|
Name : HIMB5_00010710 (HIMB5_00010710) Accession : YP_006756998.1 Strain : alpha proteobacterium HIMB5 HIMB5 Genome accession: NC_018643 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 990614 - 992572 bp Length : 1959 bp Strand : + Note : PFAM: Transketolase, thiamine diphosphate binding domain; Transketolase, C-terminal domain; Transketolase, pyrimidine binding domain; TIGRFAM: transketolase, bacterial and yeast DNA sequence : TTGAACACACAATATAAAGACCTAGCGAATTGTATCAGATTTTTATCAATTGATGCTGTGCAAAAAGCAAATTCTGGACA TCCCGGAATGCCTATGGGGATGGCAGACGTTGCTACAGTTTTATTTAAAGATTTTTTAAAATTTAGTCCTTCTAACCCTA GCTGGATTAACAGAGACAGATTTATTTTGTCTGCTGGTCACGGATCGATGTTGCTTTACTCCTTACTTTACCTAACTGGA TACAAAAGCATATCGCTCAAAGATATTAAAAATTTTCGTCAACTTAACTCTATTTGTGCTGGTCACCCTGAGTACCATCC TAATACAGGAATTGAGACAACAACTGGGCCCCTAGGACAAGGAATATCAAATGCTGTTGGTTTTGCAATTGCTGAGGAAA TTTTAAAAAGTAAATTTGGTAGTAAAATTATCAATCATAAAACTTATGTCCTTGCTGGAGATGGATGCTTAATGGAAGGT ATTAGTCATGAAGCGATGAGTTTAGCTGGACACCTAAAACTTAAAAATTTGATAATGTTGTTCGATAATAATTCTATTTC TATCGATGGTCCAACTGACTTGGCCGTTTCTGATAATTATAAAAAAAGGTTCGAAAGTTATGGATGGAATTATATTAATG TTGATGGACATAATTTTAGTGAAATTAAAAAAGCAATAAAAAAAGCACATTCTGCTAAATCTCCAACTGTAATTTCATGT AAAACAAAAATTGGTTATGGTTCTCCAAATAAATCTGGCAAAGCTTCTTCTCATGGAAGTCCATTAGGATCAGAAGAAAT AAACTTAGTGAGAAAAAAATTGAATTGGAACTATAAACCTTTTGAAATTCCAAAAAATTTATTAGATCAATGGAAAAGTT TTGGCTTAAATGGATTAAAAATTGAAAAAAAATGGAATAGGATTTTTTTAAAAAAAAAGAAACAATACAATAATTTTATA AAAATAAATTTTAACAAAGGTATTAAATTAGAAAAGATTTCTGCAATTAAAAATCAAAAAGGCCTTGCTACACGAAAGGC TTCAGAGTCAGTTTTAAATTCAATTACTCCAGATTGTAAGAATATTATTGGTGGATCTGCTGATCTGGCAGGATCAAACA ATACAAAAACAAAATTTCATGAAATATTAAAACCAAAAAAATTTAATGGGAATTATATTCATTATGGTGTTCGTGAACAT GCCATGTGTGGAATAATGAATGGTCTTTCATTACATAGTAATTTAATTCCTTATGGTGGTACTTTTTTGATTTTTTCAGA TTATTGCAAACCTTCTATTCGGTTATCAGCATTAATGGAACAACAAGTAATTTATGTGATGACACATGATTCAATTGGTT TAGGAGAGGATGGACCAACACATCAACCTATAGAACAATTAGAAGGTCTCAGAGCAATACCAAATTTAAATGTATTCAGA CCTGCTGACAGATATGAAACAATTGAATGTTGGGAATTAGCTTTAAAGAATAAACAAACTCCATCAATTCTATCATTGAC AAGACAGAATTTAAATCCGGTTAGATATAATATCTCAAAAGTTAATAAATGTTCTTATGGGGCTTATGAAATATCTAGGA CTAATAAAAAAATTCAATTAACTATTTTAGCAAGTGGTTCCGAGGTTAATTTGGCTTTAGAGGTAAGCAATGAATTAAAA AAATATAAAATTAATTCAAAGGTTATTTCTGTACCTTCACAAGAAATCTTTGATAAACAAAGTAAAAATTATAAAAAGAA AATATTGAATGAAACAAAACTTAAAATTTCAATTGAAGCTGGATCAAAAACATCTTGGTACAAATATGTGGGTGATAAAG GAATGACATTTGGTATTGATGAATTTGGAAAAAGTGCGCCTTATAAAAAAATATTTGAATATTTCGGTTTATCTACAAAA AAAATAACTACAAAAATAAGAAATAATTATAGGACGTAA Protein sequence : MNTQYKDLANCIRFLSIDAVQKANSGHPGMPMGMADVATVLFKDFLKFSPSNPSWINRDRFILSAGHGSMLLYSLLYLTG YKSISLKDIKNFRQLNSICAGHPEYHPNTGIETTTGPLGQGISNAVGFAIAEEILKSKFGSKIINHKTYVLAGDGCLMEG ISHEAMSLAGHLKLKNLIMLFDNNSISIDGPTDLAVSDNYKKRFESYGWNYINVDGHNFSEIKKAIKKAHSAKSPTVISC KTKIGYGSPNKSGKASSHGSPLGSEEINLVRKKLNWNYKPFEIPKNLLDQWKSFGLNGLKIEKKWNRIFLKKKKQYNNFI KINFNKGIKLEKISAIKNQKGLATRKASESVLNSITPDCKNIIGGSADLAGSNNTKTKFHEILKPKKFNGNYIHYGVREH AMCGIMNGLSLHSNLIPYGGTFLIFSDYCKPSIRLSALMEQQVIYVMTHDSIGLGEDGPTHQPIEQLEGLRAIPNLNVFR PADRYETIECWELALKNKQTPSILSLTRQNLNPVRYNISKVNKCSYGAYEISRTNKKIQLTILASGSEVNLALEVSNELK KYKINSKVISVPSQEIFDKQSKNYKKKILNETKLKISIEAGSKTSWYKYVGDKGMTFGIDEFGKSAPYKKIFEYFGLSTK KITTKIRNNYRT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 2e-135 | 46 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 1e-128 | 44 |
