Gene Information

Name : C269_08900 (C269_08900)
Accession : YP_006746100.1
Strain : Leuconostoc gelidum JB7
Genome accession: NC_018631
Putative virulence/resistance : Resistance
Product : copper-translocating P-type ATPase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1854855 - 1856909 bp
Length : 2055 bp
Strand : +
Note : COG2217 Cation transport ATPase

DNA sequence :
ATGAAAATGACTGAACATAGCCATCACGATATGGCCGACATGCCTATGACTGAAAACATGGCTGATCATGATATGTCACA
TCACCACATGCATATGACTGCTGACCCTGGTATGGCTAATATGGATATGACTGACATGAAACGCCGCTTTTGGTGGTCTT
TTGGTTTAATGATGCCAATCATTATCATCACCCCTTTCATGGGCTTATCTTTACCATTCACACTGACTTTTCCTGGCAGT
AATTGGGTCACAGCTATACTCTCTGTGCTACTTTATTTTATTGGATCAAAGCCATTTTTTGATGGTGCCAAAAGTGAAAT
CAAAGCTAAAAAGCCAGCAATGATGAGCCTTGTTAGCATGGGACTACTGGTCACGTTTTGGTATTCAATCTATGCTTTAC
TAGCCAATCAATTCGTTCACGGTACTCATATCATGGATTTTTTCTGGGAATTTGCTACCTTAACAGTCATTATGCTACTG
GGTCATCGAATTGAAATGGCAGCAACCATGAAAGCTGGTGACGCCACAGATAAATTACGAGCATTAATGCCAAATATTGC
CCATGTCAGGCACGGCGATATGATGATGGATATGCCACTTCATACATTGAAACCTGGCATGATTGTCCAAGTATTAGCAG
GCGAAGCATTTCCAGCAGATGGTGTTGTAATCACAGGTCACAGTCAAGTTGATGAGTCTCTTATGACTGGTGAAAGTCAA
CTGATTGATAAATCTGAAAATAGCCCTGTTGTTGGTGGCACAATTAACGGTAATGGCTCGTTAGATTTGCGATTAACTCA
AGTTGGTAACAATTCTTTTGTAGGTCAATTGCAGGGTGTCCTAGCAACATCACAAGATCAAAAATCACGTGTTGAAACAC
TGGCCGATCGTGTCGCCAGCTACCTTTTCTGGTTAGCTTTAATTTTTGCTTTAGTTGCCTTAATTGTTTGGACCAGTCTA
CGTGGCCTGAGCGCTGCTATTAATATTGCCGTAACTGTCCTCGTGATTGCCTGTCCGCATGCACTTGGCTTAGCTGTGCC
CTTAGTTATTCAACGTACAAAATCAGTAGCCGCGGCACAGGGCATTTTGATTAAAAATCGTAAGGCATTAACCGCCGCAA
ATCATTTGCAATTTGCTTTGATGGACAAAACAGGAACACTAACAACTGGAAAGTTTAGCGTCAATCGCATTATCACTTAT
GGTTTAGATGAAACACAAGCCGTTGCTATTATGTCAGCGCTGGATTCGCAATCAACTCATCCACTCGCTCAATCAATTAC
AGCGTATGGTCGTCAAATTCAGGCCCCTCTGTTACAAGCGGAAAATGTCACAAATATTGCTGGTTATGGTGTTTCTGGTA
TGGTTAATAATACGCATTATTTATTAGTATCTGAACGTTTTTTATCTGAAAAGCATATATTATTCACACCATTACATGAC
GAGGGTTCAATTTCATATTTATTAAAACATGATCAAGTTGTTGCAGCCATCTCACAAGGTGATACTGTTAGAGACACAGC
GTCTGAATTCGTAAAGCATCTTGTTCAGTTAGGTATCACACCTGTTCTTGTCACTGGTGATAACATAAAAACGGCACAAA
ATGTTTCTGCACAATTAGGTATTAGCGCTATTCACGCCCAAGTCTCACCTCAAGAGAAAATTGCCCTAGTCATTAAATAC
CAACAACTAGGTGATGTTATGATGATTGGTGATGGTATAAATGACGCCCCTGCACTTGCGCAAGCAAACTTGTCGATAGC
TATTGGAGCCGGTACGCAAGTCGCACAAGCTGCAGCTGATGCCGTACTGATTGCTAATCAGTTACCAAAAATTATTGATT
TTCTACAACTCATTAAACGCGCTCATACAAAGCAAATTCAAAACTTATGGTGGGGGGCCGGATATAATATTATCGCTATT
CCTTTAGCTGCTGGCGTTTTAGCTACCATTGGTTTAATGCTCAATCCAATGATTGGTGCCATTGTGATGTCGCTTTCAAC
GATTATTGTGACACTTAATGCGATGACGCTTAAAGCGTCACCAAACAAAAAATAA

Protein sequence :
MKMTEHSHHDMADMPMTENMADHDMSHHHMHMTADPGMANMDMTDMKRRFWWSFGLMMPIIIITPFMGLSLPFTLTFPGS
NWVTAILSVLLYFIGSKPFFDGAKSEIKAKKPAMMSLVSMGLLVTFWYSIYALLANQFVHGTHIMDFFWEFATLTVIMLL
GHRIEMAATMKAGDATDKLRALMPNIAHVRHGDMMMDMPLHTLKPGMIVQVLAGEAFPADGVVITGHSQVDESLMTGESQ
LIDKSENSPVVGGTINGNGSLDLRLTQVGNNSFVGQLQGVLATSQDQKSRVETLADRVASYLFWLALIFALVALIVWTSL
RGLSAAINIAVTVLVIACPHALGLAVPLVIQRTKSVAAAQGILIKNRKALTAANHLQFALMDKTGTLTTGKFSVNRIITY
GLDETQAVAIMSALDSQSTHPLAQSITAYGRQIQAPLLQAENVTNIAGYGVSGMVNNTHYLLVSERFLSEKHILFTPLHD
EGSISYLLKHDQVVAAISQGDTVRDTASEFVKHLVQLGITPVLVTGDNIKTAQNVSAQLGISAIHAQVSPQEKIALVIKY
QQLGDVMMIGDGINDAPALAQANLSIAIGAGTQVAQAAADAVLIANQLPKIIDFLQLIKRAHTKQIQNLWWGAGYNIIAI
PLAAGVLATIGLMLNPMIGAIVMSLSTIIVTLNAMTLKASPNKK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SH0105 YP_252020.1 hypothetical protein Not tested SCCmec Protein 6e-94 44

• Homologs from CARD and BacMet (resistance genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
C269_08900 YP_006746100.1 copper-translocating P-type ATPase BAC0079 Protein 9e-122 44
C269_08900 YP_006746100.1 copper-translocating P-type ATPase BAC0383 Protein 9e-113 43