Gene Information

Name : C248_0455 (C248_0455)
Accession : YP_006709216.1
Strain : Staphylococcus aureus 08BA02176
Genome accession: NC_018608
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : primase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 463875 - 466238 bp
Length : 2364 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
GTGGCAATTAAGAAAAAAGATAGAATTATTGGAGTTAAAGAATTAGAAATACCGCAAGAATTAAAGTTAGTGCCTAATTG
GGTATTATGGCGAGCTGAATGGAACGAGAAGCAACAAAATTATGGAAAAGTACCATATAGTATTAATGGTTACAGAGCTA
GTACAACCAATAAAAAAACATGGTGTGACTTTGAAAGTGTAAGTATTGAATATGAAGTTGATGAGCAATATAGCGGTATA
GGTTTTGTATTAAGTGATGGTAATAATTTTGTTTGCCTAGATATTGATAATGCAATTGATGAAAAAGGACAAATCAATTC
TGAATTAGCATTAAAAATGATGCGACTCACATATTGTGAAAAGTCTCCAAGTGGTACAGGATTACATTGTTTCTTTAAAG
GTAAACTACCAGATAACCGTAAAAAGAAAAGAACGGATTTAGACATAGAGTTATATGATTCAGCGAGGTTTATGACTGTT
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GCAGTACAAAGCTTGTTACACTATTTAGCGTTTTACACAGGTAAAAACAAACAGCAAATGGAGCGTATATTTTTAAACTA
CAATAATCTTACGGATAAATGGGAAAGTAAACGAGGTAATACGACTTGGGGACAGCTTGAGTTAGATAAAGCTATAAAGA
ATCAAAAGACAATTTATACTAAATCGATAGATGAATTTAATGTTATACCACAGGGGAGTAAAGATGTTAAACAGTTGTTG
AATCAATTGGGGCATGAAGAAAGAACAAAAATGGAAGAAAATTGGATTGAAGAAGGAAAACGAGGGCGAAAGCCTACAAC
AATTAGCCCTATAAAATGTGCATATATTTTGAATGAGCATTTAACATTTATACTTTTTGATGATGAAGAAAATACTAAGT
TAGCTATGTATCAATTTGATGAAGGGATATATACACAGAACACTACAATTATAAAACGAGTGATTTCCTATTTAGAGCCC
AAACATAATAGTAATAAAGCTGATGAAGTTATTTATCATTTAACCAATATGGTAGATATAAAAGAGAAAACTAACTCACC
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CCACTAAAATATCTACTAAGTATAATCCGAATGTTGTCAGACCTAATTTGAATGGATGGGATTTTGATCATTGGTTATAT
GAGATTGCATGTGCTGATAAAGAAATAGTGACTTTATTATGGGAAGTCATAAATGACTCAATGAATGGTAACTACACTCG
TAAAAAGGCTATTTTCTTTGTTGGTGATGGAAATAATGGTAAAGGGACGTTTCAAGAATTAATATCAAATTTAGTAGGAT
ATAAAAATGTTGCTAGCTTAAAAGTAAATGAATTTGACCATGAATTTAAATTAAGTGTACTAGAAGGTAAAGCAGTTGTA
ATTGGTGATGATGTACCGGTAGGCATTAATATTGAAGATTCATCAAACTTTAAAAGTGTTGTCACAGGGGATTCGGTTTT
AGTTAATGTAAAAAATAAACAACCTTATAGAACCGAATTTCGTTGTACCGTTATTCAATCAACAAATGGCATGCCTAAGT
TCACAGATAAAACAGGTGGGACAAACAGAAGATTATTAATTGTTCCATTCAATGCTGATTTTAATGATTCAAATGAAAAT
GTTGATATTAAAGAAAAATATCTTAAAGATAATCATGTACTTGAATATGTGTTGTATAAAGCGATTAATTTAGAATTTGA
TAGGTTTACAATTCCTCAAGTATCTAAAAAAATGCTAGAAATATACAAACAAGATAATGATTCGGTTTATGATTTCAAAA
TTGAAGAATTTGATCAATGGAATATTCAAAAAGTACCTAAGAAAGTTGTTTATTACAGGTATAGAGCATTCTGTGAAGAA
AATGGATATATGGGAAAAATGTCAGACAGAACATTTTATAGACGATTTGAGAAGTACTTAGGAAAAGAATGGAATACGGA
TGCTAAATGTAGATATTCAAGTATCGATGAATTAGAAGAAATTGTAGGATATATCAATAGAACATTAATGCCATTTGGAC
AACAGCATAGATCATATAAAAATGAAAATTTAAAAATAGTGTGA

Protein sequence :
MAIKKKDRIIGVKELEIPQELKLVPNWVLWRAEWNEKQQNYGKVPYSINGYRASTTNKKTWCDFESVSIEYEVDEQYSGI
GFVLSDGNNFVCLDIDNAIDEKGQINSELALKMMRLTYCEKSPSGTGLHCFFKGKLPDNRKKKRTDLDIELYDSARFMTV
TGCTIGQNDICDNQEVLNTLVDEYFKENLPVNDVVREESNTNMQLSDEDIINIMMKSKQKDKIKDLLQGTYESYFESSSE
AVQSLLHYLAFYTGKNKQQMERIFLNYNNLTDKWESKRGNTTWGQLELDKAIKNQKTIYTKSIDEFNVIPQGSKDVKQLL
NQLGHEERTKMEENWIEEGKRGRKPTTISPIKCAYILNEHLTFILFDDEENTKLAMYQFDEGIYTQNTTIIKRVISYLEP
KHNSNKADEVIYHLTNMVDIKEKTNSPYLIPVKNGVFNRKTKQLESFTPDYIFTTKISTKYNPNVVRPNLNGWDFDHWLY
EIACADKEIVTLLWEVINDSMNGNYTRKKAIFFVGDGNNGKGTFQELISNLVGYKNVASLKVNEFDHEFKLSVLEGKAVV
IGDDVPVGINIEDSSNFKSVVTGDSVLVNVKNKQPYRTEFRCTVIQSTNGMPKFTDKTGGTNRRLLIVPFNADFNDSNEN
VDIKEKYLKDNHVLEYVLYKAINLEFDRFTIPQVSKKMLEIYKQDNDSVYDFKIEEFDQWNIQKVPKKVVYYRYRAFCEE
NGYMGKMSDRTFYRRFEKYLGKEWNTDAKCRYSSIDELEEIVGYINRTLMPFGQQHRSYKNENLKIV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAPIG0476 YP_005733286.1 putative primase Not tested SAPI-S0385 Protein 0.0 99
SAOV_0421 YP_005735937.1 putative DNA primase Not tested SaPI1 Protein 0.0 99
MW0751 NP_645568.1 putative primase Not tested vSa3 Protein 0.0 83
SAUSA300_0809 YP_493509.1 putative DNA primase Not tested SaPI5 Protein 0.0 83
SAOV_2058c YP_005737501.1 Putative DNA primase Not tested SaPI2 Protein 0.0 82