|
Name : serS (PAQ_043) Accession : YP_006732380.1 Strain : Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC Genome accession: NC_018618 Putative virulence/resistance : Unknown Product : seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 6.1.1.11 Position : 54803 - 56068 bp Length : 1266 bp Strand : + Note : KEGG Orthology:K01875 DNA sequence : ATGTTAGATATTAAATTAATTTGCAACAATTTTAATAATGTTGTTAAAAAATTAGCCAGCCGTGGTTATGAATTAGATAT TAAAAAAATTAAAACGTTGCTAGAAATACGCAATAAGTTTAAAACTAATACTGAAACTTTACAAAATAAACGCAATATTA TATCTAAAACTATAGGAAACAACAAGAATTATATATTAAAAGTACAAAAGTTATTTGTAAAAGTAAAAAAAATAAATCAT AAACTTCATAAAAATATTTTATGTTTAGAAGTAACCAACAAAAAAATTTATAATATTTTATTTAAAATACCAAACTTACC ACATAATAGTGTACCAATTAAAACCAATATAGAGATAATACGTTGGGGAGTTCCTAAATCATTTAACTTTTCCATACGTG ATCATATTAAGATAGGCTTATTAAATGGTGATATTGATTTTGAATTAGCAACTAAAATAACTGGTTCTAATTTTACTTTA ATACGTGGAAATTTAGCTAAATTACATCGTGCTTTAATACAATTTATGTTAGATAAGCAAATTAATGATCATGGTTATGA AGAAATGTATGTGCCATATATAATTAATAGAACTTCTTTAGTAGGTACAGGTCAATTACCTCAATTTAATAAAAATGTTT TTGAACTTGAAGGAGAAAATGAATATTTTCTTATTCCTACAGCTGAAGTCCCTTTAGTTAATAGTGTCAGTGGTAAACTT TTCAATGTTAATGATTTACCAATTAAATTAACAGCACATTCTCCTTGTTTTAGAAACGAACCTGTATCTTATGGAACTGA TTCTCGTGGTATGTTGAGACAGCTACAGTTTGATAAAATAGAATTAGTTCAAATAGTACATCCTGAAAAATCTTATGTTG TATTAGAAGATATGACTAACCATGCTGAAGAAATTTTAAAAGCATTAAATTTGCCTTATAGAGTTATAAGTTTATGTAAG GAAGATATTAGTTTTTGTGCATCTAAAACTTATGATATAGAAGTTTGGATTCCTAGTCTTGAAACTTATTTAGAGATTTC ATCGATATCTAATTGTGAGGATTTTCAAGCAAGAAGAATTAAAACTAGATTTCGTATTAATAAAGACAAAGCAAAGCCTA AATTTGTACATACACTTAATGGCTCTGGACTAGCTGTTGGTCGTTGTTTGTTAGCCGTATTGGAATATTATCAAAACGAA GATGGCTCTATTACAGTTCCAGATAGTTTGCGCTCTTATATGTGTGGTATTAACCGTCTTTATTAG Protein sequence : MLDIKLICNNFNNVVKKLASRGYELDIKKIKTLLEIRNKFKTNTETLQNKRNIISKTIGNNKNYILKVQKLFVKVKKINH KLHKNILCLEVTNKKIYNILFKIPNLPHNSVPIKTNIEIIRWGVPKSFNFSIRDHIKIGLLNGDIDFELATKITGSNFTL IRGNLAKLHRALIQFMLDKQINDHGYEEMYVPYIINRTSLVGTGQLPQFNKNVFELEGENEYFLIPTAEVPLVNSVSGKL FNVNDLPIKLTAHSPCFRNEPVSYGTDSRGMLRQLQFDKIELVQIVHPEKSYVVLEDMTNHAEEILKALNLPYRVISLCK EDISFCASKTYDIEVWIPSLETYLEISSISNCEDFQARRIKTRFRINKDKAKPKFVHTLNGSGLAVGRCLLAVLEYYQNE DGSITVPDSLRSYMCGINRLY |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 7e-82 | 44 |
