Gene Information

Name : B2904_orf251 (B2904_orf251)
Accession : YP_006706356.1
Strain : Brachyspira pilosicoli B2904
Genome accession: NC_018607
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 241716 - 242987 bp
Length : 1272 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGATTACAGGAATATTAAATTTTATAGTTTATGATTTATTAGGTACTAGTTCTATATTAGTTGGTTTTATAGCTATGTT
TGGTCTTATCTTACAAAAGAAGAAATGGGATAAGGTTGTAATCGGTACTATAAAAACAATAGTTGGATTTATAATTTTTA
GTGCTGGTTCTTCTTTGGCAACTAGTTCATTAAATTCTTTCCAAACTTTATTTACAAAAGCATTTAATTTGGAAGGAGTA
TTACCTTTAGCTGAAGCTGTTACAGCATTGGCTCAAAATAAATTTGGACCTATAGTTGCTTTAATAATGGTTACCGGTTT
TATAGCTAATTTAATAATAGCTAGATTAACTCCATTTAAATACATATTTTTAACAGGTCAGCACAATTTATATTTAGCAG
CACTTTTAACTGTAATATTTAAAGCAAACGGTGTATCTGATGGTCTTACTATAGGATTGGGAGCTATTATATTAGGAGCT
TCTGCAGCATTATTCCCTGCTATAGCACAAAGAGGTATGAAGAAAATTACTGGTGAAAATGAAATAGCTATGGGACACTA
TGTTACATTAGCTTATGCTTTATCATCTTTCATAGGTTCTAAAGTTGGTAAACCAGAAGACAGTACTGAAAAATTAAAAT
TACCTTCTTGGCTTATGATATTTAAAGATTATGTTGTTTCAGTAGCTTTATCTGTTGCAGTGTTCTATTATATATCAGCA
TTTATGGCTGGTAAAGCAGAAGTTGAGGCTTTATCTGGAAATGTTAGCTGGATATTATTCCCATTTTTACAATCATTATC
ATTTGCAGCTTCATTATTTATAATTATCACTGGTGTAAGAATGGTATTAGGTGAAATAGTTTCTGCATTTGTTGGTATTT
CTGAAAAACTTATTCCTAATGCAAAACCTGCTTTAGATTGTCCTGTAGTATTCCAGTATGCTCCTACTGCTACTGTTATA
GGATTCTTATCTGCTTATATAGGCGGTTTATTATGTATACCTGTATTTATAGCTTTAAAAACACCTGTAATCATACCTGT
TGCTGTTCCTTATTTCTTCATAGGTGCTACTGCTGGTGTATTTGGTAATGCTACAGGCGGTTGGAAAGGTGCTATTGCTG
GAGGATTTATCACTGGTATACTTATAGCTGTTGGACCTGCTTTAATATACCCTATAATGAGTTCTATAGGTTTAACAGGT
ACTTCTTTCCCAGAAACAGACTTTGTTAGTGTTGGTTTAATATTAAATGCTATATTAAGCATATTCAATTAA

Protein sequence :
MITGILNFIVYDLLGTSSILVGFIAMFGLILQKKKWDKVVIGTIKTIVGFIIFSAGSSLATSSLNSFQTLFTKAFNLEGV
LPLAEAVTALAQNKFGPIVALIMVTGFIANLIIARLTPFKYIFLTGQHNLYLAALLTVIFKANGVSDGLTIGLGAIILGA
SAALFPAIAQRGMKKITGENEIAMGHYVTLAYALSSFIGSKVGKPEDSTEKLKLPSWLMIFKDYVVSVALSVAVFYYISA
FMAGKAEVEALSGNVSWILFPFLQSLSFAASLFIIITGVRMVLGEIVSAFVGISEKLIPNAKPALDCPVVFQYAPTATVI
GFLSAYIGGLLCIPVFIALKTPVIIPVAVPYFFIGATAGVFGNATGGWKGAIAGGFITGILIAVGPALIYPIMSSIGLTG
TSFPETDFVSVGLILNAILSIFN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
vpeC ADD91725.1 putative PTS system-specific IIC component VpeC Virulence PAI-I AL862 Protein 6e-91 46
ORF8 AAK27335.1 unknown Not tested PAI-I AL862 Protein 9e-91 46
unnamed CAC39291.1 hypothetical protein Not tested LPA Protein 6e-91 46