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Name : C269_03740 (C269_03740) Accession : YP_006745077.1 Strain : Leuconostoc gelidum JB7 Genome accession: NC_018631 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 781668 - 784349 bp Length : 2682 bp Strand : + Note : COG0258 5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI) DNA sequence : ATGACAAAAAAACTACTTTTAATTGATGGTAATTCACTTGCTTTTCGGGCTTTTTATGCTATGTACAATCAACTTGATAG AATGATTTCACATAAAGGACTGCACACTAACGCACTAGTGGCATTCAATAATTTTTTGGATCAAATTGTGGATCCAATGC AACCAGATTTAGCTGTTGTAGCATGGGACGCGGCTTCTGGGAAAGAAACTTTCCGCGGTGAATTATTTCCAGAATACAAA GATGGCCGTTCAAAAGCGCCGTCAGAGTTTAAAGAGCAGTTTCCGTATTTACGTGAAATGGTTGCATTACATGGATTGCG AAATTATGAACAACCAGGCTTAGAGGCAGATGATATTATTGGTACTTATTCACGTTTGGGGGAACAAGCTGGGTACACGG TGATTATTGTAACTGGTGACCAGGATTTGACCCAATTAGCCACAGATAAAATTACAGTTAATGTGACTAAAAAAGGTGTG ACGGAAATTGAACGTTACACGCCAGACTATATCATGGAAAAGTTTAACTTGACACCGTTACAAATTATTGAAAAAAAAGC TCTAACAGGCGATACATCCGATAATTATCCAGGTATAACAAAAGTTGGTGAGAAAACGGCTTTAAAATTGTTAGCTGAGT ATCACGATATTGACAATCTATATGCACATGTTGATGATATGAAACAATCTAAATTAAAAGATAATTTAATTAATGATCGT CAACTAGCCTTTTGTGCTAGAAAATTAGCAACAATCCTGACAGATGCTACCTTGGCATTGCCACTAGAAGAAATTGAATA TCGTGGGATTGATTACGATAATTTGGTGACATTCTATGAAAATTTAGATTTTAAAAAACAGCTTGCTAAGATTAAGGCAC TACAAAAGTCAGGTCAAATTTCAGGCAGTCAAACAACTGTTGAAAAGAGCATTAATGTGATAAAGCTTCAAGATGACAAT TTACAAGCTGTTGCCATGTTAGGTACCAAAATCGCCTTTCATATTGAAATGGTAGGGCAAAATTATCACATTGACGACAT GGTGGGTTTTGTGATAGGAAGCCCAGCCACAGGCTATTATGGTAGTCGTGATGTGACACTTTTGCAAAGGCCAGAATTAA AGTCTGTGATTGAAAACGCTGGTATAATCAAAAACGTATTTAACATTAAGGCACAGTTGATATTGCTTAAAAGATTAGGT ATCAAACTTAAAGGAACGAAATTTGATTTCTTATTGGCATCATATTTACTTGATACAACTGATAATGATAATGAATTAGC AACCCTTGCCCAACGCTTTGATCTTTATATGACATCAGATGAGGATATTTATGGTAAAGGGGCTAAATTTGCAATACCCG AAGATGACGCTCGTGTGTTAGCACATTTAGCAAATAAAGCAGATATTTTAATGCAAGTGGAACAATTAGCATTTGACGCA TTGCAAGAACATGAGCAAACACATTTATATACAGAAATAGAATTGCCATTAGCTCAAGTATTAGCAGATATGGAGTACCA AGGGATTAAAATTGATCAGAAAAGATTGCGTGATATTGGTAGTGACCTTGAGGGTCGAATTCATGCAATTGAAAATGCAA TTTATATAGAAGCAGGTGAAAAATTCAATATTAATTCTCCAAAGCAACTTGGTGTACTTCTTTTTGAAAAAATGGGTTTG