Name : B2904_orf256 (B2904_orf256) Accession : YP_006706361.1 Strain : Brachyspira pilosicoli B2904 Genome accession: NC_018607 Putative virulence/resistance : Virulence Product : PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 245635 - 246903 bp Length : 1269 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGTATTAAAATTTTTAGTTGACTTACTTAGCCAAGCTTCAATACTTGTAGCTTTATTTACTATGGTAGGTCTTATTCT ATTAAAAAAGCCTATTAATGAAATAATAGCAGGTTCTATGAAATCTTTAATAGGTTTTATTTTGCTTGGTGCTGGTGCTA CAGTTATTACAACTTCATTAGCTCCTTTTGGAAATATGGTAGAGGTTGCTTTTAATGTTCAAGGTGTTGTGCCAAATAAT GAGGCTATAGTATCTTTAGCATTAACAAAGTATGGTACTCAAGTTTCTATGGTTATGATACTTTCTATGATATTCCATAT AATCATAGCTAAATTCTCACCATTGAAATTTATATTCTTAACAGGTCACCATATATTCTACATGGGTGTAATGATTACAG TTATATTAGCAGTAGCAGGTTTAAGCGGTGTTACTCTTATAATAGCTGCTTCTTTAATAAATGCTCTTGCTATGAGTATT TCTCCTTTATTAAGCTATTGGGCTATGCCTAAAGTTATAGGAGACAGCACTAGTCAGGTTTCTTTAGGTCACTTCTCTAA TGTTACTTATAGTATTTCTGCTCTTATTGGTAAAATAGTGGGCGGAAATTCTCCTTCTGTTGAGGATTTAAAATTACCTA AAGGTTTAAGCTTCATGAGAGATAATATACTTGCTATAGCTTTAACTATGTCTATTATTTATATCATAGTTGCTATTGCT GCAGGAAGTGCTTATATAGAAAAAGAATTATCTAATGGTCAGAATTATTTAGTATTTGCTCTTATACAGGGTGTTACTTT TGCTGCTGGTGTTTCTGTTGTATTATCTGGTGTTAGAATGATATTAGGTGAAATTATCCCTGCTTTCAAAGGTATATCTG AAAAGATTGTTCCTAATGCTATACCTGCTTTGGATTGTCCTGTAGTATTCCCTTATGCTCCTAATGCTGTTTTAATAGGA TTTATTACAAGCTTTATAGGCGGATTAGTTGGTTTAGCTATACTTGGTGCTGTAGGCGGCGTTTTAATTATACCTGGTGT TGTACCGCATTTCTTTGTTGGTGCTACTGCTGGTGTATTTGGTAATGCTACTGGCGGAAGAAGAGGCTGTATTATAGGTT CTTTCATTAATGGTCTTCTTCTTGCTTTCCTTCCTATTATATTACTTCCTATACTTGGAGATTTAGGTTTCCAAAATACT ACTTTCAGCGATGCTGACTTTGTAGCTGTGGGCGGTATTATAGGATTTATCACTAGCTTGATAAAATAA Protein sequence : MVLKFLVDLLSQASILVALFTMVGLILLKKPINEIIAGSMKSLIGFILLGAGATVITTSLAPFGNMVEVAFNVQGVVPNN EAIVSLALTKYGTQVSMVMILSMIFHIIIAKFSPLKFIFLTGHHIFYMGVMITVILAVAGLSGVTLIIAASLINALAMSI SPLLSYWAMPKVIGDSTSQVSLGHFSNVTYSISALIGKIVGGNSPSVEDLKLPKGLSFMRDNILAIALTMSIIYIIVAIA AGSAYIEKELSNGQNYLVFALIQGVTFAAGVSVVLSGVRMILGEIIPAFKGISEKIVPNAIPALDCPVVFPYAPNAVLIG FITSFIGGLVGLAILGAVGGVLIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGCIIGSFINGLLLAFLPIILLPILGDLGFQNT TFSDADFVAVGGIIGFITSLIK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
ORF8 | AAK27335.1 | unknown | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 1e-84 | 54 |
unnamed | CAC39291.1 | hypothetical protein | Not tested | LPA | Protein | 9e-85 | 54 |
vpeC | ADD91725.1 | putative PTS system-specific IIC component VpeC | Virulence | PAI-I AL862 | Protein | 9e-85 | 54 |