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Name : C269_02740 (C269_02740) Accession : YP_006744877.1 Strain : Leuconostoc gelidum JB7 Genome accession: NC_018631 Putative virulence/resistance : Unknown Product : OpuABC protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 569207 - 570913 bp Length : 1707 bp Strand : + Note : COG4176 ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component DNA sequence : ATGCCTAATTTACCTAAAGTACCATTAGAAAGTTGGATAAGTGAGGGTGTTAACTGGCTGACAACACATTTATCTGGGCT ATTTAATTTGATGCAAAGAAGTGGACAGAGCATCATGGATGGCCTAACCAACGGCTTGACAGCAATACCTATGCCATTGA TGATTGCTGGATTAACGGTTATAGCTATTTTAACAACACCTAAAAAATACGGTTTTCCCTTATTCACCTTAGTTGGCTTG GCATTAATTGCCAATCAAAATTTATGGTCAGATTTGATGAGTACAGTGACATTGGTTATTATGGCATCTGTCATTTCACT TGTGATTGGTATTCCATTAGGAATTATTACTGCCAAATCGCCAAAAACTGCCGCAATTGTCAAACCAATTTTGGATTTCA TGCAGACAATGCCTGGCTTTGTTTACTTGATACCTGCTGTTGCCTTCTTTGGCATAGGCGTGGTACCTGGTGTATTCGCT TCAATTATATTTGCACTGCCACCAATGGTGAGAATGACTGATTTAGGTATTCGTCAAGTACCTGTGGCACTGGTTGAAGC TGCTGATTCTTTTGGATCAACAACTTGGCAAAAATTGATTAAGCTTGAATTACCAAATGCCCGAAATACGATTTTGGCTG GTGCAAACCAAACAATTATGTTAGCATTATCAATGGTTGTGACTGCATCAATGATTGGGGCACCCGGCCTTGGTCGCGGA GTATTATCTGCTGTACAACGGGCAGACGTGGGTTCGGGTTTTGTTAATGGCCTTGGATTAGTTATTTTAGCTATTATTAT TGATCGTTTTACGCAAAAGTTAAATACCAAACCGGGACAAAAATTAGTAACACGCCCTTGGCGTCGCTGGGCAATTTTAG CCACAGCACTCATCATGGTTGGTGGTGGCGTTGTTAATGCGGCAACATCACAAAAATCATCTGGTCAAAAAGTCAATCTT GGTTATGTTTCTTGGGATTCTGAAGTGGCTTCAACAAACGTATTGGCTGAGTCGCTTCGACAACATGGTTACGATGTGAC AATGACACCACTAGATAATGCTGTGTTATGGCAGTCATTGGCAAATGGTCAAGTTGATGCATCAGTTTGTGCATGGCTAC CATTTACGCATAAAGCATTATATGATCGATATAAAAATGATATCACGCTACTTGGGCCAAACTTACATGGTGCTAAGACT GGCTTTGTTGTACCAGATTATATGAAAGTGAATTCAATTGCTGATTTAACTAATGAAGCAAATAAAACGATTACTGGTAT TGAACCTGGTGCTGGTGAAATGATTACCGCACAAAAAACAATGGATAGTTATGCAAATCTTCAGGGATGGAACCTACTAA GTGCCTCTTCAGGCGCTATGGCGACTGCACTTGACAAAGCTTATAAAACAAAACAAGATATTGTGGTAACAGGATGGTCA CCTCATTGGATGTTTAGTAAGTATAAGTTGAAGTATTTACAAGATCCAAAGGGAACAATGGGTAAAGGTGAAAGTATCAA TACCATTACGCGCAAAAATTTGAAAAAAGATAATCCTAAATTTGAAAAAGTGATGGATAAGTTTAATTGGACTAAAGAAG ATATGGAAAGTGTCATGCTTGACATACAAAATGGTGCAACACCAAAGCAAGCAGCAACAAAATGGTTGAAATCGCATCAA AAGCTTGCTGATAGTTGGTATAAGTAG Protein sequence : MPNLPKVPLESWISEGVNWLTTHLSGLFNLMQRSGQSIMDGLTNGLTAIPMPLMIAGLTVIAILTTPKKYGFPLFTLVGL ALIANQNLWSDLMSTVTLVIMASVISLVIGIPLGIITAKSPKTAAIVKPILDFMQTMPGFVYLIPAVAFFGIGVVPGVFA SIIFALPPMVRMTDLGIRQVPVALVEAADSFGSTTWQKLIKLELPNARNTILAGANQTIMLALSMVVTASMIGAPGLGRG VLSAVQRADVGSGFVNGLGLVILAIIIDRFTQKLNTKPGQKLVTRPWRRWAILATALIMVGGGVVNAATSQKSSGQKVNL GYVSWDSEVASTNVLAESLRQHGYDVTMTPLDNAVLWQSLANGQVDASVCAWLPFTHKALYDRYKNDITLLGPNLHGAKT GFVVPDYMKVNSIADLTNEANKTITGIEPGAGEMITAQKTMDSYANLQGWNLLSASSGAMATALDKAYKTKQDIVVTGWS PHWMFSKYKLKYLQDPKGTMGKGESINTITRKNLKKDNPKFEKVMDKFNWTKEDMESVMLDIQNGATPKQAATKWLKSHQ KLADSWYK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 1e-150 | 57 |