CCAGTAGTTAAACGAACGAAAACTGGCTATTCAACAGCTGTTGATGTATTGGAAAAATTAGCGGCACAAGCACCAATTGT CGATCATATTTTGCAATATCGTCAACTGGCAAAATTAAAATCTACTTACGTTGAAGGATTATTAACTGTTGTGCATGATC AAGATAGTAAAATTCATACCAGATTTTTACAAACGTTAACGCAGACAGGACGTTTGTCATCGGTAGATCCAAACCTACAA AACATTCCTATGCGAACAGAAGAGGGTAGGCAAATTAGAACAGCATTTGTACCAAGTGAACCAAATTGGCAAATTGTTGG TGCTGATTATTCACAAATTGAGTTACGTGTGCTTGCCCATATGACTGGAGACAAAAACATGCAGCGGGCGTTTTTGAATG GCGAAGATATTCATGCTGAAACGGCACGCGCTGTTTTTGGCTTAAAAGATGATGCGCCGGTTGATGCACTTATGCGGCGT ACAGCAAAAGCTGTTAATTTTGGCATTGTTTACGGGATTTCTGATTTTGGATTAGCCAATAACTTAGGTATTTCACGTGC GGAAGCTAAAAATTTTATTGATACCTATTTTAAGGAGTTCCCTCAAATTCATGCTTGGATGGCAAAAATTAAAGAGATAG CCCACGAACAAGGTTTTGTCGAAACAATTGCCAAACGCCGTCGTTATTTACCAGAAATTAGTTCAAAAAACTTTAATTTA CGTAGTTTTGCGGAGCGAACAGCGATGAATTCACCAATTCAAGGTTCAGCAGCTGATATCATTAAAATAGCAATGATTAA AGTAGCTGATGCGTTACGAGATCATCACATGCAAGCACGTATGTTATTACAAGTTCATGATGAACTGATTTTTGAAGCAC CAATGGATGAAATCCAAGAGCTGACAGAATTGGTCACAAACGTTATGGATTCCGCTGTTGTATTAGATGTGCCTATGCGT GTCGAAAGCCATTATGGCAATACTTGGTATGATGCAAAATAG Protein sequence : MTKKLLLIDGNSLAFRAFYAMYNQLDRMISHKGLHTNALVAFNNFLDQIVDPMQPDLAVVAWDAASGKETFRGELFPEYK DGRSKAPSEFKEQFPYLREMVALHGLRNYEQPGLEADDIIGTYSRLGEQAGYTVIIVTGDQDLTQLATDKITVNVTKKGV TEIERYTPDYIMEKFNLTPLQIIEKKALTGDTSDNYPGITKVGEKTALKLLAEYHDIDNLYAHVDDMKQSKLKDNLINDR QLAFCARKLATILTDATLALPLEEIEYRGIDYDNLVTFYENLDFKKQLAKIKALQKSGQISGSQTTVEKSINVIKLQDDN LQAVAMLGTKIAFHIEMVGQNYHIDDMVGFVIGSPATGYYGSRDVTLLQRPELKSVIENAGIIKNVFNIKAQLILLKRLG IKLKGTKFDFLLASYLLDTTDNDNELATLAQRFDLYMTSDEDIYGKGAKFAIPEDDARVLAHLANKADILMQVEQLAFDA LQEHEQTHLYTEIELPLAQVLADMEYQGIKIDQKRLRDIGSDLEGRIHAIENAIYIEAGEKFNINSPKQLGVLLFEKMGL PVVKRTKTGYSTAVDVLEKLAAQAPIVDHILQYRQLAKLKSTYVEGLLTVVHDQDSKIHTRFLQTLTQTGRLSSVDPNLQ NIPMRTEEGRQIRTAFVPSEPNWQIVGADYSQIELRVLAHMTGDKNMQRAFLNGEDIHAETARAVFGLKDDAPVDALMRR TAKAVNFGIVYGISDFGLANNLGISRAEAKNFIDTYFKEFPQIHAWMAKIKEIAHEQGFVETIAKRRRYLPEISSKNFNL RSFAERTAMNSPIQGSAADIIKIAMIKVADALRDHHMQARMLLQVHDELIFEAPMDEIQELTELVTNVMDSAVVLDVPMR VESHYGNTWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 50 |
