Name : B2904_orf251 (B2904_orf251) Accession : YP_006706356.1 Strain : Brachyspira pilosicoli B2904 Genome accession: NC_018607 Putative virulence/resistance : Virulence Product : PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 241716 - 242987 bp Length : 1272 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATTACAGGAATATTAAATTTTATAGTTTATGATTTATTAGGTACTAGTTCTATATTAGTTGGTTTTATAGCTATGTT TGGTCTTATCTTACAAAAGAAGAAATGGGATAAGGTTGTAATCGGTACTATAAAAACAATAGTTGGATTTATAATTTTTA GTGCTGGTTCTTCTTTGGCAACTAGTTCATTAAATTCTTTCCAAACTTTATTTACAAAAGCATTTAATTTGGAAGGAGTA TTACCTTTAGCTGAAGCTGTTACAGCATTGGCTCAAAATAAATTTGGACCTATAGTTGCTTTAATAATGGTTACCGGTTT TATAGCTAATTTAATAATAGCTAGATTAACTCCATTTAAATACATATTTTTAACAGGTCAGCACAATTTATATTTAGCAG CACTTTTAACTGTAATATTTAAAGCAAACGGTGTATCTGATGGTCTTACTATAGGATTGGGAGCTATTATATTAGGAGCT TCTGCAGCATTATTCCCTGCTATAGCACAAAGAGGTATGAAGAAAATTACTGGTGAAAATGAAATAGCTATGGGACACTA TGTTACATTAGCTTATGCTTTATCATCTTTCATAGGTTCTAAAGTTGGTAAACCAGAAGACAGTACTGAAAAATTAAAAT TACCTTCTTGGCTTATGATATTTAAAGATTATGTTGTTTCAGTAGCTTTATCTGTTGCAGTGTTCTATTATATATCAGCA TTTATGGCTGGTAAAGCAGAAGTTGAGGCTTTATCTGGAAATGTTAGCTGGATATTATTCCCATTTTTACAATCATTATC ATTTGCAGCTTCATTATTTATAATTATCACTGGTGTAAGAATGGTATTAGGTGAAATAGTTTCTGCATTTGTTGGTATTT CTGAAAAACTTATTCCTAATGCAAAACCTGCTTTAGATTGTCCTGTAGTATTCCAGTATGCTCCTACTGCTACTGTTATA GGATTCTTATCTGCTTATATAGGCGGTTTATTATGTATACCTGTATTTATAGCTTTAAAAACACCTGTAATCATACCTGT TGCTGTTCCTTATTTCTTCATAGGTGCTACTGCTGGTGTATTTGGTAATGCTACAGGCGGTTGGAAAGGTGCTATTGCTG GAGGATTTATCACTGGTATACTTATAGCTGTTGGACCTGCTTTAATATACCCTATAATGAGTTCTATAGGTTTAACAGGT ACTTCTTTCCCAGAAACAGACTTTGTTAGTGTTGGTTTAATATTAAATGCTATATTAAGCATATTCAATTAA Protein sequence : MITGILNFIVYDLLGTSSILVGFIAMFGLILQKKKWDKVVIGTIKTIVGFIIFSAGSSLATSSLNSFQTLFTKAFNLEGV LPLAEAVTALAQNKFGPIVALIMVTGFIANLIIARLTPFKYIFLTGQHNLYLAALLTVIFKANGVSDGLTIGLGAIILGA SAALFPAIAQRGMKKITGENEIAMGHYVTLAYALSSFIGSKVGKPEDSTEKLKLPSWLMIFKDYVVSVALSVAVFYYISA FMAGKAEVEALSGNVSWILFPFLQSLSFAASLFIIITGVRMVLGEIVSAFVGISEKLIPNAKPALDCPVVFQYAPTATVI GFLSAYIGGLLCIPVFIALKTPVIIPVAVPYFFIGATAGVFGNATGGWKGAIAGGFITGILIAVGPALIYPIMSSIGLTG TSFPETDFVSVGLILNAILSIFN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
vpeC | ADD91725.1 | putative PTS system-specific IIC component VpeC | Virulence | PAI-I AL862 | Protein | 6e-91 | 46 |
ORF8 | AAK27335.1 | unknown | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 9e-91 | 46 |
unnamed | CAC39291.1 | hypothetical protein | Not tested | LPA | Protein | 6e-91 | 46 |