTTAGTGCCAATGTAAGAGCTTAC
TTTATGCTTGCCACCATCGTAATTGCCGTTCCAACTGGTGTAAAAATCTTTAGTTGGATTGCCACGATGTGGGGTGGTTC
AATTACTTTCACAACACCAATGTTGTTCGCACTTGGATTTATATTCCTATTTACCCTTGGCGGCGTTACTGGAGTTATCT
TAGCAAATGCAGGTGTTGATGTGGTTCTACATGATACTTACTATGTTGTCGCTCACTTCCATTATGTTTTAAGTATGGGT
GCTGTTTTTGGTATATTTGCTGGAATTTATTACTGGTTTAGTAAAATGACAGGAAAGCAATATTCAGAATTTTTCGGAAA
ATTACATTTCTGGTTATTTTTTGCTGGTGTAAACTTAACATTCTTCCCTCAACACTTTCTAGGATTAGCGGGTATGCCAA
GAAGAATTCCAGATTACCCTGATGCCTATGCAGGATGGAATGCAATTTCTTCTTTAGGATCTTATATATCCTTTGGCTCA
TTCTTACTCTTCTTGGTTGTGATGATCATAGCTTTAATTAGTGGTAAGAAAGCAGAAGCAAATCCATGGGGTGAAGGAGC
AAAAACATTAGAGTGGACTTTGCCTTCTCCACCACCTTATCACCAGTTTGAAACTTTACCTGAAGTTAAGAATTAA

Protein sequence :
MSTAATSLDDHHDHKPNFFVRWFFSTNHKDIGTLYFIYAIIAGVIGGALSVIMRMELADPGMQVVTDGQMWNVIISAHGL
LMIFFVVMPALIGGFGNWFVPLMIGAPDMAFPRLNNISFWLLIPSLLLIVGSMFVGSGAGTGWTIYPPLSSITGHSSPAV
DMAIFSLHLAGASSILGAVNFITTILNMRAPGMTLHKMPLFAWAMLVTAFLLLLAVPVLGGAITMLLTDRNFGTTFFDPA
GGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIMILPAFGIISHIVSTFSKKPVFGYLGMAYAMVAIGFIGFVVWAHHMYTVGFSANVRAY
FMLATIVIAVPTGVKIFSWIATMWGGSITFTTPMLFALGFIFLFTLGGVTGVILANAGVDVVLHDTYYVVAHFHYVLSMG
AVFGIFAGIYYWFSKMTGKQYSEFFGKLHFWLFFAGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPDAYAGWNAISSLGSYISFGS
FLLFLVVMIIALISGKKAEANPWGEGAKTLEWTLPSPPPYHQFETLPEVKN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1478 YP_001800872.1 cytochrome c oxidase subunit I Not tested Not named Protein 2e-89 44