|
Name : B739_1520 (B739_1520) Accession : YP_006724012.1 Strain : Riemerella anatipestifer RA-CH-1 Genome accession: NC_018609 Putative virulence/resistance : Unknown Product : recG-like helicase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1600528 - 1602618 bp Length : 2091 bp Strand : + Note : - DNA sequence : TTGACTTTAGAAACTTCCATAGAATACCTTAAAGGAGTAGGTCCAGAGCGGGCAAAACTCATCAAAAATCTGCTGGGAAT AAGTACGGTGGAAGATTTGCTTACATTCTACCCAATAAGATATTTAGATAAAAGCCGATTGTATAGAGTAGCAGATTTGC AGAAAAATGCAGATGTTGAGATACAATTAAAGGGTAAAATCAGAGAATTGCAGGAGGTGGTTTATGGTAAGGGACAAAAA CGATTGTCTGCAAAATTCTATGATGAAACAGGCGTGATAGAACTGGTTTGGTTTAGATATACCAAATGGATGGTGGAGCA GATGCCTATCAATAAAGAAGTATTTATTTTTGGTAAGGTCAATTGGTTTAATGGAGTTTTCTCTATGCCTCATCCAGAGA TAGAGCTGGACGAGAAAAAGGCTTTATCTGAAACTTTATTGCCTATCTATTCAGGGAGTGAAAAACTTACCAAAAGAGGG GTTAATAATAAATTTTTCCAAACCATCATCAGGGAAGTTATTAAACAGACTTCTTTCTTTTTAGAAGAAAATTTGCCGAG TAATATCCTTAGCTCGCTTAAACTAATTGGTAGAAGAGAGGCTTATCAAAATATCCATTTTCCTCAAAATATAAATTGGA TAGATGAGGCTAATAAACGCCTGAAATTTGAGGAAGCGTTTTTCTTTCAGCTAGGGTATGGTCTTAAAAAGCAATATCAA AAAGTATCCAATGTAGGGATTCCTTTTCCGTTAGTGGGAGATTATTTTAATAATTTTTATCAAAATAAATTACCCTTTGA ACTCACTAATGCCCAAAAGCGAGTTCTGAAAGAGATTAGGAATGATATGAAAAAGCCTATCCAAATGAACAGGCTTTTGC AGGGCGATGTAGGCTCAGGTAAAACTATGGTGGCGTTGCTTTCAATGCTATTGGCGTTGGATAATGGGACACAAGCGTGC CTTATGGCTCCTACGGAAATTTTGGCTCAGCAACATTATAACAGCATAGTTGAACTTTTAGAAGGAACGAACATTGAAGT AAGGCTCTTAACAGGTTCTACAAAAAAATCGGAACGGAAAGATATTCACGAAGGATTAGAATCTGGGAGGTTGTCTATCT TGGTAGGAACTCACGCTATATTGGAAGATGCGGTTAAGTTTAAAAATTTGGGCTTGGGCATTATAGACGAGCAACATCGT TTTGGGGTGGCACAAAGAGCGAAACTTTGGTCTAAAAATAAAATTCCACCGCATATTTTAATTATGACGGCAACGCCTAT CCCTAGAACTTTAGCAATGAGTTTTTATTCGGATTTAGATGTCTCGGTAATAGATGAGTTGCCTACGGGGAGAAAGCCTA TCATTACAGCTCATAGGAGAGAAAAAGACAGGCTTTCGGTTTACCAGTTTGCTAAGGAAGAAATTCAAAAGGGAAGGCAA ATTTATTTTGTGTATCCACTAATAGAAGAATCTGAGACTTTAGACTATAAAAACTTGATGGAAGGCTTTGAAATAGTACT AGACTATTTTAAGGAATACGAAGTGACCATGCTACACGGCAAAATGAAACCTCACGAAAAAGATGAAGCGATGAATTATT TTGCTTCAGGTAAGGCTCAAATTATGGTGGCTACTACGGTTATAGAGGTTGGTGTAAATGTACCAAATGCTTCGGTAATG GTAATAGAAAGTGCCGAAAGGTTTGGGCTTTCACAGTTGCATCAGCTTAGAGGTAGAGTGGGACGAGGGGCAGAGCAGAG CTATTGTATTTTGATGTCCTCGGACAAACTATCCACGGAAGGACGGAAACGAATTAAAACGATGTGCGAAACCAATGATG GATTTAAAATCTCGGAGGTAGATATGCAACTTAGAGGTCCTGGGGATATATTAGGAACTCAGCAAAGTGGTATTGTAGAT TTTAAAAAATTGGATTTAACTAAAGATGCTTCGGTAATTAAGGTAGCACAGAAAATAGTAACCCTATTGGTGCAAAGCGA TCCTAATTTGACTCATCCTGTACACACTCAATTAAGAAATTACTACATAAAGCAATATAAAGGTAAAAACAAATGGGGAA AAATCAGTTGA Protein sequence : MTLETSIEYLKGVGPERAKLIKNLLGISTVEDLLTFYPIRYLDKSRLYRVADLQKNADVEIQLKGKIRELQEVVYGKGQK RLSAKFYDETGVIELVWFRYTKWMVEQMPINKEVFIFGKVNWFNGVFSMPHPEIELDEKKALSETLLPIYSGSEKLTKRG VNNKFFQTIIREVIKQTSFFLEENLPSNILSSLKLIGRREAYQNIHFPQNINWIDEANKRLKFEEAFFFQLGYGLKKQYQ KVSNVGIPFPLVGDYFNNFYQNKLPFELTNAQKRVLKEIRNDMKKPIQMNRLLQGDVGSGKTMVALLSMLLALDNGTQAC LMAPTEILAQQHYNSIVELLEGTNIEVRLLTGSTKKSERKDIHEGLESGRLSILVGTHAILEDAVKFKNLGLGIIDEQHR FGVAQRAKLWSKNKIPPHILIMTATPIPRTLAMSFYSDLDVSVIDELPTGRKPIITAHRREKDRLSVYQFAKEEIQKGRQ IYFVYPLIEESETLDYKNLMEGFEIVLDYFKEYEVTMLHGKMKPHEKDEAMNYFASGKAQIMVATTVIEVGVNVPNASVM VIESAERFGLSQLHQLRGRVGRGAEQSYCILMSSDKLSTEGRKRIKTMCETNDGFKISEVDMQLRGPGDILGTQQSGIVD FKKLDLTKDASVIKVAQKIVTLLVQSDPNLTHPVHTQLRNYYIKQYKGKNKWGKIS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 4e-93 | 41 |
