Gene Information

Name : B2904_orf256 (B2904_orf256)
Accession : YP_006706361.1
Strain : Brachyspira pilosicoli B2904
Genome accession: NC_018607
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 245635 - 246903 bp
Length : 1269 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGTATTAAAATTTTTAGTTGACTTACTTAGCCAAGCTTCAATACTTGTAGCTTTATTTACTATGGTAGGTCTTATTCT
ATTAAAAAAGCCTATTAATGAAATAATAGCAGGTTCTATGAAATCTTTAATAGGTTTTATTTTGCTTGGTGCTGGTGCTA
CAGTTATTACAACTTCATTAGCTCCTTTTGGAAATATGGTAGAGGTTGCTTTTAATGTTCAAGGTGTTGTGCCAAATAAT
GAGGCTATAGTATCTTTAGCATTAACAAAGTATGGTACTCAAGTTTCTATGGTTATGATACTTTCTATGATATTCCATAT
AATCATAGCTAAATTCTCACCATTGAAATTTATATTCTTAACAGGTCACCATATATTCTACATGGGTGTAATGATTACAG
TTATATTAGCAGTAGCAGGTTTAAGCGGTGTTACTCTTATAATAGCTGCTTCTTTAATAAATGCTCTTGCTATGAGTATT
TCTCCTTTATTAAGCTATTGGGCTATGCCTAAAGTTATAGGAGACAGCACTAGTCAGGTTTCTTTAGGTCACTTCTCTAA
TGTTACTTATAGTATTTCTGCTCTTATTGGTAAAATAGTGGGCGGAAATTCTCCTTCTGTTGAGGATTTAAAATTACCTA
AAGGTTTAAGCTTCATGAGAGATAATATACTTGCTATAGCTTTAACTATGTCTATTATTTATATCATAGTTGCTATTGCT
GCAGGAAGTGCTTATATAGAAAAAGAATTATCTAATGGTCAGAATTATTTAGTATTTGCTCTTATACAGGGTGTTACTTT
TGCTGCTGGTGTTTCTGTTGTATTATCTGGTGTTAGAATGATATTAGGTGAAATTATCCCTGCTTTCAAAGGTATATCTG
AAAAGATTGTTCCTAATGCTATACCTGCTTTGGATTGTCCTGTAGTATTCCCTTATGCTCCTAATGCTGTTTTAATAGGA
TTTATTACAAGCTTTATAGGCGGATTAGTTGGTTTAGCTATACTTGGTGCTGTAGGCGGCGTTTTAATTATACCTGGTGT
TGTACCGCATTTCTTTGTTGGTGCTACTGCTGGTGTATTTGGTAATGCTACTGGCGGAAGAAGAGGCTGTATTATAGGTT
CTTTCATTAATGGTCTTCTTCTTGCTTTCCTTCCTATTATATTACTTCCTATACTTGGAGATTTAGGTTTCCAAAATACT
ACTTTCAGCGATGCTGACTTTGTAGCTGTGGGCGGTATTATAGGATTTATCACTAGCTTGATAAAATAA

Protein sequence :
MVLKFLVDLLSQASILVALFTMVGLILLKKPINEIIAGSMKSLIGFILLGAGATVITTSLAPFGNMVEVAFNVQGVVPNN
EAIVSLALTKYGTQVSMVMILSMIFHIIIAKFSPLKFIFLTGHHIFYMGVMITVILAVAGLSGVTLIIAASLINALAMSI
SPLLSYWAMPKVIGDSTSQVSLGHFSNVTYSISALIGKIVGGNSPSVEDLKLPKGLSFMRDNILAIALTMSIIYIIVAIA
AGSAYIEKELSNGQNYLVFALIQGVTFAAGVSVVLSGVRMILGEIIPAFKGISEKIVPNAIPALDCPVVFPYAPNAVLIG
FITSFIGGLVGLAILGAVGGVLIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGCIIGSFINGLLLAFLPIILLPILGDLGFQNT
TFSDADFVAVGGIIGFITSLIK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
ORF8 AAK27335.1 unknown Not tested PAI-I AL862 Protein 1e-84 54
unnamed CAC39291.1 hypothetical protein Not tested LPA Protein 9e-85 54
vpeC ADD91725.1 putative PTS system-specific IIC component VpeC Virulence PAI-I AL862 Protein 9e-85 54